Xrn2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Xrn2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18000

品系全称

C57BL/6JCya-Xrn2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-24128-Xrn2-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Xrn2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18000) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
5'-3' exoribonuclease 2
基因别称
-
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_011917 | Ensembl: ENSMUST00000028921
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 5~6
敲除长度
~0.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Xrn2(也称为Rat1或Rai1)是一种保守的5'→3'外切核酸酶,在真核生物中广泛存在。它主要定位在细胞核中,并参与多种RNA代谢过程,包括转录终止、核糖体生物发生和RNA降解。Xrn2具有有限的底物特异性,但在细胞中通过与其他蛋白质的相互作用,它可以靶向特定的RNA分子进行降解或修剪。这些蛋白质具有一个进化上保守的XRN2结合结构域(XTBD),它们可以调节Xrn2的活性、稳定性和亚细胞定位,从而影响RNA代谢过程[3]。

Xrn2在转录终止中起着至关重要的作用。在酵母中,Xrn2与Rat1-Rai1外切核酸酶复合物一起,通过降解RNA分子来促进RNA聚合酶II的转录终止。Xrn2可以识别特定的RNA序列,并在这些序列上切割RNA,从而引发转录终止。此外,Xrn2还可以与Spt4-Spt5延长因子(DSIF)相互作用,抑制转录终止,从而调节RNA的转录水平[2]。

除了转录终止外,Xrn2还参与DNA损伤反应。研究发现,Xrn2在DNA损伤诱导下发生核内重定位,与53BP1和R环结构共定位。Xrn2的缺失会导致R环结构的增加,基因组不稳定,复制应激和DNA双链断裂(DSB)的增加。此外,Xrn2的缺失还会导致细胞对各种DNA损伤剂的高度敏感性。这些结果表明,Xrn2在R环结构的解析、复制应激的抑制和基因组稳定性的维持中发挥着重要作用[4]。

Xrn2还参与RNA的3'端加工过程。研究发现,Xrn2被招募到基因的3'端,并在那里进行有限的5'→3'修剪。Xrn2的活性受到CPSF73蛋白的调控,CPSF73在polyA位点切割RNA后,将Xrn2转移到RNA的5'端进行降解。此外,Xrn2还参与tRNA的3'端加工,通过cotranscriptional RNase Z切割生成新的Xrn2底物。Xrn2的缺失会导致RNA聚合酶II的转录在3'端过早终止,这表明Xrn2在RNA聚合酶II转录终止中起着关键作用[5]。

Xrn2还与RNA结合蛋白Sam68相互作用,共同调节选择性多腺苷酸化(APA)。Sam68通过竞争性结合polyA位点附近的强多腺苷酸化信号,促进使用次优的近端多腺苷酸化信号,导致3'非编码区缩短。这种机制与细胞周期进程有关,并可能成为治疗前列腺癌的潜在靶点[6]。

PAXT-1是一种 previously uncharacterized protein,它通过一个保守的域稳定Xrn2,并促进其活性。PAXT-1与Xrn2相互作用,并通过其DUF3469结构域稳定Xrn2。PAXT-1的缺失会导致Xrn2水平的降低,miRNA周转活性的减少,以及蠕虫的死亡。因此,PAXT-1在维持Xrn2的稳定性和活性中起着重要作用[7]。

综上所述,Xrn2是一种重要的5'→3'外切核酸酶,在RNA代谢过程中发挥着多种作用。它参与转录终止、DNA损伤反应、RNA的3'端加工和选择性多腺苷酸化等过程。Xrn2的活性受到多种蛋白质的调控,包括PAXT-1、Sam68和hnRNPK等。Xrn2的研究有助于深入理解RNA代谢的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1][2][3][4][5][6][7]。

参考文献:
1. Miki, Takashi S, Carl, Sarah H, Stadler, Michael B, Großhans, Helge. 2016. XRN2 Autoregulation and Control of Polycistronic Gene Expresssion in Caenorhabditis elegans. In PLoS genetics, 12, e1006313. doi:10.1371/journal.pgen.1006313. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27631780/
2. Han, Zhong, Moore, George A, Mitter, Richard, Rueda, David S, Svejstrup, Jesper Q. 2023. DNA-directed termination of RNA polymerase II transcription. In Molecular cell, 83, 3253-3267.e7. doi:10.1016/j.molcel.2023.08.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37683646/
3. Aygün, Ilkin, Miki, Takashi S. 2021. Nuclear RNA Regulation by XRN2 and XTBD Family Proteins. In Cell structure and function, 46, 73-78. doi:10.1247/csf.21041. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34483148/
4. Morales, Julio C, Richard, Patricia, Patidar, Praveen L, Manley, James L, Boothman, David A. 2016. XRN2 Links Transcription Termination to DNA Damage and Replication Stress. In PLoS genetics, 12, e1006107. doi:10.1371/journal.pgen.1006107. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27437695/
5. Cortazar, Michael A, Erickson, Benjamin, Fong, Nova, Ntini, Evgenia, Bentley, David L. 2022. Xrn2 substrate mapping identifies torpedo loading sites and extensive premature termination of RNA pol II transcription. In Genes & development, 36, 1062-1078. doi:10.1101/gad.350004.122. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36396340/
6. Pieraccioli, Marco, Caggiano, Cinzia, Mignini, Luca, Sette, Claudio, Bielli, Pamela. 2022. The transcriptional terminator XRN2 and the RNA-binding protein Sam68 link alternative polyadenylation to cell cycle progression in prostate cancer. In Nature structural & molecular biology, 29, 1101-1112. doi:10.1038/s41594-022-00853-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36344846/
7. Miki, Takashi S, Richter, Hannes, Rüegger, Stefan, Großhans, Helge. . PAXT-1 promotes XRN2 activity by stabilizing it through a conserved domain. In Molecular cell, 53, 351-60. doi:10.1016/j.molcel.2014.01.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24462208/