Snrk-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Snrk-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-17986

品系全称

C57BL/6JCya-Snrkem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-20623-Snrk-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Snrk-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-17986) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SNF related kinase
基因别称
2010012F07Rik,E030034B15,mKIAA0096
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_133741 | Ensembl: ENSMUST00000118886
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~1.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:108104Mice homozygous for a knock-out allele exhibit neonatal lethality with enlarged left ventricle and altered lipid levels.
SnRK(Sucrose Nonfermenting 1-Related Kinase)是一类重要的Ser/Thr蛋白激酶,在植物中发挥着关键的生物学功能。SnRK家族成员在植物的生长、发育和适应环境变化等方面发挥着重要作用,包括调节植物对生物和非生物胁迫的响应。

SnRK家族成员可以调节植物的中心代谢,从而决定植物在生存或生长/发育过程中的能量分布。SnRK家族成员通过磷酸化下游基因来发挥调节作用,这可以诱导或抑制靶蛋白的功能。这一机制对于维持植物中不同的形态、生理和生化过程至关重要,包括钾信号传导、活性氧(ROS)稳态、糖信号传导和能量稳态。此外,SnRK介导的磷酸化位点与不同的靶标相关,研究表明SnRK介导的磷酸化是一种位点特异性事件,其中靶标包含特定的氨基酸序列,包括RXXS/T、丝氨酸-苏氨酸富集区域或AMPK/SNF1类型。

在植物中,SnRK家族成员可以响应多种非生物胁迫,如干旱、盐胁迫、低温和高温等。例如,在耐盐植物Eucalyptus grandis中,SnRK基因家族成员对盐胁迫的响应已被研究。通过对E. grandis基因组中SnRK基因家族的全面分析,发现34个SnRK基因被分为三个亚家族(SnRK1、SnRK2和SnRK3)。染色体定位分析表明,SnRK家族成员在10条染色体上不均匀分布。基因结构分析表明,24个SnRK3基因中有10个不包含内含子。此外,保守基序分析表明,SnRK序列属于同一亚家族,并包含相同类型的基序。这些研究结果为理解SnRK基因家族在植物耐盐胁迫中的作用提供了重要的信息[1]。

SnRK基因家族成员还可以响应激素信号。例如,在植物激素脱落酸(ABA)的信号传导过程中,SnRK家族成员发挥着重要作用。ABA信号通路是植物对非生物胁迫响应的核心调节器,能够触发基因表达和生理适应性反应。ABA诱导SnRK家族蛋白激酶的激活,从而介导一系列响应。此外,丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联反应也被发现参与ABA信号传导。这些研究表明,SnRK家族成员在ABA信号传导中发挥着关键的作用,并且与MAPK级联反应相互作用[2]。

此外,SnRK基因家族成员还参与植物与微生物的共生关系。例如,在豆科植物Phaseolus vulgaris中,SnRK基因家族成员在根瘤菌和菌根共生中发挥着重要作用。通过全基因组分析和转录组分析,研究人员发现了42个PvSnRK基因,并将其分为三个亚家族(PvSnRK1、PvSnRK2和PvSnRK3)。这些基因在共生条件下表现出不同的表达模式,并且与共生相关的基因存在直接和间接的相互作用。这些研究结果为理解SnRK基因家族在植物共生中的作用提供了重要的线索[3]。

除了在植物中发挥作用外,SnRK基因家族成员还在动物中发挥作用。例如,在Snrk基因敲除小鼠中,视网膜血管生成和缺血后新生血管形成受到抑制。这些研究表明,SnRK基因家族成员在动物体内血管生成中发挥着重要作用[4]。

综上所述,SnRK基因家族在植物和动物中发挥着重要的生物学功能。SnRK家族成员通过调节植物的中心代谢、响应非生物胁迫、参与激素信号传导和影响共生关系等方面发挥着重要作用。此外,SnRK基因家族成员还在动物体内血管生成中发挥着重要作用。SnRK基因家族的研究对于深入理解植物和动物的生长、发育和适应环境变化等方面的生物学机制具有重要意义,并为植物和动物相关领域的研究提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Wang, Yujiao, Yan, Huifang, Qiu, Zhenfei, Zhong, Chonglu, Fan, Chunjie. 2019. Comprehensive Analysis of SnRK Gene Family and their Responses to Salt Stress in Eucalyptus grandis. In International journal of molecular sciences, 20, . doi:10.3390/ijms20112786. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31174407/
2. Danquah, Agyemang, de Zelicourt, Axel, Colcombet, Jean, Hirt, Heribert. 2013. The role of ABA and MAPK signaling pathways in plant abiotic stress responses. In Biotechnology advances, 32, 40-52. doi:10.1016/j.biotechadv.2013.09.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24091291/
3. Cervera-Torres, Carolina, Arthikala, Manoj-Kumar, Lara, Miguel, Blanco, Lourdes, Nanjareddy, Kalpana. 2022. Comprehensive Analysis of Phaseolus vulgaris SnRK Gene Family and Their Expression during Rhizobial and Mycorrhizal Symbiosis. In Genes, 13, . doi:10.3390/genes13112107. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36421782/
4. Lu, Qiulun, Xie, Zhonglin, Yan, Chenghui, Ramchandran, Ramani, Zou, Ming-Hui. 2017. SNRK (Sucrose Nonfermenting 1-Related Kinase) Promotes Angiogenesis In Vivo. In Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology, 38, 373-385. doi:10.1161/ATVBAHA.117.309834. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29242271/