Synpo2l-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Synpo2l-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-17968

品系全称

C57BL/6JCya-Synpo2lem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-68760-Synpo2l-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Synpo2l-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-17968) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
synaptopodin 2-like
基因别称
1110054M18Rik,Chap
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001310431 | Ensembl: ENSMUST00000117386
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~3.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
SYNPO2L(synaptopodin 2-like)是一种重要的基因,它在心脏肌细胞的结构发育和功能中扮演着关键角色。SYNPO2L基因位于人类染色体10上,编码一种与心脏肌细胞结构相关的蛋白,参与维持心脏的正常功能。该基因的突变或表达异常可能导致心脏疾病,如房颤(AF)和心力衰竭(HF)。

在房颤的研究中,多项全基因组关联研究(GWAS)已经确定了多个与房颤相关的基因位点。然而,驱动这些关联的基因及其如何参与房颤的发病机制尚不清楚。为了确定可能驱动这些关联的基因,研究人员在FinnGen研究中寻找了预测会导致功能丧失的罕见遗传变异。他们发现SYNPO2L基因中的一个特定剪接位点变异与房颤风险增加相关,该变异的比值比为3.5,p值为9.9×10^-8[1]。这些发现支持了房颤可以表现为心房心肌病的观点。

此外,基因组关联和孟德尔随机化分析为心力衰竭的发病机制提供了见解。这些研究表明,12个独立的基因变异与心力衰竭相关,其中包括SYNPO2L基因。这些变异与冠状动脉疾病、房颤或左心室功能减退相关,表明心力衰竭可能与这些疾病共享遗传病因[2]。

SYNPO2L基因在癌症转移中也发挥着重要作用。研究发现,METTL16基因可以调节SYNPO2L mRNA的稳定性,并通过分泌COL10A1和吸引肿瘤相关成纤维细胞来促进肿瘤细胞的上皮-间质转化(EMT),从而增加肿瘤的远处转移能力[3]。

在研究房颤易感基因位点的转录组学研究中,研究人员发现SYNPO2L基因的转录本异构体与房颤易感基因位点相关。他们还发现,该基因位点的风险等位基因与MYOZ1表达减少和两个SYNPO2L长链非编码RNA(lncRNA)异构体表达增加相关[4]。

此外,对人类左心房组织的表观遗传分析揭示了与房颤相关的基因网络。研究结果表明,房颤和PR间期心电图特征的全基因组关联研究位点与长距离染色质构象数据相互作用,确定了由NKX2-5、TBX3、ZFHX3和SYNPO2L基因主导的基因相互作用网络[5]。

基因组方法的研究表明,SYNPO2L基因与房颤和心力衰竭的易感性相关。研究发现,SYNPO2L基因在房颤和心力衰竭中均有涉及,并且与其他基因如TTN、MTSS1、SCN5A、PITX2、KLHL3和AGAP5相关[6]。

此外,全基因组关联研究也发现了与血压调节相关的新型基因位点。其中,rs1055144(位于7p15.2)是SYNPO2L基因中的一个新型血压相关变异[7]。

总之,SYNPO2L基因在心脏结构和功能、房颤、心力衰竭和癌症转移中发挥着重要作用。该基因的突变或表达异常可能导致心脏疾病和肿瘤的发生。进一步研究SYNPO2L基因的生物学功能和分子机制,有助于深入理解这些疾病的发生机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Clausen, Alexander Guldmann, Vad, Oliver Bundgaard, Andersen, Julie Husted, Olesen, Morten Salling. 2021. Loss-of-Function Variants in the SYNPO2L Gene Are Associated With Atrial Fibrillation. In Frontiers in cardiovascular medicine, 8, 650667. doi:10.3389/fcvm.2021.650667. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33768119/
2. Shah, Sonia, Henry, Albert, Roselli, Carolina, Swerdlow, Daniel I, Lumbers, R Thomas. 2020. Genome-wide association and Mendelian randomisation analysis provide insights into the pathogenesis of heart failure. In Nature communications, 11, 163. doi:10.1038/s41467-019-13690-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31919418/
3. Wu, Jianlong, Ouyang, Peng, Huang, Rui, Wu, Wang, Li, Jian. 2024. METTL16 Promotes Stability of SYNPO2L mRNA and leading to Cancer Cell Lung Metastasis by Secretion of COL10A1 and attract the Cancer-Associated Fibroblasts. In International journal of biological sciences, 20, 4128-4145. doi:10.7150/ijbs.95375. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39247832/
4. Wass, Sojin Y, Sun, Han, Tchou, Gregory, Barnard, John, Smith, Jonathan D. 2024. Transcriptomic Insights into the Atrial Fibrillation Susceptibility Locus near the MYOZ1 and SYNPO2L Genes. In International journal of molecular sciences, 25, . doi:10.3390/ijms251910309. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39408638/
5. Hall, Amelia Weber, Chaffin, Mark, Roselli, Carolina, Tucker, Nathan R, Ellinor, Patrick T. 2020. Epigenetic Analyses of Human Left Atrial Tissue Identifies Gene Networks Underlying Atrial Fibrillation. In Circulation. Genomic and precision medicine, 13, e003085. doi:10.1161/CIRCGEN.120.003085. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33155827/
6. Patel, Kush Ketan, Venkatesan, Cynthia, Abdelhalim, Habiba, Linna-Kuosmanen, Suvi, Ahmed, Zeeshan. 2023. Genomic approaches to identify and investigate genes associated with atrial fibrillation and heart failure susceptibility. In Human genomics, 17, 47. doi:10.1186/s40246-023-00498-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37270590/
7. Kraja, Aldi T, Cook, James P, Warren, Helen R, Munroe, Patricia B, Howson, Joanna M M. . New Blood Pressure-Associated Loci Identified in Meta-Analyses of 475 000 Individuals. In Circulation. Cardiovascular genetics, 10, . doi:10.1161/CIRCGENETICS.117.001778. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29030403/