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Trim6-KO 基因敲除小鼠
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基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
tripartite motif-containing 6
基因别称
C430046K18Rik，D7Ertd684e
染色体号
Chr 7 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_001013616 | Ensembl: ENSMUST00000098180
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~2.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2137352Bone marrow-derived dendritic cells and MEFs from homozygous null mice show attenuated recombinant Ebola virus replication.
TRIM6，即三重基序包含蛋白6，属于TRIM（Tripartite Motif）蛋白家族，是一种E3泛素连接酶。TRIM蛋白家族成员在细胞内具有多种功能，包括参与信号转导、调节细胞周期、调节免疫应答和病毒感染等过程。TRIM6含有两个重要的结构域：一个RING结构域和一个B-box结构域，这些结构域对TRIM蛋白的功能至关重要，如促进蛋白质的泛素化，从而调节其稳定性和活性。
TRIM6在多种肿瘤中表现出异常表达，包括胶质瘤、乳腺癌和肺癌等。在胶质瘤中，TRIM6的表达水平显著升高，并与患者的不良预后相关。研究发现，TRIM6的过表达促进了胶质瘤细胞的增殖、侵袭和迁移，而敲低TRIM6的表达则抑制了这些过程。此外，TRIM6的表达还与免疫细胞的浸润相关，TRIM6高表达与固有免疫细胞丰度呈正相关，而与适应性免疫细胞丰度呈负相关，这提示TRIM6可能通过调节免疫微环境影响胶质瘤的进展[1]。
在病毒感染方面，TRIM6被发现与SARS-CoV-2病毒的复制有关。TRIM6作为E3泛素连接酶，可以催化SARS-CoV-2的核衣壳蛋白（NP）的K29型泛素化，增强其与病毒基因组RNA的结合能力，从而促进病毒的复制。研究还发现，TRIM6可以泛素化冠状病毒的NP蛋白，这表明TRIM6可能是广谱抗冠状病毒的潜在靶点[2]。
在乳腺癌中，TRIM6的表达水平也显著升高，并且与乳腺癌的进展相关。TRIM6通过促进STUB1蛋白的泛素化降解，进而上调YAP1（Yes-associated Protein 1）的表达，从而促进乳腺癌细胞的生长和迁移。敲低TRIM6的表达则抑制了乳腺癌细胞的生长和迁移，这提示TRIM6可能成为乳腺癌治疗的新靶点[3]。
TRIM6的表达还与缺血性脑卒中相关。研究发现，缺血性脑卒中患者中TRIM6基因的DNA甲基化水平升高，这提示TRIM6可能参与缺血性脑卒中的发生发展。进一步的研究表明，TRIM6可能通过调节内皮细胞的粘附和动脉粥样硬化影响缺血性脑卒中的发生[4]。
TRIM6还参与抗病毒免疫反应的调节。研究发现，TRIM6在I型干扰素（IFN-I）的诱导和信号转导中发挥重要作用。在TRIM6敲除细胞中，IFN-I诱导和信号转导受损，导致干扰素敏感病毒如西尼罗病毒的复制增加。此外，TRIM6还与VAMP8蛋白相互作用，共同调节IFN-I信号通路，从而影响抗病毒免疫反应[5]。
TRIM6的表达还与肺腺癌的预后相关。研究发现，肺腺癌组织中TRIM6的表达水平显著升高，并且与患者的不良预后相关。TRIM6可能通过调节同源重组、卵母细胞减数分裂和泛素介导的蛋白质降解等途径影响肺腺癌的进展[6]。
TRIM6还可以与MYC蛋白相互作用，调节小鼠胚胎干细胞的多能性维持。TRIM6通过与MYC蛋白结合，抑制其转录活性，从而抑制小鼠胚胎干细胞的分化。敲低TRIM6的表达则增强MYC的转录活性，并促进小鼠胚胎干细胞的分化[7]。
TRIM6还参与IFN-I信号通路中IKKε激酶的激活。TRIM6与IKKε蛋白相互作用，促进IKKε依赖的IFN-I刺激基因（ISGs）的表达。TRIM6与E2泛素偶联酶UbE2K合作合成无锚定的K48型泛素链，从而激活IKKε激酶，促进STAT1的磷酸化[8]。
此外，TRIM6的表达还受到肌肉特异性microRNA-1（miR-1）的调节。研究发现，肌肉细胞中miR-1通过外泌体转移到脂肪组织，并下调脂肪组织中TRIM6的表达，从而调节脂肪组织的脂解途径[9]。
最后，TRIM6在蝙蝠中的进化过程也受到研究。研究发现，TRIM5和TRIM22基因在蝙蝠中经历了复杂的复制过程，这可能与蝙蝠作为病毒宿主的角色有关[10]。
综上所述，TRIM6在多种生物学过程中发挥重要作用，包括肿瘤发生发展、病毒感染、免疫应答和干细胞多能性维持等。TRIM6的异常表达与多种疾病相关，如胶质瘤、乳腺癌、肺腺癌和缺血性脑卒中等。此外，TRIM6还参与调节免疫应答和病毒感染，如SARS-CoV-2病毒的复制。TRIM6的研究有助于深入理解其在生物学过程中的功能，并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Guo, Jianrong, Feng, Shoucheng, Liu, Hong, Long, Hao, Qiu, Haibo. 2023. TRIM6: An Upregulated Biomarker with Prognostic Significance and Immune Correlations in Gliomas. In Biomolecules, 13, . doi:10.3390/biom13091298. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37759698/
2. Zhou, Jian, Zhou, Yuzheng, Wei, Xia-Fei, Xu, Gang, Zhang, Zheng. . TRIM6 facilitates SARS-CoV-2 proliferation by catalyzing the K29-typed ubiquitination of NP to enhance the ability to bind viral genomes. In Journal of medical virology, 96, e29531. doi:10.1002/jmv.29531. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38515377/
3. Wei, Chuanchao, Wu, Jiayue, Liu, Weiyan, Li, Hongchang, Hai, Benjun. 2021. Tripartite motif-containing protein 6 facilitates growth and migration of breast cancer through degradation of STUB1. In European journal of histochemistry : EJH, 65, . doi:10.4081/ejh.2021.3214. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33728863/
4. Peng, Hao, Palma-Gudiel, Helena, Soriano-Tarraga, Carolina, Zhang, Yonghong, Zhao, Jinying. 2023. Epigenome-wide association study identifies novel genes associated with ischemic stroke. In Clinical epigenetics, 15, 106. doi:10.1186/s13148-023-01520-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37370144/
5. van Tol, Sarah, Atkins, Colm, Bharaj, Preeti, Freiberg, Alexander N, Rajsbaum, Ricardo. 2020. VAMP8 Contributes to the TRIM6-Mediated Type I Interferon Antiviral Response during West Nile Virus Infection. In Journal of virology, 94, . doi:10.1128/JVI.01454-19. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31694946/
6. Ding, Dong-Xiao, Li, Qiao, Shi, Ke, Guo, Qiang, Zhang, Yun-Qiang. . LncRNA NEAT1-miR-101-3p/miR-335-5p/miR-374a-3p/miR-628-5p-TRIM6 axis identified as the prognostic biomarker for lung adenocarcinoma via bioinformatics and meta-analysis. In Translational cancer research, 10, 4870-4883. doi:10.21037/tcr-21-2181. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35116339/
7. Sato, Tomonobu, Okumura, Fumihiko, Ariga, Tadashi, Hatakeyama, Shigetsugu. 2012. TRIM6 interacts with Myc and maintains the pluripotency of mouse embryonic stem cells. In Journal of cell science, 125, 1544-55. doi:10.1242/jcs.095273. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22328504/
8. Rajsbaum, Ricardo, Versteeg, Gijs A, Schmid, Sonja, tenOever, Benjamin R, García-Sastre, Adolfo. 2014. Unanchored K48-linked polyubiquitin synthesized by the E3-ubiquitin ligase TRIM6 stimulates the interferon-IKKε kinase-mediated antiviral response. In Immunity, 40, 880-95. doi:10.1016/j.immuni.2014.04.018. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24882218/
9. Burke, Benjamin I, Ismaeel, Ahmed, Long, Douglas E, McCarthy, John J, Wen, Yuan. 2024. Extracellular vesicle transfer of miR-1 to adipose tissue modifies lipolytic pathways following resistance exercise. In JCI insight, 9, . doi:10.1172/jci.insight.182589. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39316445/
10. Fernandes, Alexandre P, Águeda-Pinto, Ana, Pinheiro, Ana, Rebelo, Hugo, Esteves, Pedro J. 2022. Evolution of TRIM5 and TRIM22 in Bats Reveals a Complex Duplication Process. In Viruses, 14, . doi:10.3390/v14020345. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35215944/
| 精子检测 | ① 冷冻前验证精子活力观察 ② 冷冻验证每批次进行复苏验证 | 交付状态 | 活体/精子 |
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