Trappc8-KO 基因敲除小鼠

TRAPPC8，也称为运输蛋白颗粒复合体亚基8，是一种重要的细胞内蛋白质。TRAPPC8属于TRAPP（运输蛋白颗粒复合体）家族，这是一个多亚基的蛋白质复合体，参与内质网（ER）到高尔基体的运输过程。TRAPPC8在细胞内起着关键的作用，它参与了多种生物学过程，包括病毒的感染、胶原的组装和分泌、以及自噬体的形成等。

TRAPPC8在人类乳头瘤病毒（HPV）的细胞进入过程中发挥着重要的作用。研究发现，TRAPPC8与HPV的L2蛋白特异性结合，TRAPPC8的敲低会导致HeLa细胞对HPV51Ma、HPV16和HPV31假病毒（PsV）的敏感性降低。在HaCaT细胞中，TRAPPC8的敲低也会降低其对HPV31病毒粒子的易感性，这表明TRAPPC8在HPV的天然感染中起着至关重要的作用。免疫荧光显微镜显示，TRAPPC8的中心区域在细胞表面暴露，并与接种的PsVs共定位。在TRAPPC8敲低的HeLa细胞中，Ma、Nu和缺乏L2的PsVs进入细胞的能力都受到了损害，这表明TRAPPC8依赖的内吞作用在HPV进入过程中起着重要作用，并且不依赖于L2的相互作用。此外，表达与TRAPPC8相互作用的GFP融合L2蛋白导致HeLa细胞高尔基体结构的分散，这与TRAPPC8敲低时的表型相同。这些结果表明，在病毒细胞内转运过程中，L2与TRAPPC8的结合抑制了其功能，导致高尔基体不稳定，这一过程可能有助于HPV基因组从高尔基体网络中逃逸[1]。

TRAPPC8也参与了细胞器如中心体的靶向定位。研究使用新一代技术分析了细胞器和中心体的蛋白质组成，并确定了大量候选的细胞器或中心体相关蛋白。通过构建编码全长（FL）或截断版本的ASH（ASPM、SPD-2、Hydin）结构域包含蛋白TRAPPC8、TRAPPC13、NPHP4和DLEC1的质粒，并在培养的人类端粒酶永生化视网膜色素上皮（hTERT-RPE1）细胞中进行表达和定量免疫荧光显微镜（IFM）分析，研究者发现TRAPPC13和NPHP4在初级纤毛的底部高度富集，而DLEC1似乎与运动纤毛特异性结合。对于TRAPPC8的结果是不确定的，因为表位标记的TRAPPC8融合蛋白在细胞中不稳定/降解，强调了将IFM分析与蛋白质印迹相结合的必要性[2]。

TRAPPC8在胶原蛋白的细胞内组装和分泌过程中也发挥着重要的作用。研究发现，人类TMEM131的氨基末端含有细菌PapD伴侣样结构域，这些结构域招募未成熟的胶原蛋白单体以进行适当的组装和分泌。TMEM131的羧基末端与TRAPPC8相互作用，TRAPPC8是TRAPP连接复合体的一个组成部分，负责将胶原蛋白货物从ER运输到高尔基体。研究者提供了证据表明，TMEM131在胶原蛋白招募和分泌中的作用在秀丽隐杆线虫、果蝇和人类中是进化上保守的[3]。

此外，TRAPPC8在前列腺癌（PC）的预后预测中也发挥着重要的作用。研究者建立了一个基于转录因子的风险模型来预测PC的预后和潜在的药物。该研究使用RNA测序数据和TCGA数据集，通过单变量Cox分析和Kdmist聚类方法筛选出与PC患者总生存率相关的145个基因。然后使用支持向量机-递归特征消除方法确定与转录因子类型相关的基因，并筛选出与预后相关的关键基因。进一步使用Lasso建立模型，并使用GO和KEGG进行功能分析。结果显示，TRAPPC8在预后高风险评分组中的表达高于低风险评分组，这表明TRAPPC8可能与PC的预后相关[4]。

TRAPPC8在自噬体的形成过程中也发挥着重要的作用。研究者发现，Atg9A是哺乳动物中唯一的多跨膜蛋白，其N-和C-末端结构域都暴露在细胞质中。在营养充足的情况下，Atg9A通过高尔基体和内体系统运输，并在自噬诱导时短暂地定位到自噬体上。然而，Atg9A运输对自噬体形成的意义尚不清楚。研究发现，Atg9A的N-末端细胞质结构域中的分选基序与适配蛋白AP-2相互作用。Atg9A中分选基序的突变无法执行自噬，并在回收内体中异常积累。在TRAPPC8敲低的细胞中也发现了自噬缺陷和Atg9A在回收内体中的积累。这些结果表明，Atg9A通过回收内体的运输是自噬体形成的一个关键步骤[5]。

此外，TRAPPC8在鸡的肌肉沉积中也发挥着重要的作用。研究者对来自两个不同实验系（肉鸡和蛋鸡）的18只鸡的完整基因组进行了测序，并在鸡染色体2上的一个与肌肉沉积相关的QTL区域（在微卫星标记MCW0185和MCW0264之间，105,849-112,649 kb）检测到了SNPs和INDELs。研究区域包含66个基因，功能注释的过滤变异体在编码区发现了517个SNPs和三个INDELs。其中，357个SNPs被归类为同义，153个为非同义，3个为stopgain，4个INDELs为移码，3个INDELs为非移码。这些外显子突变在目标区域的37个基因中鉴定到，其中3个与肌肉发育相关（DTNA、RB1CC1和MOS）。在多个基因中检测到15个非容忍SNPs（MEP1B、PRKDC、NSMAF、TRAPPC8、SDR16C5、CHD7、ST18和RB1CC1）。这些与肌肉发育相关的基因中的失活和编码区变异体可以作为进一步研究的候选变异体[6]。

综上所述，TRAPPC8是一种重要的细胞内蛋白质，参与了多种生物学过程，包括病毒的感染、胶原的组装和分泌、自噬体的形成以及肌肉沉积等。TRAPPC8的研究有助于深入理解细胞内运输和信号传导的机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。