Tyw3-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Tyw3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-17511

品系全称

C57BL/6JCya-Tyw3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-209584-Tyw3-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tyw3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-17511) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae)
基因别称
5230400J09Rik
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172474 | Ensembl: ENSMUST00000052774
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~3.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Tyw3是S-腺苷甲硫氨酸(SAM)依赖性甲基转移酶家族中的一员,负责形成tRNA中的一种称为wybutosine的修饰以及其衍生物。这种修饰对于蛋白质合成的精确解码至关重要。Tyw3蛋白具有独特的α/β折叠结构,并且其序列中的保守基序(S/T)xSSCxGR以及不变的天冬氨酸和组氨酸聚集形成催化中心。这些结构特征表明Tyw3蛋白构成SAM依赖性甲基转移酶的一个独特类别。通过定点突变和体内互补实验,以及质谱和配体对接和辅因子结合实验,研究人员已经确定了Tyw3的活性位点以及对于辅因子结合和甲基转移酶活性至关重要的残基[1]。

Tyw3基因在调节循环中抗胰岛素性激素resistin的水平方面发挥作用。基因组关联分析显示,TYW3/CRYZ基因附近的一个单核苷酸多态性(SNP)与循环中的resistin水平显著相关。此外,该SNP与冠状动脉疾病风险增加相关[2]。这些发现表明,TYW3/CRYZ基因的遗传变异可能参与调节循环resistin水平。

Tyw3基因与肌萎缩侧索硬化症(ALS)的易感性相关。在中国汉族人群中进行的一项全基因组关联研究表明,TYW3/CRYZ基因附近的两个位点与ALS显著相关。此外,表达定量性状位点分析显示,TYW3/CRYZ基因的表达水平与ALS存在显著的顺式关联[3]。这表明,TYW3/CRYZ基因可能参与了ALS的发病机制。

Tyw3基因在食管癌患者的预后中发挥重要作用。一项研究通过RNA测序和临床信息分析,发现Tyw3基因在肿瘤样本中下调,并且构建了一个基于RNA结合蛋白的预后模型,该模型能够准确地将食管癌患者分为高风险和低风险组[4]。这表明,Tyw3基因的表达水平可能与食管癌患者的预后相关。

Tyw3基因在tRNA中wybutosine的合成中发挥重要作用。通过系统性的反向遗传学和质谱分析,研究人员发现Tyw3基因与wybutosine的合成相关。此外,植物中的Tyw3基因同源物是一个大的融合蛋白,包含Tyw2和Tyw3的C端结构域以及Tyw4的C端结构域,这支持了wybutosine合成可能通过由多个组分组成的复合物进行的假设[5,6]。

Tyw3基因在双胞胎中出生体重不一致的情况下的表观遗传学改变中发挥作用。通过全基因组DNA甲基化水平分析,研究人员发现染色体1上的一个区域在出生体重不一致的双胞胎中存在显著的差异甲基化,该区域包含TYW3和CRYZ基因。这表明,TYW3和CRYZ基因的表观遗传学改变可能与出生体重不一致的情况相关[7]。

综上所述,Tyw3基因在多种生物学过程中发挥作用,包括tRNA的修饰、循环中resistin水平的调节、ALS的易感性、食管癌的预后以及出生体重不一致的情况下的表观遗传学改变。Tyw3基因的研究有助于深入理解其在生物学和疾病发生中的作用机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Currie, Mark A, Brown, Greg, Wong, Andrew, Yakunin, Alexander F, Jia, Zongchao. 2016. Structural and functional characterization of the TYW3/Taw3 class of SAM-dependent methyltransferases. In RNA (New York, N.Y.), 23, 346-354. doi:10.1261/rna.057943.116. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27932585/
2. Qi, Qibin, Menzaghi, Claudia, Smith, Shelly, Liu, Yongmei, Qi, Lu. 2012. Genome-wide association analysis identifies TYW3/CRYZ and NDST4 loci associated with circulating resistin levels. In Human molecular genetics, 21, 4774-80. doi:10.1093/hmg/dds300. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22843503/
3. Wei, Ling, Tian, Yanghua, Chen, Yongping, Shang, Huifang, Wang, Kai. 2019. Identification of TYW3/CRYZ and FGD4 as susceptibility genes for amyotrophic lateral sclerosis. In Neurology. Genetics, 5, e375. doi:10.1212/NXG.0000000000000375. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31872054/
4. Du, Hailei, Li, Yong, Pang, Shuai, Hang, Junbiao, Chen, Ling. 2023. Development and validation of a prognostic model based on RNA binding proteins in patients with esophageal cancer. In Journal of thoracic disease, 15, 6178-6191. doi:10.21037/jtd-23-1307. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38090289/
5. Noma, Akiko, Suzuki, Tsutomu. . Ribonucleome analysis identified enzyme genes responsible for wybutosine synthesis. In Nucleic acids symposium series (2004), , 65-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17150819/
6. Noma, Akiko, Kirino, Yohei, Ikeuchi, Yoshiho, Suzuki, Tsutomu. 2006. Biosynthesis of wybutosine, a hyper-modified nucleoside in eukaryotic phenylalanine tRNA. In The EMBO journal, 25, 2142-54. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16642040/
7. Chen, Mubo, Baumbach, Jan, Vandin, Fabio, Christiansen, Lene, Tan, Qihua. 2016. Differentially Methylated Genomic Regions in Birth-Weight Discordant Twin Pairs. In Annals of human genetics, 80, 81-7. doi:10.1111/ahg.12146. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26831219/