Adat2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Adat2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-17501

品系全称

C57BL/6JCya-Adat2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66757-Adat2-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Adat2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-17501) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
adenosine deaminase, tRNA-specific 2
基因别称
4933426M09Rik,Deadc1
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025748.4 | Ensembl: ENSMUST00000019944
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
ADAT2,也称为Adenosine Deaminase Acting on tRNA Specific 2,是一种重要的RNA编辑酶。RNA编辑是一种转录后基因调控机制,通过在RNA水平上改变基因编码的序列,从而影响基因表达和生物学过程。ADAT2主要催化腺嘌呤(A)转化为肌苷(I),这种修饰在真核生物的tRNA中广泛存在,并且对于tRNA的功能和稳定性至关重要。

ADAT2与另一个蛋白质ADAT3形成异源二聚体,共同催化tRNA中腺嘌呤(A)转化为肌苷(I)。这种修饰在真核生物的tRNA中广泛存在,并且对于tRNA的功能和稳定性至关重要。在酵母中,ADAT2/3的晶体结构揭示了其异源二聚体组装和底物识别机制。每个亚基都包含一个类似于原核生物同源物TadA的域,这表明了一个进化上的基因复制事件。此外,它们还显示有附加域,用于额外的结构或功能目的。ScADAT3的N端显示出一个带正电的区域,可能参与tRNA的识别和结合,这一假设得到了生化分析的支持。有趣的是,ScADAT3使用其C端来阻止tRNA进入其假活性位点,从而使其自身失活,尽管它保留了锌结合位点,这种机制可能仅限于酵母[2]。

ADAT2/3在多种生物学过程中发挥着重要作用。在克氏锥虫中,ADAT2/3活性增强导致其体内tRNAThrAGU签名发生变化,这与Thr丰富的TcSMUG蛋白表达的改变有关。这是首次证明克氏锥虫的tRNA编辑可以在体内进行调节,从而转录后改变特定基因的表达。这些发现表明,tRNA编辑/可用性是控制基因表达和驱动克氏锥虫密码子适应性的一个强有力的步骤。此外,我们还揭示了寄生虫和哺乳动物宿主tRNA编辑和加工之间的某些差异,例如在克氏锥虫中,tRNAThrAGU的32位发生胞嘧啶转化为尿嘧啶的转换,这可能被用于识别新的可药物干预靶点[1]。

ADAT2/3在人类中也发挥着重要作用。在人类中,tRNA的腺嘌呤脱氨基化反应发生在tRNA的起始阶段,并且是在前体tRNA水平上进行的。这种修饰由异源二聚酶ADAT2/3催化,该酶由两个亚基组成:ADAT2和ADAT3。使用高通量小RNA测序(RNAseq),我们表明这种修饰在成熟过程中被整合到人类tRNA中。我们还功能性地验证了编码hetADAT的人类基因,并表明该酶的亚基在ADAT2依赖性方式下共定位于细胞核中。最后,通过敲低HsADAT2,我们发现hetADAT的细胞水平变化会导致所有潜在底物中I34修饰水平的变化。总的来说,我们将RNAseq作为在起始tRNA水平研究转录后tRNA修饰的有力工具,并首次揭示了I34 tRNA修饰在真核生物中的生物学[4]。

ADAT2/3的活性还与多种疾病的发生和发展密切相关。例如,在人类中,ADAT3基因的突变与智力障碍的发生有关。这些突变导致ADAT3的脱氨酶活性受损,进而影响tRNA的wobble位置肌苷化。通过表达异源二聚体ADAT2亚基,可以挽救tRNA脱氨酶活性和wobble位置肌苷化,从而改善智力障碍患者的症状[3]。

此外,ADAT2/3的活性还与乳腺癌的预后密切相关。研究发现,乳腺癌组织中ADAT2的表达水平与患者的预后呈负相关。这表明,ADAT2可能参与了乳腺癌的发生和发展过程,并且可以作为乳腺癌治疗的潜在靶点[5]。

综上所述,ADAT2是一种重要的RNA编辑酶,参与调控tRNA的功能和稳定性,影响基因表达和生物学过程。ADAT2/3的活性与多种疾病的发生和发展密切相关,包括智力障碍和乳腺癌。深入研究ADAT2/3的功能和调控机制,有助于揭示RNA编辑在疾病发生和发展中的重要作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Bertotti, Santiago, Fleming, Ian, Cámara, María de Los Milagros, Alfonzo, Juan D, Buscaglia, Carlos A. . Characterization of ADAT2/3 molecules in Trypanosoma cruzi and regulation of mucin gene expression by tRNA editing. In The Biochemical journal, 479, 561-580. doi:10.1042/BCJ20210850. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35136964/
2. Liu, Xiwen, Chen, Ruoyu, Sun, Yujie, Luo, Guan-Zheng, Xie, Wei. 2020. Crystal structure of the yeast heterodimeric ADAT2/3 deaminase. In BMC biology, 18, 189. doi:10.1186/s12915-020-00920-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33272269/
3. Ramos, Jillian, Proven, Melissa, Halvardson, Jonatan, Thuresson, Ann-Charlotte, Fu, Dragony. 2020. Identification and rescue of a tRNA wobble inosine deficiency causing intellectual disability disorder. In RNA (New York, N.Y.), 26, 1654-1666. doi:10.1261/rna.076380.120. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32763916/
4. Torres, Adrian Gabriel, Piñeyro, David, Rodríguez-Escribà, Marta, Batlle, Eduard, Ribas de Pouplana, Lluís. 2015. Inosine modifications in human tRNAs are incorporated at the precursor tRNA level. In Nucleic acids research, 43, 5145-57. doi:10.1093/nar/gkv277. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25916855/
5. Mi, Yin, Dong, Meilian, Zuo, Xiaoxiao, Mi, Hailong, Xiao, Fankai. 2024. Genome-wide identification and analysis of epithelial-mesenchymal transition-related RNA-binding proteins and alternative splicing in a human breast cancer cell line. In Scientific reports, 14, 11753. doi:10.1038/s41598-024-62681-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38783078/