Nctc1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Nctc1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-17368

品系全称

C57BL/6JCya-Nctc1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-330677-Nctc1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Nctc1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-17368) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
non-coding transcript 1
基因别称
9530074L01,Rhit1
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NR_002452 | Ensembl: ENSMUST00000132167
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~3
敲除长度
~18.8 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Nctc1是一种在哺乳动物中编码长链非编码RNA(lncRNA)的基因。lncRNA是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA,它们不编码蛋白质,但在基因表达调控中发挥重要作用。Nctc1位于Igf2-H19-Nctc1位点,这是一个重要的印记基因区域,与哺乳动物的生长和发育密切相关。

Nctc1的表达受到印记基因H19的调控。H19是一种发育调控的lncRNA,它通过与S-腺苷高半胱氨酸水解酶(SAHH)结合并抑制其活性,影响DNA甲基化。SAHH是唯一一种能够水解S-腺苷高半胱氨酸(SAH)的哺乳动物酶。SAH是一种强大的S-腺苷蛋氨酸(SAM)依赖性甲基转移酶的反馈抑制剂,这些甲基转移酶能够甲基化多种细胞成分,包括DNA、RNA、蛋白质、脂质和神经递质。研究发现,H19基因的敲低会激活SAHH,导致Nctc1基因的DNA甲基化水平升高[1]。

Nctc1基因的表达与Igf2和H19基因的表达密切相关。Igf2和H19基因是一对印记基因,它们在哺乳动物的发育过程中发挥着重要作用。研究发现,Igf2和H19基因的表达受到一个共同的增强子元素的调控。这个增强子元素能够与Igf2和H19基因的启动子相互作用,激活它们的转录。此外,Nctc1基因的表达也受到这个增强子元素的调控,它与Igf2和H19基因的启动子共同组成一个转录复合体[2][4]。

Nctc1基因的表达受到父本偏倚性印记的调控。在肌肉细胞中,Igf2、H19和Nctc1基因的表达受到父本偏倚性印记的调控,即它们只在父本染色体上表达。研究发现,Igf2基因的反义转录本Igf2as的表达也受到这个印记基因簇的调控,它只在父本染色体上表达。这表明,Nctc1基因与Igf2、H19和Igf2as基因共同组成一个印记基因簇,它们的表达受到父本偏倚性印记的调控[3]。

Nctc1基因的表达受到增强子元素和启动子之间的相互作用的影响。研究发现,Igf2和H19基因的启动子与一个共同的肌肉特异性增强子元素相互作用,激活它们的转录。Nctc1基因的启动子也与这个增强子元素相互作用,与Igf2和H19基因的启动子共同组成一个转录复合体。此外,Nctc1基因的启动子还可以与Igf2和H19基因的启动子相互作用,形成环状结构,进一步调控它们的表达[4]。

综上所述,Nctc1基因是一种在哺乳动物中编码lncRNA的基因,它在基因表达调控中发挥重要作用。Nctc1基因的表达受到印记基因H19的调控,影响DNA甲基化水平。Nctc1基因的表达与Igf2和H19基因的表达密切相关,它们共同组成一个印记基因簇,受到父本偏倚性印记的调控。Nctc1基因的表达受到增强子元素和启动子之间的相互作用的影响,形成环状结构,进一步调控基因的表达。Nctc1基因的研究有助于深入理解基因表达调控的机制,为相关疾病的诊断和治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhou, Jichun, Yang, Lihua, Zhong, Tianyu, Taylor, Hugh S, Huang, Yingqun. 2015. H19 lncRNA alters DNA methylation genome wide by regulating S-adenosylhomocysteine hydrolase. In Nature communications, 6, 10221. doi:10.1038/ncomms10221. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26687445/
2. Eun, Bokkee, Sampley, Megan L, Van Winkle, Matthew T, Kachman, Marika M, Pfeifer, Karl. 2013. The Igf2/H19 muscle enhancer is an active transcriptional complex. In Nucleic acids research, 41, 8126-34. doi:10.1093/nar/gkt597. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23842673/
3. Kim, Jae-Young, Youn, Hwa Young, Pfeifer, Karl, Eun, Bokkee. 2019. Paternal bias expression of Igf2as is enhancer-dependent on the imprinting cluster of Igf2, H19 and Nctc1 in muscle cells. In Animal cells and systems, 23, 288-293. doi:10.1080/19768354.2019.1612780. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31489250/
4. Eun, Bokkee, Sampley, Megan L, Good, Austin L, Gebert, Claudia M, Pfeifer, Karl. 2012. Promoter cross-talk via a shared enhancer explains paternally biased expression of Nctc1 at the Igf2/H19/Nctc1 imprinted locus. In Nucleic acids research, 41, 817-26. doi:10.1093/nar/gks1182. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23221643/