Nipsnap3a-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Nipsnap3a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-17285

品系全称

C57BL/6JCya-Nipsnap3aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-73398-Nipsnap3a-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Nipsnap3a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-17285) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
nipsnap homolog 3A
基因别称
1700054F22Rik
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: -- | Ensembl: ENSMUST00000015386
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
NIPSNAP3A,即Nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 3A,是一种主要存在于线粒体基质中的蛋白质。NIPSNAP家族的蛋白质在细胞内发挥着重要的功能,尤其是NIPSNAP3A,其在维持细胞稳态方面起着关键作用。NIPSNAP3A通过调节线粒体动力学来影响细胞代谢和生存,包括细胞增殖、迁移和凋亡等关键过程。研究发现,NIPSNAP3A的敲低会抑制细胞的增殖和迁移,并减弱Actinomycin D (Act-D)诱导的凋亡。此外,NIPSNAP3A的敲低不仅通过减少DRP1-S616的表达来抑制线粒体分裂,还抑制了细胞凋亡过程中的细胞色素c释放。这些发现表明,NIPSNAP3A在协调细胞过程中起着至关重要的作用,很可能通过其影响线粒体动力学来实现[1]。

在大规模全基因组测序研究中,NIPSNAP3A的增强子区域和染色体1上的一个基因间区域被发现与脂质特征相关。这表明NIPSNAP3A可能参与调节脂质代谢,并在多效性基因和区域中发挥作用[2]。

线粒体外囊泡(MitoEVs)是一类富含线粒体成分的高度异质性的细胞外囊泡。研究发现,MitoEVs与牙周炎的免疫微环境相关。通过对MitoCarta 3.0、GeneCards和GEO数据库的数据分析,共鉴定出44个差异表达的MitoEV相关基因(MERGs)。随机森林和LASSO算法确定了9个核心MERGs,包括NIPSNAP3A。ROC曲线分析显示,核心基因和逻辑回归模型表现出优异的诊断和鉴别能力。免疫浸润和共识聚类分析表明,核心MERGs与各种免疫细胞高度相关,不同牙周炎亚型之间在免疫细胞和核心MERGs方面存在显著差异。这表明MitoEVs在牙周炎免疫微环境中具有调节作用,而NIPSNAP3A作为核心MERGs之一,可能参与其中[3]。

NIPSNAP3A的表达模式和组织分布也得到了研究。研究发现,NIPSNAP3A在骨骼肌中表达量最高,而NIPSNAP4在骨骼肌中的mRNA丰度较低。此外,NIPSNAP4与膜相关,部分定位于脂筏。NIPSNAP3A和NIPSNAP4的广泛表达和与膜的关联进一步支持了这些蛋白质在细胞功能中的重要作用,可能与囊泡转运有关[4]。

综上所述,NIPSNAP3A是一种重要的线粒体基质蛋白,在维持细胞稳态、调节线粒体动力学以及参与囊泡转运等方面发挥着重要作用。NIPSNAP3A的敲低会影响细胞的增殖、迁移和凋亡,并可能通过影响线粒体动力学来实现。此外,NIPSNAP3A与脂质代谢、牙周炎免疫微环境以及囊泡转运等方面也存在着关联。这些研究为进一步深入理解NIPSNAP3A的功能和机制提供了重要的线索,并可能为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Yan, Run, Chen, Liting, Cai, Zimu, Ruan, Yu, Han, Qi. 2024. NIPSNAP3A regulates cellular homeostasis by modulating mitochondrial dynamics. In Gene, 933, 148976. doi:10.1016/j.gene.2024.148976. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39362349/
2. Li, Xihao, Chen, Han, Selvaraj, Margaret Sunitha, Liu, Zhonghua, Lin, Xihong. 2023. A statistical framework for powerful multi-trait rare variant analysis in large-scale whole-genome sequencing studies. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.10.30.564764. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37961350/
3. Yang, Haoran, Zhao, Anna, Chen, Yuxiang, Zhou, Jianzhong, Li, Ziliang. 2024. Exploring the potential link between MitoEVs and the immune microenvironment of periodontitis based on machine learning and bioinformatics methods. In BMC oral health, 24, 169. doi:10.1186/s12903-024-03912-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38308306/
4. Buechler, Christa, Bodzioch, Marek, Bared, Salim Maa, Dembinska-Kiec, Aldona, Schmitz, Gerd. . Expression pattern and raft association of NIPSNAP3 and NIPSNAP4, highly homologous proteins encoded by genes in close proximity to the ATP-binding cassette transporter A1. In Genomics, 83, 1116-24. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15177564/