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Dpf3-KO 基因敲除小鼠
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基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
double PHD fingers 3
基因别称
2810403B03Rik，6530402L11Rik，BAF45C，CERD4，Gm18872，cer-d4
染色体号
Chr 12 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_001267625.1 | Ensembl: ENSMUST00000178756
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~1.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1917377Mice homozygous for a null allele display no detectable phenotype.
DPF3（Double PHD fingers 3）基因是SWI/SNF染色质重塑复合体的一个组分，其在细胞生长、增殖、凋亡和癌细胞的迁移中发挥着重要作用。DPF3基因编码的蛋白含有两个PHD（Plant Homeodomain）结构域，该结构域在DNA识别和结合中具有重要作用，同时参与染色质重塑过程，调节基因的表达。此外，DPF3还与非编码RNA的调控相关，如lncRNA lnc-Dpf3，其在免疫细胞迁移和代谢中发挥作用。DPF3基因的异常表达和调控与多种疾病的发生和发展相关，包括黑色素瘤、慢性淋巴细胞白血病、男性不育症、肾细胞癌和坏死性小肠结肠炎等。
在一项关于灰马黑色素瘤的研究中，研究者发现DPF3基因可能与灰马黑色素瘤的发病机制有关。通过全基因组关联分析，研究者发现DPF3基因的一个单核苷酸多态性（SNP）与灰马黑色素瘤的发生具有显著相关性，并且该SNP的G/G基因型表现出潜在的黑色素瘤抑制效果[1]。这表明DPF3基因可能在灰马应对高遗传性黑色素瘤相关肿瘤负荷方面发挥重要作用。
CCR7趋化因子受体刺激能够快速但短暂地促进树突状细胞（DC）向引流淋巴结迁移，这对保护免疫的启动和免疫稳态的维持至关重要。研究者发现，CCR7趋化因子受体刺激能够上调lnc-Dpf3的表达，而lnc-Dpf3能够抑制DC的迁移和炎症反应。具体而言，CCR7刺激激活了DC中的HIF-1α转录因子通路，导致DC代谢重编程向糖酵解，以支持DC的迁移。lnc-Dpf3能够直接结合HIF-1α，抑制HIF-1α依赖性糖酵解基因Ldha的转录，从而抑制DC的糖酵解代谢和迁移能力[2]。这表明DPF3基因及其相关非编码RNA在免疫细胞功能和免疫调节中具有重要作用。
DPF3基因的短异构体DPF3a在ccRCC（透明细胞肾细胞癌）患者中显著上调，并且与ccRCC的转移相关。研究者发现DPF3a能够促进肾癌细胞迁移，其机制可能与DPF3a与SNIP1的相互作用有关。DPF3a与SNIP1形成复合物，进而与SMAD4和p300组蛋白乙酰转移酶（HAT）结合，释放SNIP1对p300 HAT活性的抑制，导致局部组蛋白乙酰化增加，激活与细胞运动相关的基因表达[3]。这揭示了DPF3基因在ccRCC转移中的促进作用，并建立了SWI/SNF复合体组分与ccRCC之间的联系。
STAT5是一种重要的转录因子，控制着细胞生长、增殖和分化等关键过程。研究者发现，STAT5能够调控DPF3基因的表达。在慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者中，DPF3基因的表达显著上调，并且与STAT5的激活相关。STAT5能够与DPF3基因启动子结合，促进DPF3基因的表达，进而影响CLL的发生和发展[4]。这为理解STAT5在CLL中的功能和作用机制提供了新的线索。
DPF3基因的多态性与男性不育症相关。研究者发现，DPF3基因的rs10129954位点与无精子症和少精子症相关，表明DPF3基因的变异可能与精子发生和精子运动功能相关[5]。此外，DPF3基因的另一个SNP位点rs10966811也与男性不育症相关[6]。这些发现为男性不育症的遗传因素和发病机制提供了新的认识。
DPF3基因的异常表达与Hirschsprung's病（HSCR）的发生相关。HSCR是一种神经 crest-derived stem cells（NCSCs）的迁移和分化异常导致的肠道疾病。研究者发现，HA117（一种与视黄酸信号相关的长链非编码RNA）和DPF3基因在HSCR患者的肠道不同部位的表达存在差异。HA117在HSCR患者的狭窄段表达较高，而DPF3b mRNA的表达较低。这表明DPF3基因和HA117可能在HSCR的发生和发展中发挥重要作用[7]。
DPF3基因的异常表达与肾细胞癌的易感性相关。研究者发现，DPF3基因的一个SNP位点rs4903064与肾细胞癌的易感性相关。该SNP位点能够影响DPF3基因的表达，导致细胞凋亡减少和STAT3通路激活，从而促进肾细胞癌的发生和发展[8]。此外，DPF3基因的表达还可能影响肾细胞癌的免疫治疗疗效，通过调节肿瘤细胞因子分泌和免疫细胞活化[8]。
DPF3基因的异常表达与坏死性小肠结肠炎（NEC）的发生相关。NEC是一种新生儿常见的肠道疾病，表现为肠道炎症和坏死。研究者通过RNA测序技术发现，DPF3基因在NEC病变组织中表达显著下调。这表明DPF3基因可能在NEC的发生和发展中发挥重要作用[9]。
综上所述，DPF3基因在细胞生长、增殖、凋亡、免疫调节和染色质重塑等方面具有重要作用。DPF3基因的异常表达和调控与多种疾病的发生和发展相关，包括黑色素瘤、慢性淋巴细胞白血病、男性不育症、肾细胞癌和坏死性小肠结肠炎等。深入研究DPF3基因的功能和作用机制，有助于揭示疾病的发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Druml, Thomas, Brem, Gottfried, Horna, Michaela, Ricard, Anne, Grilz-Seger, Gertrud. 2021. DPF3, A Putative Candidate Gene For Melanoma Etiopathogenesis in Gray Horses. In Journal of equine veterinary science, 108, 103797. doi:10.1016/j.jevs.2021.103797. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34801788/
2. Liu, Juan, Zhang, Xiaomin, Chen, Kun, Li, Zhiqing, Cao, Xuetao. 2019. CCR7 Chemokine Receptor-Inducible lnc-Dpf3 Restrains Dendritic Cell Migration by Inhibiting HIF-1α-Mediated Glycolysis. In Immunity, 50, 600-615.e15. doi:10.1016/j.immuni.2019.01.021. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30824325/
3. Cui, Huanhuan, Yi, Hongyang, Bao, Hongyu, Hu, Yuhui, Chen, Wei. 2022. The SWI/SNF chromatin remodeling factor DPF3 regulates metastasis of ccRCC by modulating TGF-β signaling. In Nature communications, 13, 4680. doi:10.1038/s41467-022-32472-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35945219/
4. Theodorou, Marina, Speletas, Matthaios, Mamara, Antigoni, Scorilas, Andreas, Katsantoni, Eleni. 2013. Identification of a STAT5 target gene, Dpf3, provides novel insights in chronic lymphocytic leukemia. In PloS one, 8, e76155. doi:10.1371/journal.pone.0076155. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24155890/
5. Sato, Youichi, Hasegawa, Chise, Tajima, Atsushi, Yamauchi, Aiko, Iwamoto, Teruaki. 2017. Association of TUSC1 and DPF3 gene polymorphisms with male infertility. In Journal of assisted reproduction and genetics, 35, 257-263. doi:10.1007/s10815-017-1052-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28975488/
6. Liu, Shu-Yuan, Zhang, Chang-Jun, Peng, Hai-Ying, Chu, Jia-You, Yang, Zhao-Qing. . Strong association of SLC1A1 and DPF3 gene variants with idiopathic male infertility in Han Chinese. In Asian journal of andrology, 19, 486-492. doi:10.4103/1008-682X.178850. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27232852/
7. Liu, Hang, Luo, Yuanyuan, Li, Shuangshuang, Wang, Ning, Jin, Xianqing. 2014. Expression profiles of HA117 and its neighboring gene DPF3 in different colon segments of Hirschsprung's disease. In International journal of clinical and experimental pathology, 7, 3966-74. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25120773/
8. Colli, Leandro M, Jessop, Lea, Myers, Timothy A, Brown, Kevin M, Chanock, Stephen J. 2021. Altered regulation of DPF3, a member of the SWI/SNF complexes, underlies the 14q24 renal cancer susceptibility locus. In American journal of human genetics, 108, 1590-1610. doi:10.1016/j.ajhg.2021.07.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34390653/
9. Jung, Kyuwhan, Koh, Insong, Kim, Jeong Hyun, Jung, Eunyoung, Shin, Hyoung Doo. . RNA-Seq for Gene Expression Profiling of Human Necrotizing Enterocolitis: a Pilot Study. In Journal of Korean medical science, 32, 817-824. doi:10.3346/jkms.2017.32.5.817. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28378556/
| 精子检测 | ① 冷冻前验证精子活力观察 ② 冷冻验证每批次进行复苏验证 | 交付状态 | 活体/精子 |
| 环境标准 | SPF | 供应地区 | 中国 |
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