Crnkl1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Crnkl1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16936

品系全称

C57BL/6JCya-Crnkl1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66877-Crnkl1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Crnkl1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16936) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
crooked neck pre-mRNA splicing factor 1
基因别称
1200013P10Rik,5730590A01Rik,crn
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025820 | Ensembl: ENSMUST00000001818
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~1.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
CRNKL1基因,也称为Crooked Neck,是一种重要的基因,编码一种在细胞中发挥重要功能的蛋白质。这个基因的产物在细胞分裂和发育过程中扮演着关键角色。它参与了剪接体的组装和mRNA的剪接过程,这是基因表达调控的重要步骤。CRNKL1基因的产物主要在细胞核中发挥作用,与剪接因子结合,参与调控mRNA的剪接和转运。

在多种疾病中,CRNKL1基因的表达和功能发生了改变。例如,在食管腺癌中,CRNKL1基因的表达水平与患者的生存率密切相关。研究表明,CRNKL1基因的高表达与食管腺癌患者的低风险相关,而低表达则与高风险相关。因此,CRNKL1基因被认为是一种潜在的预后生物标志物,可以用于预测食管腺癌患者的生存情况[1]。

此外,CRNKL1基因还参与了HIV-1病毒的复制过程。研究发现,CRNKL1基因的缺失可以显著增强未剪接的HIV-1 RNA在细胞质中的水平,表明CRNKL1基因可能参与了HIV-1 RNA的核转运过程。因此,CRNKL1基因被认为是HIV-1病毒复制过程中的一个重要调节因子[2]。

在基底细胞癌中,CRNKL1基因也发生了突变。研究发现,CRNKL1基因在基底细胞癌中的突变频率较高,表明CRNKL1基因可能参与了基底细胞癌的发生和发展过程。此外,CRNKL1基因的突变还与肿瘤的恶性程度和患者的预后相关[3]。

研究表明,2,3,7,8-TCDD(一种环境毒素)可以抑制细胞中的选择性剪接过程,从而影响基因的表达和功能。研究发现,2,3,7,8-TCDD可以显著抑制细胞中的选择性剪接事件,减少转录本的多样性。此外,2,3,7,8-TCDD还可以影响剪接体中关键基因的表达,包括CRNKL1基因。这表明2,3,7,8-TCDD可能通过影响剪接过程和基因表达,从而影响细胞的生物学功能和疾病的发生发展[4]。

此外,CRNKL1基因还与绝经后骨质疏松症的发生相关。研究发现,CRNKL1基因在绝经后女性的血单核细胞中的表达水平显著升高,并且与骨密度相关。这表明CRNKL1基因可能参与了绝经后骨质疏松症的发生和发展过程[5]。

在高葡萄糖诱导的血管平滑肌细胞中,CRNKL1基因的表达发生了改变。研究发现,高葡萄糖可以上调NOTCH3基因的表达,并下调CRNKL1基因的表达。此外,NOTCH3基因的敲低可以抑制血管平滑肌细胞的增殖和诱导凋亡,而CRNKL1基因的过表达可以逆转这些效应。这表明NOTCH3/RANBP1轴是调控血管平滑肌细胞在高葡萄糖条件下自噬和生存的关键因素[6]。

CRNKL1基因的突变与Drosophila melanogaster的胚胎发育和细胞周期进程相关。研究发现,CRNKL1基因的突变可以导致Drosophila melanogaster的胚胎发育异常和细胞周期进程受阻。这表明CRNKL1基因在细胞分裂和发育过程中发挥着重要作用[7]。

综上所述,CRNKL1基因是一种重要的基因,编码一种在细胞中发挥重要功能的蛋白质。它参与了剪接体的组装和mRNA的剪接过程,这是基因表达调控的重要步骤。在多种疾病中,CRNKL1基因的表达和功能发生了改变,表明它可能参与了疾病的发生和发展过程。此外,CRNKL1基因的研究还有助于深入理解剪接过程和基因表达调控的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Li, Zhen, Yao, Qianlan, Zhao, Songjian, Wang, Zhen, Li, Yixue. 2017. Protein coding gene CRNKL1 as a potential prognostic biomarker in esophageal adenocarcinoma. In Artificial intelligence in medicine, 76, 1-6. doi:10.1016/j.artmed.2017.01.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28363284/
2. Xiao, Han, Wyler, Emanuel, Milek, Miha, Ensser, Armin, Überla, Klaus. 2021. CRNKL1 Is a Highly Selective Regulator of Intron-Retaining HIV-1 and Cellular mRNAs. In mBio, 12, . doi:10.1128/mBio.02525-20. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33468685/
3. Jayaraman, Shyam S, Rayhan, David J, Hazany, Salar, Kolodney, Michael S. 2013. Mutational landscape of basal cell carcinomas by whole-exome sequencing. In The Journal of investigative dermatology, 134, 213-220. doi:10.1038/jid.2013.276. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23774526/
4. Zhao, Bilin, Deng, Jiewei, Ma, Mei, Li, Xinyan, Luan, Tiangang. 2024. Environmentally relevant concentrations of 2,3,7,8-TCDD induced inhibition of multicellular alternative splicing and transcriptional dysregulation. In The Science of the total environment, 919, 170892. doi:10.1016/j.scitotenv.2024.170892. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38346650/
5. Qian, Guo-Feng, Yuan, Lu-Shun, Chen, Min, Vijayan, Vijith, Xiao, Yu. 2019. PPWD1 is associated with the occurrence of postmenopausal osteoporosis as determined by weighted gene co‑expression network analysis. In Molecular medicine reports, 20, 3202-3214. doi:10.3892/mmr.2019.10570. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31432133/
6. Xu, Zhong-Jiao, Xu, Jian, Lei, Wen-Jing, Wei, Tie-Min, Zeng, Chun-Lai. . RANBP1 Regulates NOTCH3-Mediated Autophagy in High Glucose-Induced Vascular Smooth Muscle Cells. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 30, 26850. doi:10.31083/FBL26850. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40018934/
7. Lai, C H, Chiu, J Y, Lin, W. . Identification of the human crooked neck gene by comparative gene identification. In Biochimica et biophysica acta, 1517, 449-54. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11342225/