Gc-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Gc-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16525

品系全称

C57BL/6JCya-Gcem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-14473-Gc-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gc-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16525) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
vitamin D binding protein
基因别称
DBP,VDB
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_008096 | Ensembl: ENSMUST00000049209
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~2.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:95669Mice homozygous for disruption of this gene show an essentially normal phenotype. However, they have an increased sensitivity to vitamin D deficiency in the diet.
Gc基因是一种普遍存在于真核细胞中的基因,它在基因表达和调控中起着重要作用。Gc基因的名称来源于其序列中富含G(鸟嘌呤)和C(胞嘧啶)碱基的特点,这种碱基组成在基因序列中形成了所谓的GC岛。GC岛通常位于基因的启动子区域,它们富含CpG二核苷酸,是DNA甲基化的重要位点。DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它通过添加甲基基团到CpG位点上,调节基因的表达和功能。

GC含量对基因表达模式有显著影响。例如,在鸡的基因组中,GC含量与基因表达水平、表达范围和最大表达水平呈显著正相关,尤其是在基因的5'非翻译区(5' UTR)中[4]。然而,在编码序列和内含子以及编码序列的第三个位置,GC含量与表达水平和表达范围呈负相关。这些结果表明,GC含量是影响基因表达的一个重要因素,它可能在基因调控中发挥着关键作用。

GC含量还与基因复制和突变有关。研究表明,植物基因的GC含量与其复制状态有关,未复制基因的GC含量高于复制基因[1]。此外,GC含量还与基因的甲基化水平有关,甲基化水平的升高可能导致CpG位点的T突变,从而降低GC含量[1]。这些结果表明,GC含量可能是一个动态的指标,它受到复制和甲基化等生物过程的调节。

GC含量还与RNA剪接有关。研究表明,细胞核的不同区域具有不同的GC含量,这些区域的GC含量差异可能影响RNA剪接的产物。例如,核外周区域的基因具有较低的GC含量,这些基因的内含子较长,且内含子和外显子的GC含量较低,它们的剪接产物倾向于外显子跳跃。相反,核中心的基因具有较高的GC含量,这些基因的内含子较短,它们的剪接产物倾向于内含子保留[2]。

GC含量还与某些疾病的发生和发展有关。例如,在胃癌中,某些基因的GC含量与其表达水平和功能状态有关,这些基因的剪接变异可能与胃癌的发生和发展有关[5]。此外,GC含量还与HLA基因的多态性有关,HLA基因的多态性可能影响宿主细胞对幽门螺杆菌的免疫反应,从而影响胃癌的发生和发展[3]。

综上所述,GC含量是一个重要的生物学指标,它影响基因表达、复制、突变和RNA剪接等生物过程,并与某些疾病的发生和发展有关。研究GC含量的变化规律和调控机制,有助于深入理解基因表达和调控的复杂性,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Bowers, John E, Tang, Haibao, Burke, John M, Paterson, Andrew H. 2022. GC content of plant genes is linked to past gene duplications. In PloS one, 17, e0261748. doi:10.1371/journal.pone.0261748. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35025913/
2. Tammer, Luna, Hameiri, Ofir, Keydar, Ifat, Carmo-Fonseca, Maria, Ast, Gil. 2022. Gene architecture directs splicing outcome in separate nuclear spatial regions. In Molecular cell, 82, 1021-1034.e8. doi:10.1016/j.molcel.2022.02.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35182478/
3. Mahmud, Md Toslim, Ahmed, Feroz, Rana, Md Jowel, Atta, Afshan, Saif-Ur-Rahman, K M. . Association of HLA gene polymorphisms with Helicobacter pylori related gastric cancer-a systematic review. In HLA, 103, e15394. doi:10.1111/tan.15394. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38372631/
4. Rao, You Sheng, Chai, Xue Wen, Wang, Zhang Feng, Nie, Qing Hua, Zhang, Xi Quan. 2013. Impact of GC content on gene expression pattern in chicken. In Genetics, selection, evolution : GSE, 45, 9. doi:10.1186/1297-9686-45-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23557030/
5. Li, Ying, Yuan, Yuan. 2016. Alternative RNA splicing and gastric cancer. In Mutation research. Reviews in mutation research, 773, 263-273. doi:10.1016/j.mrrev.2016.07.011. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28927534/