Cdk9-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Cdk9-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16449

品系全称

C57BL/6JCya-Cdk9em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-107951-Cdk9-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Cdk9-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16449) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
cyclin dependent kinase 9
基因别称
PITALRE
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_130860 | Ensembl: ENSMUST00000009699
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~7
敲除长度
~3.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Cdk9,也称为细胞周期蛋白依赖性激酶9,是RNA聚合酶II(RNAPII)正转录延伸因子b(P-TEFb)的激酶部分。Cdk9在转录的多个阶段发挥关键作用,尤其是在转录延伸阶段,它通过磷酸化RNAPII的羧基末端结构域(CTD)和其他转录因子,如负延伸因子(NELF)和DSIF,促进转录的进行。Cdk9的活性受到细胞周期蛋白T(CycT)和P-TEFb复合体的调节,这些复合体在转录起始后招募到基因启动子区域,帮助RNAPII从启动子近端暂停状态释放到基因体内进行有效的延伸。

Cdk9的活性对于大多数蛋白编码基因的转录至关重要,其功能失调与多种疾病相关,包括癌症。例如,在淋巴瘤中,CDK9的抑制会导致转录组的变化,并可能引起表观遗传重编程,从而影响肿瘤细胞的生长和生存[2]。此外,在胶质母细胞瘤中,CDK7和CDK9的抑制不仅干扰转录和翻译,还影响干细胞的自我更新,并诱导细胞毒性,这表明CDK9可能是治疗胶质母细胞瘤的一个有希望的靶点[4]。

除了Cdk9本身的作用外,其他转录调控因子和机制也对转录延伸有重要影响。例如,BET溴域蛋白被发现是转录延伸的主要调节因子,其功能不依赖于CDK9的招募[3]。此外,转录体通过隔离CDK9来调节基因表达,从而防止基因在细胞核其他部位被转录[1]。在压力条件下,NELF通过核凝聚体的形成来调节转录的降低,这是细胞对压力反应的关键机制之一[5,6]。

综上所述,Cdk9在转录调控中发挥着核心作用,其功能与转录的起始、延伸和终止密切相关。Cdk9的活性受到多种因素的调节,包括细胞周期蛋白、其他转录因子和转录调控复合体。Cdk9的功能失调与多种疾病相关,包括癌症,这使其成为潜在的治疗靶点。此外,其他转录调控因子和机制也对转录延伸有重要影响,包括BET溴域蛋白、转录体和NELF。这些发现为我们深入理解转录调控的复杂性和疾病的发生机制提供了新的见解。

参考文献:
1. Ugolini, Martino, Kerlin, Maciej A, Kuznetsova, Ksenia, Kimura, Hiroshi, Vastenhouw, Nadine L. 2024. Transcription bodies regulate gene expression by sequestering CDK9. In Nature cell biology, 26, 604-612. doi:10.1038/s41556-024-01389-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38589534/
2. Thieme, Elana, Bruss, Nur, Sun, Duanchen, Xia, Zheng, Danilov, Alexey V. 2023. CDK9 inhibition induces epigenetic reprogramming revealing strategies to circumvent resistance in lymphoma. In Molecular cancer, 22, 64. doi:10.1186/s12943-023-01762-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36998071/
3. Winter, Georg E, Mayer, Andreas, Buckley, Dennis L, Churchman, L Stirling, Bradner, James E. 2017. BET Bromodomain Proteins Function as Master Transcription Elongation Factors Independent of CDK9 Recruitment. In Molecular cell, 67, 5-18.e19. doi:10.1016/j.molcel.2017.06.004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28673542/
4. Bhutada, Isha, Khambati, Fatema, Cheng, Shi-Yuan, Chellappan, Srikumar P, Padmanabhan, Jaya. . CDK7 and CDK9 inhibition interferes with transcription, translation, and stemness, and induces cytotoxicity in GBM irrespective of temozolomide sensitivity. In Neuro-oncology, 26, 70-84. doi:10.1093/neuonc/noad143. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37551745/
5. Rawat, Prashant, Boehning, Marc, Hummel, Barbara, Cramer, Patrick, Sawarkar, Ritwick. 2021. Stress-induced nuclear condensation of NELF drives transcriptional downregulation. In Molecular cell, 81, 1013-1026.e11. doi:10.1016/j.molcel.2021.01.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33548202/
6. DeBerardine, Michael, Booth, Gregory T, Versluis, Philip P, Lis, John T. 2023. The NELF pausing checkpoint mediates the functional divergence of Cdk9. In Nature communications, 14, 2762. doi:10.1038/s41467-023-38359-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37179384/