Polr3g-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Polr3g-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16405

品系全称

C57BL/6JCya-Polr3gem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-67486-Polr3g-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Polr3g-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16405) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G
基因别称
2310047G20Rik,RPC32,RPC7
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081176 | Ensembl: ENSMUST00000048993
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~2.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1914736Mice homozygous for a null allele exhibit embryonic lethality between E3.5 and E6.5.
POLR3G,也称为RNA聚合酶III亚基G(RPC7α),是RNA聚合酶III(Pol III)的一个组成部分,负责转录小分子RNA,如tRNA和5S rRNA。Pol III是三种主要的RNA聚合酶之一,负责合成细胞内的小RNA分子,这些小RNA分子在蛋白质合成和细胞功能调控中发挥重要作用。POLR3G在细胞核中发挥作用,参与转录过程,对于维持细胞的基本功能和基因表达的调控至关重要。

RNA聚合酶III存在两种形式,一种含有POLR3G亚基,另一种含有与之密切相关的POLR3GL亚基。虽然这两种Pol III形式在细胞中共同存在,但它们在细胞中的相对含量有所不同,含有POLR3G的Pol III在分裂细胞中相对更丰富。基因组范围内的染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)显示,这两种形式的Pol III占据相同的靶基因,并且在细胞系中占据的比例非常恒定,这表明这两种形式的Pol III在靶基因特异性方面具有相似的功能。然而,POLR3G启动子与转录因子MYC结合,而POLR3GL启动子则不与MYC结合。这表明POLR3G/POLR3GL的复制并没有导致基因产物的功能新化,而是导致转录单位的功能新化,从而为细胞提供了更大的调控潜力[1]。

RNA聚合酶III对于同源重组(HR)介导的DNA双链断裂(DSB)的修复是必需的。在HR和HR介导的DSB修复过程中,3'单链DNA(ssDNA)突出部分受到保护,其机制尚未确定。研究表明,3'突出部分的保护是通过RNA-DNA杂合体的短暂形成来实现的。RNA聚合酶III(RNAPIII)负责合成RNA链。此外,RNAPIII被MRN复合物积极招募到DSB处。CtIP和MRN核酸酶活性对于在DSB处启动RNAPIII介导的RNA合成是必需的。RNAPIII水平的降低抑制了HR,而遗传缺失大于30bp时,DSB处的RNA-DNA杂合体水平增加。因此,RNAPIII是HR的一个关键因子,RNA-DNA杂合体是DSB修复过程中保护3'突出部分的一个关键修复中间体[2]。

POLR3G在人类癌症中的表达与肿瘤生长和转移有关,高POLR3G表达是多种癌症亚型的负预后因素。研究发现,POLR3G表达受到多种因素的调控,包括基因内部的超级增强子与多种转录因子(TFs)的结合,以及基因内部的DNA甲基化、视黄酸诱导的分化等。此外,MXD4可能通过阻断MYC驱动的POLR3G和其他生长相关基因的表达来阻碍POLR3G的表达。整合染色质结构和基因调控特征,还发现其他可能影响POLR3G基因活性的因素,包括组蛋白去甲基化酶KDM5B等。这些发现支持了一个模型,即POLR3G表达受到多种因素和动态调控程序的控制,这扩展了我们对于POLR3G上调及其在癌症中的下游后果的理解[3]。

POLR3G在膀胱癌中的表达上调与不良预后相关。研究发现,POLR3G在膀胱癌组织中的表达显著高于正常膀胱组织。此外,POLR3G在膀胱癌细胞系T24中的表达也高于正常尿上皮细胞系SV-HUC-1。POLR3G的表达与种族、肿瘤状态、肿瘤亚型、T分类和病理阶段相关。生存分析显示,POLR3G表达水平较高的患者总体生存率较低。基因集富集分析(GSEA)显示,与肿瘤发展和转移相关的基因集,包括TGF-β信号通路、PI3K-AKT-mTOR信号通路和IL6-JAK-STAT3信号通路,在POLR3G高表达型中显著富集。免疫浸润分析显示,POLR3G的表达与免疫细胞的浸润水平相关,包括CD8+ T细胞、中性粒细胞和树突状细胞,以及与免疫检查点分子如PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、LAG3、HAVCR2和TIGIT的表达相关。这表明POLR3G可能作为膀胱癌的预后标志物,并可能有助于预测对免疫治疗的反应[4]。

POLR3G在人类多能干细胞(hPSCs)中的表达水平很高,对于维持干细胞状态至关重要。研究发现,POLR3G调节hPSC转录组中的特定子集,包括蛋白质编码基因、长间隔非编码RNA、miRNA和小核RNA,并影响RNA剪接。POLR3G的主要功能在于维持而不是抑制转录。大多数POLR3G多聚腺苷酸化(polyA+)转录组在分化过程中受到调控,而关键的多能性因子至少与30%的POLR3G调节的转录本的启动子结合。在POLR3G的直接靶标中,POLG可能在维持干细胞状态方面发挥重要作用[5]。

POLR3G在前列腺癌细胞中的靶向导致增殖停滞和分化。RNA聚合酶III(pol III)以两种形式存在,分别含有POLR3G亚基或相关的旁系同源物POLR3GL。POLR3GL在所有细胞中普遍存在,而POLR3G则在未分化细胞中富集。POLR3G的耗竭会选择性触发前列腺癌细胞的增殖停滞和分化,而POLR3GL的耗竭则不会引起这些反应。一种小分子pol III抑制剂可以导致POLR3G的耗竭,并诱导类似的分化和抑制癌细胞的增殖和活力。这种反应涉及由Alu短散在核元件衍生的miRNA对命运决定因子NANOG的控制。体内肿瘤起始活性可以通过短暂暴露于pol III抑制剂来降低。未转化的前列腺细胞对pol III的耗竭或抑制似乎比癌细胞更不敏感,这为治疗提供了可能性[6]。

综上所述,POLR3G是RNA聚合酶III的一个重要亚基,参与转录小分子RNA,对于维持细胞的基本功能和基因表达的调控至关重要。POLR3G在细胞增殖、分化和癌症发生发展中发挥重要作用,并且其表达受到多种因素的调控。研究POLR3G的功能和调控机制有助于深入理解RNA聚合酶III的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Renaud, Marianne, Praz, Viviane, Vieu, Erwann, l'Hôte, Philippe, Hernandez, Nouria. 2013. Gene duplication and neofunctionalization: POLR3G and POLR3GL. In Genome research, 24, 37-51. doi:10.1101/gr.161570.113. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24107381/
2. Liu, Sijie, Hua, Yu, Wang, Jingna, Ji, Jianguo, Kong, Daochun. 2021. RNA polymerase III is required for the repair of DNA double-strand breaks by homologous recombination. In Cell, 184, 1314-1329.e10. doi:10.1016/j.cell.2021.01.048. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33626331/
3. Cheng, Ruiying, Zhou, Sihang, K C, Rajendra, Liu, Qing, Van Bortle, Kevin. 2023. A Combinatorial Regulatory Platform Determines Expression of RNA Polymerase III Subunit RPC7α (POLR3G) in Cancer. In Cancers, 15, . doi:10.3390/cancers15204995. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37894362/
4. Liu, Xianhui, Zhang, Weiyu, Wang, Huanrui, Xu, Kexin, Hu, Hao. 2020. Increased expression of POLR3G predicts poor prognosis in transitional cell carcinoma. In PeerJ, 8, e10281. doi:10.7717/peerj.10281. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33194434/
5. Lautré, Wiebke, Richard, Elodie, Feugeas, Jean-Paul, Dumay-Odelot, Hélène, Teichmann, Martin. 2022. The POLR3G Subunit of Human RNA Polymerase III Regulates Tumorigenesis and Metastasis in Triple-Negative Breast Cancer. In Cancers, 14, . doi:10.3390/cancers14235732. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36497214/
6. Van Bortle, Kevin, Marciano, David P, Liu, Qing, Kamakaka, Rohinton T, Snyder, Michael P. 2022. A cancer-associated RNA polymerase III identity drives robust transcription and expression of snaR-A noncoding RNA. In Nature communications, 13, 3007. doi:10.1038/s41467-022-30323-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35637192/