Sccpdh-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Sccpdh-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16386

品系全称

C57BL/6JCya-Sccpdhem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-109232-Sccpdh-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Sccpdh-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16386) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
saccharopine dehydrogenase (putative)
基因别称
C330023F11Rik
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_178653 | Ensembl: ENSMUST00000040538
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~10
敲除长度
~8.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Sccpdh基因,也称为磷酸丙酮酸脱氢酶α1(Pyruvate Dehydrogenase E1 Component Alpha 1),编码磷酸丙酮酸脱氢酶复合体的α1亚基。磷酸丙酮酸脱氢酶复合体在细胞能量代谢中发挥重要作用,它催化丙酮酸转化为乙酰辅酶A,进入三羧酸循环(TCA循环)以产生能量。Sccpdh基因的表达和功能与细胞周期调控、炎症反应和疾病发生等生物学过程密切相关。

参考文献[1]报道了一种名为单细胞多腺苷酸化测序(single-cell polyadenylation sequencing)的新技术,该技术可以用于研究细胞中不同多腺苷酸化位点的使用情况。研究发现,许多基因在整体数据中使用了多个多腺苷酸化位点,但在单个细胞中倾向于只使用一个多腺苷酸化位点。有趣的是,细胞周期基因在多腺苷酸化位点使用变化较大的基因中显著富集。此外,研究发现,在细胞同步化后,有414个基因的多腺苷酸化位点使用发生了改变,这些基因也主要富集于细胞周期基因。进一步研究发现,在相邻细胞周期中,有812个基因的多腺苷酸化位点使用发生了变化,这些基因被分为六个簇,每个簇中富集了细胞周期特异性功能类别。研究还发现,在Msl1和Sccpdh基因中删除一个多腺苷酸化位点会导致细胞周期进程变慢或变快,这表明多腺苷酸化位点使用的变化在细胞周期调控中发挥着重要作用[1]。

参考文献[2]通过整合生物信息学分析和机器学习技术,研究了妊娠高血压(PE)的诊断模型和免疫浸润。研究发现,F13a1和Sccpdh是PE诊断的潜在枢纽基因。研究还发现,PE组的浆细胞和活化的树突状细胞比例显著增加,而静止记忆CD4+ T细胞的比例降低[2]。

参考文献[3]通过转录组分析研究了远程缺血后处理(RIPostC)对心肌缺血再灌注损伤的影响。研究发现,RIPostC可以显著减少心肌梗死面积和心脏炎症因子IL-1β、IL-6的水平,并增加IL-10的水平。转录组分析显示,在RIPostC组中,ADAMTS15基因的表达水平上调,而Sccpdh基因的表达水平下调。研究发现,ADAMTS15的表达水平与心脏IL-1β和IL-6的水平呈负相关,与IL-10的水平呈正相关。这表明ADAMTS15可能是RIPostC调节心脏保护作用的一个潜在炎症相关基因,并可能成为心肌缺血再灌注损伤治疗的潜在靶点[3]。

综上所述,Sccpdh基因在细胞周期调控、炎症反应和疾病发生等生物学过程中发挥重要作用。Sccpdh基因的多腺苷酸化位点使用变化与细胞周期调控密切相关,而其表达水平的变化则与炎症反应和心肌缺血再灌注损伤等疾病发生相关。这些发现为深入理解Sccpdh基因的生物学功能和疾病发生机制提供了新的线索,并为疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Wang, Junliang, Chen, Wei, Yue, Wenjun, Ni, Ting, Jin, Wenfei. 2022. Comprehensive mapping of alternative polyadenylation site usage and its dynamics at single-cell resolution. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 119, e2113504119. doi:10.1073/pnas.2113504119. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36454750/
2. Zheng, Yihan, Fang, Zhuanji, Wu, Xizhu, Zhang, Huale, Sun, Pengming. 2024. Identification of hub genes, diagnostic model, and immune infiltration in preeclampsia by integrated bioinformatics analysis and machine learning. In BMC pregnancy and childbirth, 24, 847. doi:10.1186/s12884-024-07028-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39709373/
3. Zuo, Bo, Zhu, Sha, Wang, Guisong, Li, Zhengpeng. 2023. Transcriptome analysis reveals ADAMTS15 is a potential inflammation-related gene in remote ischemic postconditioning. In Frontiers in cardiovascular medicine, 10, 1089151. doi:10.3389/fcvm.2023.1089151. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37234367/