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Ddx21-KO 基因敲除小鼠

Ddx21-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ddx21-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16380

品系全称

C57BL/6JCya-Ddx21em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-56200-Ddx21-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Ddx21-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16380) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DExD box helicase 21
基因别称
D10Ertd645e，D10Wsu42e
染色体号
Chr 10 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_019553 | Ensembl: ENSMUST00000045866
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~11
敲除长度
~13.3 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1860494Mice homozygous for an ENU-induced allele exhibit embryonic lethality. Mice homozygous for a knock-out allele show embryonic growth retardation and complete embryonic lethality prior to organogenesis, with morula-like embryos failing to hatch from the zona pellucida and to form in vitro outgrowths.
更多信息
DDX21，也称为DEAD-box RNA解旋酶21，是DEAD-box RNA解旋酶家族中的一种重要成员。DEAD-box RNA解旋酶是RNA代谢中不可或缺的酶类，参与RNA的合成、加工、转运和降解等多个环节。DDX21在维持基因组稳定性、调控基因表达和细胞分化等方面发挥着重要作用。

在维持基因组稳定性方面，DDX21通过促进DNA损伤修复和解决R环，有助于保持基因组完整性。此外，DDX21还直接结合到启动子区域，与转录因子相互作用，并通过非编码RNA增强转录，从而在转录调控中发挥作用。在RNA代谢方面，DDX21参与RNA的加工、翻译和降解，确保RNA的正常功能和稳定性。值得注意的是，DDX21的活性和功能受到翻译后修饰的调控，如磷酸化等，这些修饰影响DDX21的定位和降解，从而进一步影响其生物学功能。

研究表明，DDX21在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。例如，在急性髓系白血病（AML）中，DDX21的表达水平升高，与患者的预后不良相关。研究显示，超增强子驱动的IGF2BP2和IGF2BP3通过m6A修饰依赖性方式上调DDX21的表达，进而促进AML的进展[2]。此外，在结直肠癌中，DDX21的高表达与患者的预后不良相关。研究发现，DDX21蛋白在结直肠癌细胞中发生相分离，并通过MCM5依赖性EMT途径促进结直肠癌的转移[1]。

DDX21在核糖体生物合成中也发挥着重要作用。研究发现，DDX21与RNA聚合酶I和II转录的基因以及多种RNA种类广泛相关，包括核糖体RNA、小核仁RNA（snoRNA）和7SK RNA等。在核仁中，DDX21占据转录的rDNA位点，直接接触rRNA和snoRNA，并促进rRNA的转录、加工和修饰。在核质中，DDX21结合7SK RNA，并作为7SK小核仁核糖核蛋白（snRNP）复合物的组成部分，被招募到RNA聚合酶II转录的基因启动子区域，促进转录[3]。此外，DDX21还参与调节RNA修饰和RNA聚合酶II延伸控制，进一步影响基因表达和细胞生长[4]。

综上所述，DDX21是一种重要的DEAD-box RNA解旋酶，参与调控基因表达、维持基因组稳定性和核糖体生物合成等生物学过程。DDX21在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用，包括AML和结直肠癌等。此外，DDX21在核糖体生物合成中也发挥着重要作用，影响基因表达和细胞生长。深入研究DDX21的生物学功能和调控机制，有助于揭示疾病的发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Gao, Huabin, Wei, Huiting, Yang, Yang, Wang, Jia, Han, Anjia. 2023. Phase separation of DDX21 promotes colorectal cancer metastasis via MCM5-dependent EMT pathway. In Oncogene, 42, 1704-1715. doi:10.1038/s41388-023-02687-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37029300/
2. Zhao, Yanchun, Zhou, Yutong, Qian, Yu, Sun, Jie, Jin, Jie. . m6A-dependent upregulation of DDX21 by super-enhancer-driven IGF2BP2 and IGF2BP3 facilitates progression of acute myeloid leukaemia. In Clinical and translational medicine, 14, e1628. doi:10.1002/ctm2.1628. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38572589/
3. Calo, Eliezer, Flynn, Ryan A, Martin, Lance, Chang, Howard Y, Wysocka, Joanna. 2014. RNA helicase DDX21 coordinates transcription and ribosomal RNA processing. In Nature, 518, 249-53. doi:10.1038/nature13923. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25470060/
4. Kim, Dae-Seok, Camacho, Cristel V, Nagari, Anusha, Challa, Sridevi, Kraus, W Lee. 2019. Activation of PARP-1 by snoRNAs Controls Ribosome Biogenesis and Cell Growth via the RNA Helicase DDX21. In Molecular cell, 75, 1270-1285.e14. doi:10.1016/j.molcel.2019.06.020. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31351877/

资料下载

S-KO-16380_6J_56200_Ddx21_Exon 2~11_strategy.pdf
S-KO-16380_6J_56200_Ddx21_Exon 2~11_strategy.pdf
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