Igk-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Igk-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16256

品系全称

C57BL/6NCya-Igkem1/Cya

品系背景

C57BL/6NCya

品系编号

KOCMP-243469-Igk-B6N-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Igk-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16256) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
immunoglobulin kappa chain complex
基因别称
kappa
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: -- | Ensembl: --
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
V and J segment (Igkv2-137 to Igkj5)
敲除长度
~3169 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:96494Mice homozygous for a knock-out allele exhibit abnormal B cell number and differentiation.
免疫球蛋白kappa链(Igκ)基因编码免疫球蛋白轻链,是B细胞成熟过程中重要的一部分。Igκ基因的重组对于B细胞受体(BCR)的多样性至关重要,BCR在识别和结合抗原中发挥核心作用。Igκ基因座位于人类2号染色体上,包含多个可变(V)、多样性(D)和连接(J)基因片段,这些片段通过V(D)J重组机制重新排列以产生具有高度多样性的Igκ链。重组过程中,重组激活基因(RAG)蛋白识别并切割基因片段两侧的重组信号序列(RSS),然后进行重排和连接,形成完整的Igκ基因。

Igκ基因的重组机制与免疫球蛋白重链(Igh)基因有所不同。在Igκ基因的重组过程中,RAG蛋白的扫描行为更加复杂,不仅涉及D基因片段的扫描,还涉及V基因片段的扫描,并且这些扫描过程可以通过不同的方式发生。此外,Igκ基因的重组还涉及到初级和次级重组,这些重组过程对于Igκ基因的多样性生成具有重要意义。相比之下,Igλ基因的重组则相对有限,其对于B细胞增殖的贡献似乎较小。

BIOMED-2项目的研究发现,通过结合使用IGH(VH-JH和DH-JH)和IGK管,可以检测几乎所有克隆的B细胞增殖,即使在具有高水平的体细胞突变的B细胞恶性肿瘤中也能检测到。这表明,IGH和IGK基因在B细胞克隆性研究中具有重要作用。此外,BIOMED-2项目还发现,TCRB和TCRG管的联合使用可以检测几乎所有克隆的T细胞群体,而TCRD管在TCRγδ阳性T细胞增殖的情况下具有额外价值。这些发现为克隆性评估和最小残留疾病的检测提供了重要的工具[1]。

在Igκ和Igh V(D)J连接机制的比较研究中,研究人员发现,RAG蛋白在Igκ和Igh基因座上的扫描行为存在差异。Igκ基因座上的Vκ-RSSs可以从不同方向的基因簇中捕获,这与Igh基因座上RAG蛋白的线性扫描行为不同。这种差异的机制可能与染色质结构、RSS的强度和位置以及RAG蛋白的相互作用等因素有关。这些发现为理解Igκ和Igh基因座上V(D)J重组的分子机制提供了新的视角[2]。

在研究Igκ和Igh基因座使用不同的折叠原理进行V基因重组的研究中,研究人员发现,在pro-B细胞和pre-B细胞中,由于它们独特的染色质结构,Igκ和Igh基因座使用不同的染色质折叠原理进行V基因重组。这种差异的机制可能与Wapl蛋白的表达水平、染色质环的形成和环内相互作用等因素有关。这些发现为理解Igκ和Igh基因座上V基因重组的染色质结构基础提供了新的证据[3]。

在研究BCR-ABL1激酶活性抑制对pre-B ALL细胞的影响的研究中,研究人员发现,STI571治疗可以诱导pre-B ALL细胞中IGK基因的重排,随后是KDE介导的Vκ-Jκ连接的删除,最终是IGL基因的重排。这一系列事件表明,BCR-ABL1激酶活性的抑制可以恢复pre-B细胞向成熟B细胞的分化过程,并揭示了Igκ和IGL基因重排的协调顺序[4]。

在研究小鼠中一种新的Igκ-V基因家族的研究中,研究人员发现,这个家族由一个或两个成员组成,这些成员之间有很高的序列相似性,表明它们在Igκ基因座的进化过程中是最近才分化的。这些发现为理解Igκ基因座的多样性和进化提供了新的线索[5]。

在研究Igκ和IGL基因重排在儿童B-ALL中的最小残留病(MRD)检测的研究中,研究人员发现,IGK/IGL基因重排可以识别5.5%没有可追踪IGH克隆的患者。IGH和IGK/IGL基因重排的符合率在EOI和EOC时分别为79.9%和81.0%。这些发现表明,IGH基因重排对于MRD的监测至关重要,而IGK和IGL基因重排的相对价值较小[6]。

在研究BIOMED-2协议在霍奇金淋巴瘤(HL)临床诊断中的应用的研究中,研究人员发现,BIOMED-2协议可以有效地检测IGK和IGL基因的克隆性重排,从而提高HL诊断的灵敏度和准确性。这些发现表明,BIOMED-2协议在HL的分子克隆性分析中具有潜在的应用价值[7]。

在研究基因重排与淋巴瘤诊断相关性的研究中,研究人员发现,IGK基因重排在淋巴瘤的诊断中具有重要作用。这些发现为淋巴瘤的早期诊断和指导治疗提供了重要的依据[8]。

在研究人类IGK基因座重组的研究中,研究人员发现,IGK基因座的重组过程是复杂且有序的,涉及到多种机制和因素的调节。这些发现为理解IGK基因座的重组机制和功能提供了重要的理论基础[9]。

综上所述,Igκ基因是B细胞成熟和BCR多样性生成的重要基因。Igκ基因的重组机制与Igh基因有所不同,并且涉及到初级和次级重组。BIOMED-2项目的研究表明,IGH和IGK基因在B细胞克隆性研究中具有重要作用。此外,Igκ基因的重组还与淋巴瘤的诊断和MRD的检测密切相关。这些发现为理解Igκ基因的功能和作用提供了重要的理论基础,并为淋巴瘤的诊断和治疗提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. van Dongen, J J M, Langerak, A W, Brüggemann, M, Kneba, M, Macintyre, E A. . Design and standardization of PCR primers and protocols for detection of clonal immunoglobulin and T-cell receptor gene recombinations in suspect lymphoproliferations: report of the BIOMED-2 Concerted Action BMH4-CT98-3936. In Leukemia, 17, 2257-317. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14671650/
2. Zhang, Yiwen, Li, Xiang, Ba, Zhaoqing, Alt, Frederick W, Hu, Hongli. 2024. Molecular basis for differential Igk versus Igh V(D)J joining mechanisms. In Nature, 630, 189-197. doi:10.1038/s41586-024-07477-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38811728/
3. Hill, Louisa, Wutz, Gordana, Jaritz, Markus, Goloborodko, Anton, Busslinger, Meinrad. 2023. Igh and Igk loci use different folding principles for V gene recombination due to distinct chromosomal architectures of pro-B and pre-B cells. In Nature communications, 14, 2316. doi:10.1038/s41467-023-37994-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37085514/
4. Klein, Florian, Feldhahn, Niklas, Mooster, Jana L, Wartenberg, Maria, Müschen, Markus. . Tracing the pre-B to immature B cell transition in human leukemia cells reveals a coordinated sequence of primary and secondary IGK gene rearrangement, IGK deletion, and IGL gene rearrangement. In Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 174, 367-75. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15611260/
5. Valiante, N M, Caton, A J. . A new Igk-V gene family in the mouse. In Immunogenetics, 32, 345-50. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2123475/
6. Chen, Haipin, Gu, Miner, Liang, Juan, Tang, Yongmin, Xu, Xiaojun. 2023. Minimal residual disease detection by next-generation sequencing of different immunoglobulin gene rearrangements in pediatric B-ALL. In Nature communications, 14, 7468. doi:10.1038/s41467-023-43171-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37978187/
7. Ghorbian, Saeid, Jahanzad, Issa, Javadi, Gholam Reza, Sakhinia, Ebrahim. 2015. Evaluation of IGK and IGL molecular gene rearrangements according to the BIOMED-2 protocols for clinical diagnosis of Hodgkin lymphoma. In Hematology (Amsterdam, Netherlands), 21, 133-7. doi:10.1179/1607845415Y.0000000035. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26183240/
8. He, Xiaoyan, Xu, Pei, Wang, Xianwei, Gong, Daoyin, Wu, Ning. . The association of gene rearrangement and lymphoma diagnosis: A prospective observational study. In Medicine, 99, e20733. doi:10.1097/MD.0000000000020733. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32541525/
9. Langerak, Anton W, van Dongen, Jacques J M. . Recombination in the human IGK locus. In Critical reviews in immunology, 26, 23-42. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16472067/