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Atg16l2-KO 基因敲除小鼠

Atg16l2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Atg16l2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16161

品系全称

C57BL/6JCya-Atg16l2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-73683-Atg16l2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Atg16l2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16161) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
autophagy related 16 like 2
基因别称
2410118P20Rik
染色体号
Chr 7 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_001111111 | Ensembl: ENSMUST00000120267
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.1 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1920933Mice homozygous for an ENU-induced allele exhibit lymphopenia.
更多信息
Atg16l2是自噬相关基因家族成员之一，编码自噬体形成的核心蛋白。自噬是一种重要的细胞内降解和回收过程，对于维持细胞内稳态和细胞功能至关重要。Atg16l2在自噬体的形成和成熟过程中起着关键作用，其表达和功能的异常与多种疾病的发生和发展密切相关。

多篇研究报道了Atg16l2与克罗恩病（CD）的关联。例如，一项研究发现，ATG16L2基因的单核苷酸多态性（SNP）rs11235604与CD在中国的发病率显著相关。与正常志愿者相比，CD患者中TT基因型的比例显著升高，而ATG16L2的mRNA表达水平显著降低。这些结果表明，ATG16L2基因的变异与CD的发病风险增加和ATG16L2表达下调有关[1]。

此外，Atg16l2还与其他多种疾病相关。一项研究发现，基于TCGA和GTEx数据库的基因表达数据分析，ATG16L2基因的表达与胰腺癌患者的预后相关。ATG16L2基因的表达水平在胰腺癌组织中显著降低，并且与患者的生存期相关。进一步分析发现，ATG16L2基因的表达与肿瘤微环境中的免疫细胞浸润有关，提示ATG16L2可能在胰腺癌的发生和发展中发挥作用[2]。

另一项研究发现，NR3C1/Glucocorticoid受体激活可以促进β细胞在葡萄糖脂毒性条件下的过度自噬，导致胰岛素分泌受损和糖尿病的发生。研究还发现，NR3C1激活上调了FTO蛋白的表达，进而导致ATG16L2等自噬相关基因的mRNA上的m6A修饰减少，进而引起过度自噬。此外，FTO抑制可以预防NR3C1诱导的过度自噬激活，并改善胰岛素分泌和葡萄糖耐量[3]。

在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中，ATG16L2基因的变异也与放射治疗后的预后相关。研究发现，ATG16L2基因的rs10898880 CC变异基因型与NSCLC患者更好的局部无复发生存（LRFS）、无进展生存（PFS）和总生存（OS）相关，但与严重放射性肺炎（RP）的发生风险增加相关。这表明ATG16L2基因的变异可能影响NSCLC患者的放疗预后[4]。

此外，ATG16L2和ATG16L1基因在组织特异性上具有不同的功能。ATG16L1主要在淋巴样和上皮细胞中发挥作用，而ATG16L2主要在髓样细胞中发挥作用。在ATG16L2敲除小鼠模型中，研究者发现ATG16L2的缺失导致髓样细胞中自噬的显著下调，而淋巴样和上皮细胞中的自噬水平没有明显变化。这表明ATG16L1和ATG16L2在细胞谱系中具有不同的功能，并可能对克罗恩病和系统性红斑狼疮等复杂疾病的发生和发展产生不同的影响[5]。

在宫颈癌中，ATG16L2基因的表达水平显著下调，并且与患者的预后相关。ATG16L2基因的低表达与较差的生存期相关，并且与免疫通路中的巨噬细胞、B细胞、肥大细胞活化以及肿瘤相关成纤维细胞的浸润水平相关。这表明ATG16L2可能在宫颈癌的发生和发展中发挥作用，并可能与肿瘤微环境中的免疫细胞浸润相关[6]。

在多发性硬化症（MS）中，ATG16L2基因的表达水平也发生了改变。研究发现，与年龄和性别匹配的健康对照组相比，MS患者的ATG16L2基因表达水平显著升高。这表明自噬相关基因的表达改变可能与MS的发病机制相关，并可能影响T细胞的生存[7]。

此外，还有研究表明，ATG16L2基因的表达与蛋白质表达水平之间存在着调控关系。研究发现，ATG16L2基因的5'非翻译区（5' UTR）中的AUG序列与起始密码子的距离会影响蛋白质的表达水平。当AUG序列位于5' UTR中时，蛋白质的表达水平会受到抑制，并且当存在多个AUG序列时，这种抑制作用会更加明显[8]。

综上所述，Atg16l2基因在自噬体的形成和成熟过程中起着重要作用，并且与多种疾病的发生和发展相关。ATG16L2基因的变异和表达水平的改变可能影响自噬的活性，进而影响细胞功能和疾病的发生。进一步研究ATG16L2基因的功能和调控机制，有助于深入理解自噬在疾病发生发展中的作用，并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Ma, T, Wu, S, Yan, W, Xie, R, Zhou, C. . A functional variant of ATG16L2 is associated with Crohn's disease in the Chinese population. In Colorectal disease : the official journal of the Association of Coloproctology of Great Britain and Ireland, 18, O420-O426. doi:10.1111/codi.13507. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27611316/
2. Zhou, Qing, Chen, Xi, Chen, Qiuyan, Liu, Haosheng, Hao, Lu. . A Four Autophagy-Related Gene-Based Prognostic Signature for Pancreatic Cancer. In Critical reviews in eukaryotic gene expression, 31, 89-100. doi:10.1615/CritRevEukaryotGeneExpr.2021038733. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34587439/
3. Wu, Tijun, Shao, Yixue, Li, Xirui, Chen, Fang, Han, Xiao. 2023. NR3C1/Glucocorticoid receptor activation promotes pancreatic β-cell autophagy overload in response to glucolipotoxicity. In Autophagy, 19, 2538-2557. doi:10.1080/15548627.2023.2200625. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37039556/
4. Wen, Juyi, Liu, Hongliang, Wang, Lili, Liao, Zhongxing, Wei, Qingyi. 2018. Potentially Functional Variants of ATG16L2 Predict Radiation Pneumonitis and Outcomes in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer after Definitive Radiotherapy. In Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer, 13, 660-675. doi:10.1016/j.jtho.2018.01.028. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29454863/
5. Khor, Bernard, Conway, Kara L, Omar, Abdifatah S, Regev, Aviv, Xavier, Ramnik J. 2019. Distinct Tissue-Specific Roles for the Disease-Associated Autophagy Genes ATG16L2 and ATG16L1. In Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950), 203, 1820-1829. doi:10.4049/jimmunol.1800419. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31451676/
6. Li, Shuzhen, Gao, Kun, Yao, Desheng. . Comprehensive analysis of autophagy associated genes and immune infiltrates in cervical cancer. In Iranian journal of basic medical sciences, 27, 813-824. doi:10.22038/IJBMS.2024.74431.16168. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38800011/
7. Igci, Mehri, Baysan, Mehmet, Yigiter, Remzi, Bayram, Ali, Cakmak, Ecir Ali. 2016. Gene expression profiles of autophagy-related genes in multiple sclerosis. In Gene, 588, 38-46. doi:10.1016/j.gene.2016.04.042. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27125224/
8. Al-Ali, Ruslan, González-Sarmiento, Rogelio. 2016. Proximity of AUG sequences to initiation codon in genomic 5' UTR regulates mammalian protein expression. In Gene, 594, 268-271. doi:10.1016/j.gene.2016.08.052. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27613142/

资料下载

S-KO-16161_6J_73683_Atg16l2_Exon 3_strategy.pdf
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