Ccbe1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Ccbe1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-16096

品系全称

C57BL/6JCya-Ccbe1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-320924-Ccbe1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ccbe1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-16096) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
collagen and calcium binding EGF domains 1
基因别称
4933426F18Rik,9430093N24Rik,mKIAA1983
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_178793 | Ensembl: ENSMUST00000130300
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2445053Mice homozygous for a knock-out allele exhibit prenatal lethality associated with edema and absence of lymphatic vessels.
Ccbe1,即胶原蛋白和钙结合EGF结构域1基因,编码一种分泌蛋白,在发育过程中对淋巴管生成至关重要。Ccbe1通过增强血管内皮生长因子C(VEGF-C)的信号传导,促进淋巴管生成。人类患者中,Ccbe1基因突变会导致Hennekam综合征,这是一种遗传性疾病,其特征为淋巴系统畸形,表现为原发性淋巴水肿、淋巴管扩张和心脏缺陷等症状。在过去的十年中,Ccbe1在心脏发育中的重要作用逐渐被揭示。在老鼠中,Ccbe1的表达最初在特定的心脏祖细胞中被检测到,如第一和第二心脏场以及原心外膜。最近,Ccbe1的表达在E11.5-E13.5阶段的心外膜和静脉窦心肌中被发现,此时静脉窦内皮细胞来源的冠状动脉开始形成。因此,Ccbe1对冠状动脉和冠状动脉干的形成至关重要。此外,Ccbe1在老鼠胚胎干细胞(ESC)中富集,并被证明是ESC衍生早期心脏前体细胞谱系分化所必需的新基因[1]。

Ccbe1基因的突变导致Hennekam淋巴管扩张-淋巴水肿综合征。使用先进的生物信息学方法,研究发现了一些最危险的nsSNPs,这些nsSNPs可能影响Ccbe1的结构和功能。研究结果表明,7个nsSNPs(rs115982879、rs149792489、rs374941368、rs121908254、rs149531418、rs121908251和rs372499913)对Ccbe1基因是有害的,其中4个(G330E、C102S、C174R和G107D)是非常有害的,其中2个(G330E和G107D)在Hennekam综合征的背景下从未被报道过。12个错义SNPs(rs199902030、rs267605221、rs37517418、rs80008675、rs116596858、rs116675104、rs121908252、rs147974432、rs147681552、rs192224843、rs139059968和rs148498685)被发现会变成终止密码子。基于结构同源性和序列同源性的方法揭示了8.8%的nsSNPs是有害的。SIFT、PolyPhen2、M-CAP、CADD、FATHMM-MKL、DANN、PANTHER、Mutation Taster、LRT和SNAP2等方法对识别有害的nsSNPs具有重要意义。rs374941368和rs200149541在预测翻译后改变中的重要性得到了强调,因为它影响了一个可能的磷酸化位点。基因-基因相互作用揭示了Ccbe1与其他基因的关联,表明它在许多途径和共表达中发挥作用。该研究发现的16个最危险的nsSNPs应在未来进行进一步研究,以便在研究Hennekam综合征等Ccbe1基因引起的疾病时提供潜在见解。Ccbe1蛋白在Hennekam综合征患者中应在动物模型中进行测试,以实现这一目的[2]。

此外,研究还发现Ccbe1的表达与直肠癌患者的预后相关。与对照组相比,实验组中SLP-2的阳性表达率显著升高(68.0% vs. 24.0%,p<0.05),SLP-2的mRNA也显著增加(p<0.05)。与对照组相比,实验组中Ccbe1的蛋白表达也显著升高(p<0.05)。此外,SLP-2的表达水平与TNM分级和淋巴转移显著相关。进一步分析表明,Ccbe1的阳性表达与淋巴转移、淋巴管密度(LVD)和Ducks分级相关,并与生存率呈负相关。SLP-2表达的升高通过上调Ccbe1促进了淋巴管的形成,并加剧了直肠癌的淋巴转移。作为与淋巴转移相关的风险因素,Ccbe1可能是直肠癌诊断和预后的新型生物标志物[3]。

Ccbe1基因的表达在直肠癌肿瘤和邻近淋巴管组织中上调,并促进淋巴管生成和淋巴转移。SLP-2和Ccbe1的表达水平在肿瘤淋巴组织中显著升高,与邻近组织相比,差异有统计学意义。SLP-2和Ccbe1之间存在着统计学上的正相关(p<0.05)。通过siRNA下调SLP-2表达抑制细胞增殖,升高caspase3活性,并降低Ccbe1表达(与空白对照组相比,p<0.05)。SLP-2在RC淋巴组织中上调,并与Ccbe1的水平呈正相关,为开发针对SLP-2的抗RC治疗药物提供了学术基础[4]。

综上所述,Ccbe1在心脏发育和疾病中发挥着重要作用,其突变与Hennekam综合征的发生密切相关。Ccbe1在淋巴管生成和淋巴转移中也起着关键作用,与直肠癌的预后相关。此外,Ccbe1还与多种疾病的发生和发展相关,包括动脉粥样硬化、糖尿病心肌病、结直肠癌和Wilms瘤。Ccbe1的研究有助于深入理解其在心脏发育和疾病中的作用机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Bonet, Fernando, Inácio, José M, Bover, Oriol, Añez, Sabrina B, Belo, José A. 2022. CCBE1 in Cardiac Development and Disease. In Frontiers in genetics, 13, 836694. doi:10.3389/fgene.2022.836694. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35222551/
2. Shinwari, Khyber, Guojun, Liu, Deryabina, Svetlana S, Tuzankina, Irina A, Chereshnev, Valery A. 2021. Predicting the Most Deleterious Missense Nonsynonymous Single-Nucleotide Polymorphisms of Hennekam Syndrome-Causing CCBE1 Gene, In Silico Analysis. In TheScientificWorldJournal, 2021, 6642626. doi:10.1155/2021/6642626. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34234628/
3. Zhang, L, Liu, F-J. . Expression of SLP-2 gene and CCBE1 are associated with prognosis of rectal cancer. In European review for medical and pharmacological sciences, 21, 1214-1218. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28387911/
4. Guo, R-L, Wang, X-R, Wang, Q-G, Miao, R-Z, Chang, H. . The regulatory role of SLP-2 and mechanism on CCBE1 gene expression in rectal carcinoma and adjacent lymphatic tube tissues. In European review for medical and pharmacological sciences, 22, 87-94. doi:10.26355/eurrev_201801_14104. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29364474/