Bod1l-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Bod1l-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15979

品系全称

C57BL/6JCya-Bod1lem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-665775-Bod1l-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Bod1l-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15979) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
biorientation of chromosomes in cell division 1-like
基因别称
A230054D04Rik,FAM44A,mKIAA1327
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081422 | Ensembl: ENSMUST00000050556
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~3.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2444804mice homozygous for a conditional allele activated in B cells exhibit reduced Ig serum levels and class switch recombination.
BOD1L,也称为Bromodomain-containing protein 1-like,是一种在细胞内发挥重要功能的蛋白质。它在染色质调控、DNA损伤修复以及细胞分裂等方面扮演着关键角色。BOD1L含有多个功能域,其中包括Shg1域,该域具有DNA结合能力,并在BOD1L与组蛋白H3K4甲基转移酶SETD1A的相互作用中发挥重要作用。

SETD1A是一种H3K4甲基转移酶,它在细胞发育和癌症发生中发挥着重要作用。研究表明,BOD1L能够介导SETD1A与染色质的结合,并调节SETD1A的非典型功能,从而影响基因转录。在人类癌细胞系中,BOD1L与SETD1A的协同依赖性最高,其敲除可以减少白血病细胞的数量,并模拟SETD1A敲除细胞中的转录组变化。BOD1L的缺失导致SETD1A在转录起始位点(TSS)的分布减少,并引起转录延伸缺陷,同时增加RNA聚合酶II在TSS的含量。然而,BOD1L的缺失并没有降低组蛋白H3K4me3的水平。BOD1L的Shg1域中的色氨酸残基(W104)能够通过与其FLOS域的关联,招募SETD1A到染色质上。此外,BOD1L-SETD1A复合物还与转录调控因子,如E2Fs相关联,进一步揭示了BOD1L在转录调控中的作用[1]。

在两栖动物中,性别决定机制一直是一个研究的热点。最近的研究发现,BOD1L基因在两栖动物的性别决定中发挥着重要作用。在一种非模式两栖动物,欧洲绿蟾蜍(Bufo(tes) viridis)中,通过染色体规模的雌雄基因组分析,发现BOD1L基因的5'-调控区域存在X/Y染色体结构差异。在雄性中,存在一个Y特异性非编码RNA(ncRNA-Y),只在雄性中表达,这表明BOD1L基因在性别决定中发挥重要作用。发育转录组和RNA原位杂交分析显示,ncRNA-Y和BOD1L基因的表达在原始性腺中具有时间和空间上的相关性。此外,研究发现,在原始颗粒细胞/前Sertoli细胞中,BOD1L基因的表达与H3K4me3的甲基化水平存在差异,这进一步支持了BOD1L在两栖动物性别决定中的作用[2]。

在乳腺癌中,BOD1L基因的表达和扩增与肿瘤的发生和发展密切相关。研究发现,乳腺癌组织中BOD1L基因的表达显著升高,并且与肿瘤的大小相关。此外,研究发现BOD1L基因的扩增与乳腺癌的发生和发展也相关。然而,研究发现BOD1L基因的表达与NuMA基因的表达之间没有明显的相关性,这表明BOD1L基因和NuMA基因在乳腺癌的发生和发展中可能存在独立的作用机制[3]。

在食管鳞状细胞癌(ESCC)中,BOD1L基因的突变也与疾病的发生相关。研究发现,在ESCC患者中,BOD1L基因存在一种新的有害突变,该突变位于β螺旋桨域的刀片区域。该突变与RAD51基因的突变相关,RAD51基因在DNA损伤修复和DNA复制中发挥着重要作用。此外,研究发现BOD1L基因的突变与BRCA1、BRCA2、FANCA、FANCD2等基因的突变也相关,这些基因在DNA损伤修复和DNA复制中也发挥着重要作用。这些发现表明,BOD1L基因的突变可能在ESCC的发生和发展中发挥重要作用[4]。

在DNA复制过程中,RAD51基因发挥着重要作用,它能够促进同源重组修复(HR)和复制叉的保护。研究发现,RADX基因能够调节RAD51的活性,从而控制复制叉的保护。沉默RADX基因可以恢复BRCA1、BRCA2、FANCA、FANCD2或BOD1L基因缺陷细胞中的复制叉保护。此外,RADX基因的过表达会导致复制叉的降解,这种降解依赖于MRE11和DNA2基因。这些发现表明,RADX基因通过调节RAD51的活性来控制复制叉的保护,从而维持基因组的稳定性[5]。

综上所述,BOD1L基因在细胞内发挥重要作用,参与染色质调控、DNA损伤修复以及细胞分裂等生物学过程。BOD1L基因在多种疾病中发挥重要作用,包括白血病、两栖动物的性别决定、乳腺癌和食管鳞状细胞癌。此外,BOD1L基因还与DNA复制和复制叉的保护密切相关。对BOD1L基因的研究有助于深入理解其在细胞内的重要功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1,2,3,4,5]。

参考文献:
1. Hoshii, Takayuki, Kikuchi, Sota, Kujirai, Tomoya, Kurumizaka, Hitoshi, Kaneda, Atsushi. . BOD1L mediates chromatin binding and non-canonical function of H3K4 methyltransferase SETD1A. In Nucleic acids research, 52, 9463-9480. doi:10.1093/nar/gkae605. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38989615/
2. Kuhl, Heiner, Tan, Wen Hui, Klopp, Christophe, Winkler, Christoph, Stöck, Matthias. 2024. A candidate sex determination locus in amphibians which evolved by structural variation between X- and Y-chromosomes. In Nature communications, 15, 4781. doi:10.1038/s41467-024-49025-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38839766/
3. Mohamadalizadeh-Hanjani, Zeinab, Shahbazi, Shirin, Geranpayeh, Loabat. 2020. Investigation of the SPAG5 gene expression and amplification related to the NuMA mRNA levels in breast ductal carcinoma. In World journal of surgical oncology, 18, 225. doi:10.1186/s12957-020-02001-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32838814/
4. Golyan, Fatemeh Fardi, Moghaddassian, Morteza, Forghanifard, Mohammad Mahdi, Mahmoudian, Reihaneh Alsadat, Abbaszadegan, Mohammad Reza. . Whole Exome Sequencing Reveals a Novel Damaging Mutation in Human Fibroblast Activation Protein in a Family with Esophageal Squamous Cell Carcinoma. In Journal of gastrointestinal cancer, 51, 179-188. doi:10.1007/s12029-019-00224-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30957200/
5. Bhat, Kamakoti P, Krishnamoorthy, Archana, Dungrawala, Huzefa, Modesti, Mauro, Cortez, David. . RADX Modulates RAD51 Activity to Control Replication Fork Protection. In Cell reports, 24, 538-545. doi:10.1016/j.celrep.2018.06.061. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30021152/