Aga-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Aga-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15928

品系全称

C57BL/6JCya-Agaem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-11593-Aga-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Aga-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15928) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
aspartylglucosaminidase
基因别称
-
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001005847 | Ensembl: ENSMUST00000033920
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~7
敲除长度
~7.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:104873Mice homozygous for targeted mutations that inactivate this gene die prematurely and share most of the clinical, biochemical and histopathological characteristics of human aspartylglycosaminuria.
基因AGA,在生物信息学中通常指的是编码精氨酸的密码子AGA。精氨酸是20种标准氨基酸之一,对于蛋白质的结构和功能至关重要。AGA和它的同义密码子AGG在细菌和人类基因中较少使用,这种现象称为密码子使用偏差(Codon Usage Bias,CUB)。CUB是生物体在进化过程中对环境适应的结果,它反映了基因表达调控的复杂性。

在细菌中,AGA和AGG密码子的使用对基因表达有显著影响。例如,在Escherichia coli中,AGA和AGG密码子是使用最少的密码子之一,通常出现在基因起始密码子的前25个密码子内。研究发现,含有AGA/AGG密码子的基因与多种重要的细胞功能相关[2]。此外,AGA/AGG密码子的存在可以抑制基因表达,尤其是在基因的起始区域。这种抑制可以通过共表达编码特定tRNA的基因或改变AGA/AGG密码子的位置来减轻[2]。

在人类基因中,AGA密码子的使用也表现出一些有趣的特征。例如,TP73基因,作为TP53基因家族的成员,与p53基因有很高的同源性,并在癌症研究中起着关键作用。TP73基因的密码子使用分析表明,该基因富含GC,且在进化过程中自然选择对AGA和ATA密码子产生了负选择[3]。此外,AGA密码子的存在与蛋白质的疏水性和长度相关,表明CUB可能影响蛋白质的结构和功能[3]。

在Drosophila的线粒体基因组中,AGA密码子具有独特的功能。与哺乳动物不同,Drosophila的AGA密码子编码的是丝氨酸而不是精氨酸,或者在某些情况下作为终止密码子。这种密码子的重新定义可能是由于Drosophila线粒体中缺乏特定tRNA来识别AGA密码子[4]。

AGA密码子也与其他生物学过程相关。例如,在雄激素性脱发(AGA)的研究中,发现女性AGA患者与雄激素受体基因(AR)的基因多态性没有关联,这与男性AGA的情况不同[1]。这表明AGA密码子可能与性别特异性疾病的遗传背景有关。

综上所述,AGA密码子作为一种较少使用的密码子,在细菌和人类基因中表现出独特的生物学特性。它不仅影响基因表达,还可能与蛋白质的结构、功能以及疾病的遗传背景相关。AGA密码子的研究有助于我们更好地理解基因表达调控的复杂性以及疾病发生的分子机制。

参考文献:
1. el-Samahy, May H, Shaheen, Maha A, Saddik, Dina E B, Mahran, Manal Z, Shehab, Abeer A A. . Evaluation of androgen receptor gene as a candidate gene in female androgenetic alopecia. In International journal of dermatology, 48, 584-7. doi:10.1111/j.1365-4632.2009.03991.x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19538365/
2. Chen, G T, Inouye, M. . Role of the AGA/AGG codons, the rarest codons in global gene expression in Escherichia coli. In Genes & development, 8, 2641-52. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7958922/
3. Barbhuiya, Parvin A, Uddin, Arif, Chakraborty, Supriyo. 2018. Compositional properties and codon usage of TP73 gene family. In Gene, 683, 159-168. doi:10.1016/j.gene.2018.10.030. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30316927/
4. Clary, D O, Wolstenholme, D R. . The Drosophila mitochondrial genome. In Oxford surveys on eukaryotic genes, 1, 1-35. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6400770/