Exd2-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Exd2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15598

品系全称

C57BL/6JCya-Exd2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-97827-Exd2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Exd2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15598) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
exonuclease 3'-5' domain containing 2
基因别称
4930539P14Rik,Exdl2
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_133798.3 | Ensembl: ENSMUST00000038185
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~2.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Exd2,即exonuclease 3'-5' domain-containing 2,是一种重要的核酸酶,在细胞中发挥多种生物学功能。Exd2的蛋白质结构包含一个3'-5'外切酶结构域,使其能够降解RNA分子。Exd2在多种细胞过程中发挥重要作用,包括转录、DNA损伤修复、细胞代谢和生殖细胞维持。

在转录过程中,Exd2与RNA聚合酶II(RNAPII)相互作用,促进新生mRNA的降解,从而影响基因表达。研究表明,Exd2在DNA损伤修复过程中发挥重要作用。当细胞受到DNA损伤时,Exd2会从线粒体转移到细胞核,并与RNAPII相互作用,促进新生mRNA的降解,从而允许转录在DNA修复后重新启动。

此外,Exd2还在细胞代谢中发挥重要作用。研究表明,Exd2可以防止mRNA与线粒体核糖体的异常结合,从而维持线粒体翻译的完整性。在生殖细胞中,Exd2对于维持生殖干细胞的稳态和寿命至关重要。Exd2可以促进线粒体核糖体的完整性和翻译,从而维持生殖干细胞的代谢和功能。

以下是一些关于Exd2的研究,以进一步了解其在细胞生物学中的作用:

1. Sandoz等人(2023)发现,Exd2核酸酶在DNA损伤修复过程中发挥重要作用。当细胞受到紫外线照射时,Exd2会从线粒体转移到细胞核,并与RNAPII相互作用,促进新生mRNA的降解,从而允许转录在DNA修复后重新启动。此外,Exd2还可以促进DNA损伤修复过程中转录的恢复,从而提高细胞存活率[1]。

2. Silva等人(2018)发现,Exd2在维持生殖干细胞的稳态和寿命中发挥重要作用。Exd2可以防止mRNA与线粒体核糖体的异常结合,从而维持线粒体翻译的完整性。此外,Exd2还可以促进线粒体核糖体的完整性和翻译,从而维持生殖干细胞的代谢和功能[2]。

3. Pallotti等人(2023)通过对南美骆驼的基因组扫描,发现Exd2基因在骆驼中存在多个纯合性片段。这些纯合性片段可能对骆驼的适应性进化产生了影响[3]。

4. Cuykendall和Houston(2010)发现,Exd2在非洲爪蟾卵母细胞中表达,并且与生殖细胞谱系有关。此外,Exd2的3'非编码区(3'UTR)中存在保守的定位基序,这些基序可能参与Exd2的定位[4]。

5. Sindelka等人(2018)发现,Exd2在非洲爪蟾卵母细胞中存在非对称分布。Exd2的mRNA主要在动物极区域表达,而蛋白质则主要在细胞质中表达。这种非对称分布可能对非洲爪蟾的发育计划产生影响[8]。

6. Sigdel等人(2020)发现,Exd2基因与奶牛在热应激条件下的繁殖性能有关。Exd2基因的变异可能与奶牛在热应激条件下的繁殖能力有关[5]。

7. Biehs等人(2017)发现,Exd2在G1期细胞中参与DNA双链断裂(DSB)的修复。Exd2可以促进DSB的切割,从而促进DNA损伤的修复。此外,Exd2还可以影响DNA损伤修复过程中染色体的不稳定性[6]。

8. Oehl-Jaschkowitz等人(2013)发现,Exd2基因的缺失与先天性心脏病、短指(趾)和轻度智力障碍有关。Exd2基因的缺失可能导致这些临床表型的发生[7]。

综上所述,Exd2是一种重要的核酸酶,在细胞中发挥多种生物学功能。Exd2在转录、DNA损伤修复、细胞代谢和生殖细胞维持等方面发挥重要作用。Exd2的研究有助于深入理解其在细胞生物学中的作用,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Sandoz, Jérémy, Cigrang, Max, Zachayus, Amélie, Compe, Emmanuel, Coin, Frédéric. 2023. Active mRNA degradation by EXD2 nuclease elicits recovery of transcription after genotoxic stress. In Nature communications, 14, 341. doi:10.1038/s41467-023-35922-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36670096/
2. Silva, Joana, Aivio, Suvi, Knobel, Philip A, Yanes, Oscar, Stracker, Travis H. 2018. EXD2 governs germ stem cell homeostasis and lifespan by promoting mitoribosome integrity and translation. In Nature cell biology, 20, 162-174. doi:10.1038/s41556-017-0016-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29335528/
3. Pallotti, Stefano, Picciolini, Matteo, Antonini, Marco, Renieri, Carlo, Napolioni, Valerio. 2023. Genome-wide scan for runs of homozygosity in South American Camelids. In BMC genomics, 24, 470. doi:10.1186/s12864-023-09547-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37605116/
4. Cuykendall, Tawny N, Houston, Douglas W. . Identification of germ plasm-associated transcripts by microarray analysis of Xenopus vegetal cortex RNA. In Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 239, 1838-48. doi:10.1002/dvdy.22304. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20503379/
5. Sigdel, A, Liu, L, Abdollahi-Arpanahi, R, Aguilar, I, Peñagaricano, F. 2020. Genetic dissection of reproductive performance of dairy cows under heat stress. In Animal genetics, 51, 511-520. doi:10.1111/age.12943. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32363588/
6. Biehs, Ronja, Steinlage, Monika, Barton, Olivia, Jeggo, Penny A, Löbrich, Markus. 2017. DNA Double-Strand Break Resection Occurs during Non-homologous End Joining in G1 but Is Distinct from Resection during Homologous Recombination. In Molecular cell, 65, 671-684.e5. doi:10.1016/j.molcel.2016.12.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28132842/
7. Oehl-Jaschkowitz, Barbara, Vanakker, Olivier M, De Paepe, Anne, McKee, Shane, Tzschach, Andreas. 2013. Deletions in 14q24.1q24.3 are associated with congenital heart defects, brachydactyly, and mild intellectual disability. In American journal of medical genetics. Part A, 164A, 620-6. doi:10.1002/ajmg.a.36321. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24357125/
8. Sindelka, Radek, Abaffy, Pavel, Qu, Yanyan, Dovichi, Norman, Kubista, Mikael. 2018. Asymmetric distribution of biomolecules of maternal origin in the Xenopus laevis egg and their impact on the developmental plan. In Scientific reports, 8, 8315. doi:10.1038/s41598-018-26592-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29844480/