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Tmem40-KO 基因敲除小鼠
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基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
transmembrane protein 40
基因别称
9030407H20Rik
染色体号
Chr 6 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_144805 | Ensembl: ENSMUST00000072933
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~12
敲除长度
~13.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
TMEM40，全称为Transmembrane protein 40，是一种定位于细胞膜的蛋白质。虽然其具体的生物学功能和作用机制尚不完全清楚，但现有研究已揭示其在多种疾病中扮演着重要的角色。
研究表明，TMEM40在皮肤鳞状细胞癌（CSCC）中表达水平升高，与肿瘤大小相关。在CSCC细胞系中，沉默TMEM40基因的表达可以导致细胞周期停滞在G0/G1期，促进细胞凋亡，并显著抑制细胞迁移和侵袭[1]。此外，TMEM40在膀胱癌中同样呈现高表达，其表达水平与膀胱癌的病理分级、临床分期和pT状态相关。沉默TMEM40的表达可以抑制膀胱癌细胞增殖，阻断G1期向S期的细胞周期转换，并抑制细胞迁移和侵袭。TMEM40的敲低还导致p53和p21蛋白的积累，以及c-MYC和细胞周期蛋白D1蛋白的减少，表明TMEM40可能是一种潜在的致癌基因，在膀胱癌的发生发展中起着重要作用[2]。
在胰腺导管腺癌（PDAC）的研究中，TMEM40被确定为一种与PDAC转移潜能相关的基因。高转移潜能的PDAC亚克隆特征性地表现出IL-1信号通路基因的激活，以及NF-κB和Zeb/Snail家族的高活性。而低转移潜能的亚克隆则特征性地表现出神经内分泌、运动和Wnt通路基因的激活，以及CDX2和HOXA13的高活性。在功能筛选中，研究者验证了TMEM40在PDAC转移中的作用，并发现TMEM40的表达与人类PDAC肿瘤的转移潜能相关[3]。
在额颞叶变性（FTLD）的研究中，携带GRN基因突变的患者的白细胞中TMEM40的表达水平显著升高。TMEM40表达水平越高，患者顶叶的损伤越严重。这表明，TMEM40可能参与了FTLD的病理过程，或者作为一种代偿机制，对抗疾病的进展[4]。
在舌鳞状细胞癌（TSCC）的研究中，TMEM40的表达水平也显著升高。TMEM40的表达与TSCC的TNM分期、组织学分级和临床分期呈正相关。此外，TMEM40的过表达或敲低可以显著影响TSCC细胞的增殖、凋亡、迁移和侵袭。TMEM40的敲低还导致p53和Bax蛋白水平的升高，以及MMP-9蛋白水平的降低，表明TMEM40可能通过p53、Bax和MMP-9参与TSCC细胞的凋亡和迁移调控[5]。
在肾透明细胞癌（ccRCC）的研究中，miR-138-5p的表达水平显著下调，而TMEM40的表达水平显著上调。TMEM40的表达与miR-138-5p的表达呈负相关。miR-138-5p的过表达或TMEM40的敲低可以显著抑制ccRCC细胞的增殖、迁移和侵袭。实验证实，miR-138-5p可以直接识别TMEM40转录本的3'-UTR并下调其表达，表明miR-138-5p可能通过直接靶向TMEM40发挥抑癌作用[6]。
此外，TMEM40还与肝细胞癌（HCC）的诊断相关。在HCC患者的周围血单个核细胞（PBMCs）中，TMEM40的表达水平显著升高。TMEM40与其他几个基因一起，被确定为HCC诊断的潜在生物标志物[7]。
在心脏疾病的研究中，TMEM40的基因多态性与左心室射血分数（EF）相关。研究发现，TMEM40的基因多态性与EF的遗传变异相关，这为理解EF的病理生理机制和开发新的治疗方法提供了重要线索[8]。
最后，在宫颈癌的研究中，TMEM40的表达水平在鳞状细胞癌（SCC）和腺癌（ADC）亚型之间存在差异。TMEM40在SCC中的表达水平显著低于ADC。此外，TMEM40的表达水平与宫颈癌患者的总生存期（OS）相关。这些发现提示，TMEM40可能是一种有潜力的宫颈癌预后生物标志物[9]。
在牛的生长效率研究中，TMEM40的基因多态性被发现与平均日增重（ADG）和干物质摄入量（DMI）相关。这表明，TMEM40可能在牛的生长效率中发挥重要作用[10]。
综上所述，TMEM40在多种疾病中发挥着重要的生物学功能，包括皮肤鳞状细胞癌、膀胱癌、胰腺导管腺癌、额颞叶变性、舌鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肝细胞癌、心脏疾病和宫颈癌等。TMEM40的表达水平与这些疾病的发病机制、疾病进展和预后密切相关。因此，深入研究TMEM40的生物学功能和作用机制，对于理解这些疾病的发病机制和开发新的治疗方法具有重要意义。
参考文献：
1. Yu, Lei, Liu, Jie, Zhang, Tang-De, Qiu, Xian-Wen, Guo, Lin-Lang. 2021. Decreased TMEM40 expression is associated with malignant behavior of cutaneous squamous cell carcinoma and inhibits tumor progression. In Oncology letters, 22, 606. doi:10.3892/ol.2021.12867. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34188708/
2. Zhang, Zhen-Fei, Zhang, Han-Rong, Zhang, Qing-Yan, Shi, Rong, Zhou, Jue-Yu. 2018. High expression of TMEM40 is associated with the malignant behavior and tumorigenesis in bladder cancer. In Journal of translational medicine, 16, 9. doi:10.1186/s12967-017-1377-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29351801/
3. Handler, Jesse S, Li, Zijie, Dveirin, Rachel K, Fertig, Elana J, Kalhor, Reza. 2024. Identifying a gene signature of metastatic potential by linking pre-metastatic state to ultimate metastatic fate. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.08.14.607813. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39185156/
4. Milanesi, Elena, Bonvicini, Cristian, Alberici, Antonella, Padovani, Alessandro, Borroni, Barbara. 2013. Molecular signature of disease onset in granulin mutation carriers: a gene expression analysis study. In Neurobiology of aging, 34, 1837-45. doi:10.1016/j.neurobiolaging.2012.11.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23419701/
5. Zhang, Qingyan, Huang, Danhui, Zhang, Zhenfei, Liu, Shuguang, Shi, Rong. 2018. High expression of TMEM40 contributes to progressive features of tongue squamous cell carcinoma. In Oncology reports, 41, 154-164. doi:10.3892/or.2018.6788. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30320346/
6. Liu, Dongcao, Zhou, Guang, Shi, Hongbo, Sun, Xiaosong, Zhang, Xuejun. 2020. Downregulation of Transmembrane protein 40 by miR-138-5p Suppresses Cell Proliferation and Mobility in Clear Cell Renal Cell Carcinoma. In Iranian journal of biotechnology, 18, e2270. doi:10.30498/IJB.2019.85193. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32884956/
7. Ye, Zi, Zeng, Zhirui, Shen, Yiyi, Chen, Zubing. 2020. Identification of hub genes in peripheral blood mononuclear cells for the diagnosis of hepatocellular carcinoma using a weighted gene co-expression network analysis. In Experimental and therapeutic medicine, 20, 890-900. doi:10.3892/etm.2020.8736. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32742331/
8. Choquet, Hélène, Thai, Khanh K, Jiang, Chen, Risch, Neil, Schaefer, Catherine. 2020. Meta-Analysis of 26 638 Individuals Identifies Two Genetic Loci Associated With Left Ventricular Ejection Fraction. In Circulation. Genomic and precision medicine, 13, e002804. doi:10.1161/CIRCGEN.119.002804. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32605384/
9. Campos-Parra, Alma D, Pérez-Quintanilla, Milagros, Martínez-Gutierrez, Antonio Daniel, De León, David Cantú, Pérez-Plasencia, Carlos. 2022. Molecular Differences between Squamous Cell Carcinoma and Adenocarcinoma Cervical Cancer Subtypes: Potential Prognostic Biomarkers. In Current oncology (Toronto, Ont.), 29, 4689-4702. doi:10.3390/curroncol29070372. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35877232/
10. Serão, Nick V L, González-Peña, Dianelys, Beever, Jonathan E, Faulkner, Daniel B, Rodriguez-Zas, Sandra L. 2013. Bivariate genome-wide association analysis of the growth and intake components of feed efficiency. In PloS one, 8, e78530. doi:10.1371/journal.pone.0078530. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24205251/
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