Pcdhb15-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Pcdhb15-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15508

品系全称

C57BL/6JCya-Pcdhb15em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-93886-Pcdhb15-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pcdhb15-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15508) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
protocadherin beta 15
基因别称
Pcdhb7,PcdhbO
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_053140.3 | Ensembl: ENSMUST00000050034
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~2098 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Pcdhb15,即原钙黏蛋白β家族成员15,是原钙黏蛋白基因家族的一部分,这个家族在神经系统中扮演着重要的角色,参与细胞间的粘附和信号传递。原钙黏蛋白基因家族位于人类染色体5q31,该区域在多种癌症中经常发生异常,与癌症的发生发展密切相关。Pcdhb15的表达和功能受到DNA甲基化的调控,DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰,它通过在DNA的CpG位点添加甲基来调控基因的表达。

在结直肠癌中,突变型KRAS促进谷氨酰胺分解代谢,这是一种将谷氨酰胺转化为α-酮戊二酸和其他分子的过程,这个过程需要SLC25A22蛋白的参与。研究发现,突变型KRAS细胞中,SLC25A22介导的谷氨酰胺分解代谢减少了DNA去甲基化,导致WNT信号通路的激活、细胞干性的增加以及药物抵抗性的增强[1]。进一步研究发现,在结直肠癌细胞中,Pcdhb15基因的表达受到DNA甲基化的调控。当突变型KRAS细胞中SLC25A22蛋白被敲除时,Pcdhb15基因的表达增加,DNA去甲基化增加,WNT信号通路被抑制,细胞干性降低,对药物的敏感性增加[1]。

在黑色素瘤中,Pcdhb15基因的表达受到DNA甲基化的调控。研究发现,与原发肿瘤相比,转移性黑色素瘤细胞系和患者的转移瘤中,Pcdhb15基因的特异性外显子发生了DNA高甲基化,这导致基因沉默。使用DNA去甲基化剂5-aza-2'-脱氧胞苷处理后,Pcdhb15基因的表达被重新诱导。进一步研究发现,Pcdhb15基因的表达抑制了转移性黑色素瘤细胞的侵袭性和聚集,减少了体内肺转移的形成[2]。

在妊娠糖尿病中,胎盘的DNA甲基化发生改变,这些改变与胎儿生长和代谢健康生物标志物相关。研究发现,妊娠糖尿病患者的胎盘中有256个位点的DNA甲基化发生了改变,其中包括Pcdhb15基因。此外,Pcdhb15基因的DNA甲基化改变与胎儿体重相关[3]。

在全基因组DNA甲基化分析中,Pcdhb15基因被发现在乳腺癌和结直肠癌中具有特定的甲基化模式。在乳腺癌中,Pcdhb15基因的甲基化水平与患者的生存时间相关,可以作为乳腺癌患者预后的一个潜在生物标志物。在结直肠癌中,Pcdhb15基因的甲基化水平与LGR5的表达水平相关,LGR5是一个干细胞标记物,其表达水平与结直肠癌的侵袭性和预后相关[4]。

综上所述,Pcdhb15基因的表达和功能受到DNA甲基化的调控,其在结直肠癌、黑色素瘤和妊娠糖尿病等多种疾病中发挥重要作用。Pcdhb15基因的表达与肿瘤的侵袭性、干细胞特性和预后相关,可以作为这些疾病诊断和治疗的一个潜在靶点。此外,Pcdhb15基因的甲基化模式可以作为乳腺癌和结直肠癌患者预后的一个潜在生物标志物。

参考文献:
1. Wong, Chi Chun, Xu, Jiaying, Bian, Xiqing, Sung, Joseph Jy, Yu, Jun. 2020. In Colorectal Cancer Cells With Mutant KRAS, SLC25A22-Mediated Glutaminolysis Reduces DNA Demethylation to Increase WNT Signaling, Stemness, and Drug Resistance. In Gastroenterology, 159, 2163-2180.e6. doi:10.1053/j.gastro.2020.08.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32814111/
2. Carrier, Arnaud, Desjobert, Cécile, Lobjois, Valérie, Arimondo, Paola B, Riond, Joëlle. 2022. Epigenetically regulated PCDHB15 impairs aggressiveness of metastatic melanoma cells. In Clinical epigenetics, 14, 156. doi:10.1186/s13148-022-01364-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36443814/
3. Wang, Wen-Juan, Huang, Rong, Zheng, Tao, Ouyang, Fengxiu, Luo, Zhong-Cheng. 2022. Genome-Wide Placental Gene Methylations in Gestational Diabetes Mellitus, Fetal Growth and Metabolic Health Biomarkers in Cord Blood. In Frontiers in endocrinology, 13, 875180. doi:10.3389/fendo.2022.875180. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35721735/
4. Zhang, Chunlong, Zhao, Hongyan, Li, Jie, Liu, Tiefu, Zhang, Yan. 2015. The identification of specific methylation patterns across different cancers. In PloS one, 10, e0120361. doi:10.1371/journal.pone.0120361. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25774687/