Pcdhb5-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Pcdhb5-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15498

品系全称

C57BL/6JCya-Pcdhb5em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-93876-Pcdhb5-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pcdhb5-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15498) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
protocadherin beta 5
基因别称
Pcdhb4A,PcdhbE
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_053130 | Ensembl: ENSMUST00000078271
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~4.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Pcdhb5,也称为protocadherin beta 5,是protocadherin beta家族的成员之一。Protocadherins是一类钙依赖性细胞粘附分子,它们在细胞识别和细胞间的通讯中发挥着重要作用。Pcdhb5在细胞粘附、细胞迁移、细胞分化以及神经发育等方面具有功能。Pcdhb5的表达模式和组织特异性表明它在不同的生物学过程中具有重要的作用。

在视网膜母细胞瘤(RB)的研究中,生物信息学分析揭示了Pcdhb5与RB的恶性转化相关。在Zhou等人的研究中,通过构建加权基因共表达和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,预测了长非编码RNA(lncRNA)-microRNA(miRNA)-mRNA调控网络。研究发现,Pcdhb5在RB肿瘤组织中的表达显著上调,这与肿瘤的细胞异型程度相关。此外,研究发现lncRNA MALAT1通过miR-495-3p调节Pcdhb5的表达,并进一步影响有丝分裂检查点丝氨酸/苏氨酸激酶(BUB1)的表达。这些结果表明Pcdhb5在RB的进展中起着重要作用[1]。

在自杀行为的研究中,Thalmeier等人的研究揭示了Pcdhb5在自杀受害者的大脑中的表达异常。通过基因表达谱分析,发现Pcdhb5在自杀受害者的大脑中表达下调。此外,研究发现Pcdhb5与其他与自杀行为相关的基因(如CDCA7L、CDH12、EFEMP1、MLC1、PTPRR、S100A13、SCN2B和ZFP36)共同参与了神经发育、细胞粘附和细胞增殖等生物学过程[2]。这些结果表明Pcdhb5可能与自杀行为的病理生理学机制有关。

此外,Pcdhb5在肾脏细胞癌(RCC)的研究中也具有重要意义。Xia等人的研究发现,HOTAIR lncRNA在RCC组织中表达上调,并通过调节组蛋白H3K27的去甲基化酶JMJD3的表达来促进RCC的转移。进一步研究发现,HOTAIR的抑制导致JMJD3的降低和Snai1的表达下调,同时导致组蛋白甲基转移酶EZH2的靶基因PCDHB5的表达上调。这表明HOTAIR在RCC的转移中起着重要的促进作用,并通过影响组蛋白的甲基化和去甲基化状态来调节基因表达[3]。

在动物育种研究中,Luo等人的研究揭示了Pcdhb5与山羊的生长和繁殖性状相关。通过全基因组重测序数据分析,发现Pcdhb5在白玉黑山羊和川中黑山羊中存在显著的表达差异。此外,研究发现Pcdhb5与神经发育、繁殖和肉品质等性状相关。这些结果表明Pcdhb5在山羊的生长和繁殖中起着重要作用[4]。

综上所述,Pcdhb5在多种生物学过程中具有重要作用,包括细胞粘附、细胞迁移、细胞分化、神经发育、肿瘤转移和动物育种等。Pcdhb5的表达异常与视网膜母细胞瘤、自杀行为和肾脏细胞癌等疾病的发生发展相关。此外,Pcdhb5的调控机制涉及lncRNA、miRNA和组蛋白修饰等。因此,对Pcdhb5的研究有助于深入理解其在不同生物学过程中的功能和调控机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhou, Wenchuan, Guan, Wenbin, Zhou, Yutong, Ji, Xunda, Li, Jing. 2021. Weighted genes associated with the progression of retinoblastoma: Evidence from bioinformatic analysis. In Experimental eye research, 211, 108730. doi:10.1016/j.exer.2021.108730. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34419445/
2. Thalmeier, Andreas, Dickmann, Martin, Giegling, Ina, Möller, Hans-Jürgen, Rujescu, Dan. 2007. Gene expression profiling of post-mortem orbitofrontal cortex in violent suicide victims. In The international journal of neuropsychopharmacology, 11, 217-28. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17608962/
3. Xia, Ming, Yao, Lv, Zhang, Qiaoxia, Guo, Xiaoqiang, Huang, Weiren. . Long noncoding RNA HOTAIR promotes metastasis of renal cell carcinoma by up-regulating histone H3K27 demethylase JMJD3. In Oncotarget, 8, 19795-19802. doi:10.18632/oncotarget.15047. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28177890/
4. Luo, Jing, Min, Qi, Sun, Xueliang, Han, Yanguo, Li, Li. 2024. Comparative Whole-Genome Analysis of Production Traits and Genetic Structure in Baiyu and Chuanzhong Black Goats. In Animals : an open access journal from MDPI, 14, . doi:10.3390/ani14243616. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39765520/