Smarca1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Smarca1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15485

品系全称

C57BL/6JCya-Smarca1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-93761-Smarca1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Smarca1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15485) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SNF2 related chromatin remodeling ATPase 1
基因别称
5730494M04Rik,Snf2l
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001290708.2 | Ensembl: ENSMUST00000101616
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~8
敲除长度
~8513 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1935127Female mice homozygous and male mice hemizygous for a targeted disruption of this gene exhibit abnormalities in neuron differentiation and neuronal precursor proliferation, increased brain and heart weight, and forebrain hypercellularity.
SMARCA1基因,也称为SNF2L,编码一个ATP依赖性的染色质重塑蛋白,属于SWI/SNF染色质重塑复合体的一部分。SWI/SNF复合体在调控基因表达中发挥关键作用,通过重塑染色质结构,影响DNA的转录活性。SMARCA1的突变与多种疾病相关,包括癌症和神经发育障碍。

SMARCA1在癌症中的作用日益受到关注。在结直肠癌(CRC)中,长链非编码RNA(lncRNA)MIR99AHG被发现通过结合并稳定RNA剪接因子PTBP1,调节SMARCA1的剪接,从而促进肿瘤的侵袭行为[1]。MIR99AHG的表达与SMARCA1长型异构体(SMARCA1-L)的丰度正相关,并且与CRC患者的预后不良相关。这表明SMARCA1的剪接变异在CRC的发病机制中发挥重要作用。

除了CRC,SMARCA1的突变还与其他癌症相关。SMARCA1是SMARCB1缺失型癌症中的关键基因,SMARCB1是SWI/SNF复合体的另一个亚基,其缺失导致染色质重塑的异常,进而影响基因表达和细胞功能[3]。在SMARCB1缺失的癌症中,CBP/p300的抑制可以作为一种治疗策略,因为它们可以抑制KREMEN2的表达,从而抑制肿瘤生长[3]。

SMARCA1还与神经发育障碍相关。研究发现,SMARCA1的突变与X连锁智力障碍(XLMR)相关,尽管在特定患者队列中没有发现突变,但SMARCA1仍然被认为是XLMR的候选基因[4]。此外,SMARCA1在脑发育和神经发育障碍中也发挥着重要作用,其功能缺失与多种神经发育障碍相关[5]。

除了癌症和神经发育障碍,SMARCA1还与Lowe综合症相关。Lowe综合症是一种罕见的X连锁综合征,涉及眼睛、中枢神经系统和肾脏的异常。研究发现,一个Lowe综合症患者的基因组中存在一个涉及SMARCA1基因的缺失,这表明SMARCA1在Lowe综合症的发病机制中可能发挥作用[2]。

综上所述,SMARCA1是一个重要的染色质重塑蛋白,在多种疾病中发挥关键作用。其突变与癌症、神经发育障碍和Lowe综合症相关。SMARCA1的剪接变异、功能缺失和表达异常都可能影响疾病的发生和发展。对SMARCA1的深入研究有助于理解疾病的发病机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Li, Danxiu, Wang, Xin, Miao, Hui, Lu, Yuanyuan, Zhao, Xiaodi. 2023. The lncRNA MIR99AHG directs alternative splicing of SMARCA1 by PTBP1 to enable invadopodia formation in colorectal cancer cells. In Science signaling, 16, eadh4210. doi:10.1126/scisignal.adh4210. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37725664/
2. Zheng, Bixia, Chen, Qiuxia, Wang, Chunli, Zhang, Aihua, Huang, SongMing. 2019. Whole-genome sequencing revealed an interstitial deletion encompassing OCRL and SMARCA1 gene in a patient with Lowe syndrome. In Molecular genetics & genomic medicine, 7, e876. doi:10.1002/mgg3.876. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31376231/
3. Sasaki, Mariko, Kato, Daiki, Murakami, Karin, Otsubo, Tsuguteru, Ogiwara, Hideaki. 2024. Targeting dependency on a paralog pair of CBP/p300 against de-repression of KREMEN2 in SMARCB1-deficient cancers. In Nature communications, 15, 4770. doi:10.1038/s41467-024-49063-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38839769/
4. Lazzaro, Maribeth A, Todd, Matthew A M, Lavigne, Paul, De Maria, Adriana, Picketts, David J. 2008. Characterization of novel isoforms and evaluation of SNF2L/SMARCA1 as a candidate gene for X-linked mental retardation in 12 families linked to Xq25-26. In BMC medical genetics, 9, 11. doi:10.1186/1471-2350-9-11. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18302774/
5. Goodwin, Laura R, Picketts, David J. 2017. The role of ISWI chromatin remodeling complexes in brain development and neurodevelopmental disorders. In Molecular and cellular neurosciences, 87, 55-64. doi:10.1016/j.mcn.2017.10.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29249292/