Pcdhga1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Pcdhga1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15464

品系全称

C57BL/6JCya-Pcdhga1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-93709-Pcdhga1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pcdhga1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15464) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
protocadherin gamma subfamily A, 1
基因别称
-
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_033584.2 | Ensembl: ENSMUST00000194190
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~2421 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1935212Mice homozygous for a null/reporter allele are viable and fertile.
Pcdhga1是位于人类染色体5q31的基因,属于原钙粘蛋白基因簇中的一部分。原钙粘蛋白是一类钙依赖性细胞粘附分子,在细胞识别、粘附、信号传导和发育过程中发挥重要作用。Pcdhga1基因编码的蛋白是细胞粘附分子家族中的一员,其表达与细胞分化和组织特异性有关,参与细胞间通讯和细胞与细胞外基质的相互作用。

在多种疾病中,Pcdhga1的表达和功能发生了改变。例如,在结直肠癌中,Pcdhga1的表达与肿瘤的恶性行为和患者的预后相关。研究发现,突变型KRAS介导的谷氨酰胺代谢途径中,SLC25A22的表达下调导致DNA去甲基化减少,进而增加WNT信号通路活性、肿瘤干性特征和药物抵抗性。在表达突变型KRAS的结直肠癌细胞中,谷氨酰胺是维持细胞生存所必需的,其通过三羧酸循环迅速转化为α-酮戊二酸。这一过程需要SLC25A22的参与。突变型KRAS细胞维持α-酮戊二酸与琥珀酸的较低比例,导致5-羟甲基胞嘧啶水平降低,这是DNA去甲基化的标志,同时CpG位点的甲基化水平升高。许多过度甲基化的基因位于WNT信号通路和染色体5q31的原钙粘蛋白基因簇中。在无突变型KRAS的结直肠癌细胞或突变型KRAS且SLC25A22基因敲除的细胞中,原钙粘蛋白基因(PCDHAC2、PCDHB7、PCDHB15、PCDHGA1和PCDHGA6)的表达增加,这些基因位点的DNA未发生甲基化。原钙粘蛋白基因的表达降低了WNT信号通路到β-连环蛋白的表达,以及干细胞标记物LGR5的表达。SLC25A22基因敲除的小鼠模型中,结肠肿瘤的发生率降低,同时肿瘤组织中LGR5和其他干细胞标记物的表达也降低。此外,SLC25A22基因敲低的人结直肠肿瘤类器官中克隆形成能力下降。在表达突变型KRAS的结直肠癌细胞中,SLC25A22基因敲除增加了其对5-氟尿嘧啶的敏感性。SLC25A22的表达水平与LGR5、核β-连环蛋白和干细胞相关基因表达模式在KRAS突变的人结直肠肿瘤中相关,并且与患者的生存时间呈负相关。因此,SLC25A22介导的谷氨酰胺代谢途径可能成为治疗结直肠癌的潜在靶点[1]。

除了结直肠癌,Pcdhga1还与马凡综合征相关。马凡综合征是一种由FBN1基因突变引起的结缔组织疾病。在马凡综合征患者中,DNA甲基化模式发生了改变,包括与心血管疾病相关的基因和染色体5上的原钙粘蛋白基因簇。研究发现,Pcdhga1基因启动子区域的DNA甲基化水平与患者主动脉直径相关,表明Pcdhga1的表达可能与马凡综合征的发病机制有关[2]。

此外,Pcdhga1的表达与前列腺癌患者的生化复发相关。研究发现,Pcdhga1基因的表达水平与前列腺癌患者术后生化复发风险相关,其表达水平越高,患者发生早期生化复发的风险越大。因此,Pcdhga1可能成为预测前列腺癌患者预后的潜在生物标志物[3]。

在儿童低级别胶质瘤中,Pcdhga1基因的易位与MYB基因的表达相关。研究发现,Pcdhga1基因易位导致MYB基因的表达上调,进而影响肿瘤的发生和发展。因此,Pcdhga1基因的易位可能成为儿童低级别胶质瘤的潜在治疗靶点[4]。

在乳腺癌中,Pcdhga1基因的表达与环磷酰胺化疗反应相关。研究发现,Pcdhga1基因的表达水平与乳腺癌患者对环磷酰胺化疗的反应相关,其表达水平越高,患者对化疗的反应越差。因此,Pcdhga1基因可能成为预测乳腺癌患者化疗反应的潜在生物标志物[5]。

此外,Pcdhga1基因的表达与颈动脉内膜中层厚度相关。研究发现,Pcdhga1基因的遗传变异与颈动脉内膜中层厚度相关,其变异导致颈动脉内膜中层厚度增加,进而增加动脉粥样硬化的风险[6]。

在骨形成过程中,Pcdhga1基因的表达上调可能促进成骨细胞的增殖、分化和矿化。研究发现,Pcdhga1基因的表达上调通过调节多种功能基因和相关信号通路,促进成骨细胞的增殖、分化和矿化,并抑制成骨细胞的凋亡。因此,Pcdhga1基因可能成为治疗骨质疏松症的潜在靶点[7]。

综上所述,Pcdhga1基因在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞粘附、信号传导、发育和疾病发生。Pcdhga1基因的表达和功能改变与结直肠癌、马凡综合征、前列腺癌、儿童低级别胶质瘤、乳腺癌、动脉粥样硬化和骨质疏松症等疾病相关。Pcdhga1基因的研究有助于深入理解这些疾病的发病机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wong, Chi Chun, Xu, Jiaying, Bian, Xiqing, Sung, Joseph Jy, Yu, Jun. 2020. In Colorectal Cancer Cells With Mutant KRAS, SLC25A22-Mediated Glutaminolysis Reduces DNA Demethylation to Increase WNT Signaling, Stemness, and Drug Resistance. In Gastroenterology, 159, 2163-2180.e6. doi:10.1053/j.gastro.2020.08.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32814111/
2. van Andel, Mitzi M, Groenink, Maarten, van den Berg, Maarten P, Zwinderman, Aeilko H, de Waard, Vivian. 2021. Genome-wide methylation patterns in Marfan syndrome. In Clinical epigenetics, 13, 217. doi:10.1186/s13148-021-01204-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34895303/
3. Guo, Jinan, Zhao, Chenhui, Zhang, Xinzhou, Wei, Wei, Shen, Qi. 2022. A novel 8-gene panel for prediction of early biochemical recurrence in patients with prostate cancer after radical prostatectomy. In American journal of cancer research, 12, 3318-3332. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35968320/
4. Barinfeld, Orit, Zahavi, Alon, Weiss, Shirel, Michowiz, Shalom, Goldenberg-Cohen, Nitza. 2022. Genetic Alteration Analysis of IDH1, IDH2, CDKN2A, MYB and MYBL1 in Pediatric Low-Grade Gliomas. In Frontiers in surgery, 9, 880048. doi:10.3389/fsurg.2022.880048. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35574540/
5. Du, Jiawei, Dong, Yanru, Li, Yuhong. 2021. Identification and Prognostic Value Exploration of Cyclophosphamide (Cytoxan)-Centered Chemotherapy Response-Associated Genes in Breast Cancer. In DNA and cell biology, 40, 1356-1368. doi:10.1089/dna.2021.0077. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34704810/
6. Xie, Gaoqiang, Myint, Phyo Kyaw, Voora, Deepak, Gao, Wei, Wu, Yangfeng. 2015. Genome-wide association study on progression of carotid artery intima media thickness over 10 years in a Chinese cohort. In Atherosclerosis, 243, 30-7. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2015.08.034. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26343869/
7. Guan, Mengqi, Pan, Daian, Zhang, Mei, Leng, Xiangyang, Yao, Baojin. 2021. The Aqueous Extract of Eucommia Leaves Promotes Proliferation, Differentiation, and Mineralization of Osteoblast-Like MC3T3-E1 Cells. In Evidence-based complementary and alternative medicine : eCAM, 2021, 3641317. doi:10.1155/2021/3641317. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34249129/