Smarcd1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Smarcd1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15408

品系全称

C57BL/6JCya-Smarcd1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-83797-Smarcd1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Smarcd1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15408) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit D1
基因别称
Baf60a,D15Kz1
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_031842 | Ensembl: ENSMUST00000023759
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 7~9
敲除长度
~1.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
SMARCD1,也称为BAF60a,是SWI/SNF染色质重塑复合物家族中的一个亚基。SWI/SNF复合物是一类ATP依赖性的染色质重塑酶,参与转录因子的招募、DNA复制、重组和修复等过程。SMARCD1在细胞分化、基因表达调控和多种生物学过程中发挥着重要作用。

SMARCD1在淋巴细胞的发育中起着关键作用。研究表明,SMARCD1的缺失会导致淋巴细胞的减少,包括早期淋巴祖细胞和成熟的B细胞和T细胞,而髓系和红细胞谱系则不受影响。SMARCD1通过与E2a转录因子在启动子区域相互作用,并调节远端增强子的活性,从而协调激活淋巴细胞谱系的基因表达[3]。此外,SMARCD1还参与了POU2F3基因的表达调控。POU2F3是一种转录因子,在约12%的小细胞肺癌(SCLC)中表达,并且这些SCLC对POU2F3本身具有独特的依赖性。研究表明,mSWI/SNF复合物是POU2F3阳性SCLC的关键调控因子,通过化学破坏mSWI/SNF ATP酶活性可以抑制所有POU2F3阳性SCLC的增殖[1]。

SMARCD1还与癌症的发生和进展相关。研究发现,SMARCD1是突变型p53的转录靶点,并且其表达升高与口腔鳞状细胞癌(SCCOT)和头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的预后不良相关[2]。此外,SMARCD1的表达水平在乳腺癌中也被发现与临床预后相关。高表达和低表达的SMARCD1都与积极的临床结果相关,而中等表达的SMARCD1则与生存率显著降低相关[4]。SMARCD1在皮肤黑色素瘤(SKCM)中也发挥着重要作用。研究表明,SMARCD1的表达与SKCM患者的预后、肿瘤微环境(TME)、免疫浸润、肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)等多种因素相关,并且SMARCD1的表达水平可以作为SKCM患者的诊断、预后和治疗靶点[6]。

除了在癌症中的作用,SMARCD1还与细胞衰老和脂质积累相关。研究发现,SMARCD1的表达下调可以触发细胞衰老和脂质的积累,并且SMARCD1的表达受到膳食营养的影响。在高脂饮食和棕榈酸处理下,SMARCD1的表达降低,导致细胞衰老和脂质积累的增加[5]。这表明SMARCD1可能在预防与生活方式相关的疾病中具有潜在的应用价值。

综上所述,SMARCD1是一个重要的染色质重塑复合物亚基,参与细胞分化、基因表达调控和多种生物学过程。SMARCD1在淋巴细胞的发育、癌症的发生和进展、细胞衰老和脂质积累等方面发挥着重要作用。SMARCD1的研究有助于深入理解染色质重塑和基因表达调控的机制,并为癌症和其他疾病的治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Duplaquet, Leslie, So, Kevin, Ying, Alexander W, Kadoch, Cigall, Oser, Matthew G. 2024. Mammalian SWI/SNF complex activity regulates POU2F3 and constitutes a targetable dependency in small cell lung cancer. In Cancer cell, 42, 1352-1369.e13. doi:10.1016/j.ccell.2024.06.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39029464/
2. Adduri, Raju S R, George, Sara A, Kavadipula, Padmavathi, Bashyam, Murali D. 2019. SMARCD1 is a transcriptional target of specific non-hotspot mutant p53 forms. In Journal of cellular physiology, 235, 4559-4570. doi:10.1002/jcp.29332. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31637714/
3. Priam, Pierre, Krasteva, Veneta, Rousseau, Philippe, Kmita, Marie, Lessard, Julie A. 2024. Smarcd1 subunit of SWI/SNF chromatin-remodeling complexes collaborates with E2a to promote murine lymphoid specification. In Developmental cell, 59, 3124-3140.e8. doi:10.1016/j.devcel.2024.08.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39232562/
4. Ross, Christina, Gong, Li-Yun, Jenkins, Lisa M, Majocha, Megan, Hunter, Kent. 2024. SMARCD1 is a "Goldilocks" metastasis modifier. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.01.24.577061. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38410477/
5. Inoue, Chisato, Zhao, Chong, Tsuduki, Yumi, Nomura, Masatoshi, Katakura, Yoshinori. 2017. SMARCD1 regulates senescence-associated lipid accumulation in hepatocytes. In NPJ aging and mechanisms of disease, 3, 11. doi:10.1038/s41514-017-0011-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28868154/
6. Chen, Jiaoquan, Yu, Nanji, Ou, Shanshan, Li, Huaping, Zhu, Huilan. 2023. Integrated analysis reveals SMARCD1 is a potential biomarker and therapeutic target in skin cutaneous melanoma. In Journal of cancer research and clinical oncology, 149, 11619-11634. doi:10.1007/s00432-023-05064-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37401939/