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Wdr6-KO 基因敲除小鼠
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基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
WD repeat domain 6
基因别称
-
染色体号
Chr 9 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_031392.3 | Ensembl: ENSMUST00000068700
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~2482 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
Wdr6，也称为WD repeat domain 6，是一种编码具有11个WD重复结构域的蛋白质的基因。WD重复结构域是一类富含半胱氨酸和色氨酸的短序列，通常参与蛋白质-蛋白质相互作用，并在信号转导、转录和细胞增殖等多种细胞功能中发挥重要作用。Wdr6基因位于人类染色体15q21上，其编码的蛋白质具有独特的结构特征，即其11个WD重复结构域被一个假定的跨膜结构域分为两个不同的簇[2]。
Wdr6基因的表达分析表明，它广泛存在于人类成人和胎儿组织中[2]。Wdr6编码的蛋白质与其他已知的WD重复蛋白不具有同源性，但与拟南芥和酵母中的WD重复蛋白具有显著的序列相似性，表明Wdr6可能属于一个高度保守的WD重复蛋白亚家族[2]。
Wdr6基因与多种疾病的发生发展密切相关。研究表明，Wdr6基因的表达、剪接或甲基化与帕金森病的风险增加相关。在一项研究中，研究者整合了全基因组关联研究（GWAS）、表达数据和甲基化数据，发现Wdr6基因的表达与帕金森病的风险增加相关。此外，细胞类型特异性分析表明，Wdr6基因的表达在胶质细胞类型中更为普遍，而在神经元中则相对较低[1]。这些研究结果提示，Wdr6基因可能在帕金森病的发病机制中发挥作用。
在乳腺癌中，Wdr6基因的表达也与肿瘤的转移和患者的生存状况相关。研究发现，Wdr6基因的表达与乳腺癌患者发生内脏器官转移的可能性相关，且Wdr6基因的表达水平与患者的生存状况相关[3]。
此外，Wdr6基因还与强迫症（OCD）的发病机制相关。在一项全基因组关联研究中，研究者发现Wdr6基因与OCD的风险增加相关。功能分析和组织富集分析表明，Wdr6基因可能在OCD的发病机制中发挥作用[4]。
在肺癌中，Wdr6基因的表达与患者的预后和免疫浸润相关。研究发现，Wdr6基因的表达水平与肺癌患者的总体生存期、首次进展、术后生存期和无复发生存期相关。此外，Wdr6基因的表达与肺癌中的免疫分子，包括免疫调节剂、淋巴细胞和趋化因子相关[5]。
Wdr6基因还与智力障碍相关。研究发现，Wdr6基因与智力障碍相关基因FTSJ1相互作用，共同参与tRNA的2'-O-甲基化修饰，影响蛋白质的合成和功能[6]。
此外，Wdr6基因还与厌食症的发病机制相关。研究发现，Wdr6基因的表达与厌食症的风险增加相关，且Wdr6基因的表达水平与患者的免疫相关通路相关[7]。
最后，Wdr6基因还与肝细胞癌的发生发展相关。研究发现，Wdr6基因在非肿瘤性肝细胞中的表达水平升高，而在肝细胞癌中则表达水平降低。这表明Wdr6基因可能在肝细胞癌的发生发展中发挥重要作用[8]。
综上所述，Wdr6基因与多种疾病的发生发展密切相关，包括帕金森病、乳腺癌、强迫症、肺癌、智力障碍、厌食症和肝细胞癌。Wdr6基因的表达、剪接或甲基化与这些疾病的风险增加相关。此外，Wdr6基因还参与tRNA的2'-O-甲基化修饰和免疫相关通路。Wdr6基因的研究有助于深入理解这些疾病的发病机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Kia, Demis A, Zhang, David, Guelfi, Sebastian, Hardy, John, Wood, Nicholas W. . Identification of Candidate Parkinson Disease Genes by Integrating Genome-Wide Association Study, Expression, and Epigenetic Data Sets. In JAMA neurology, 78, 464-472. doi:10.1001/jamaneurol.2020.5257. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33523105/
2. Li, D, Burch, P, Gonzalez, O, Bachinski, L L, Roberts, R. . Molecular cloning, expression analysis, and chromosome mapping of WDR6, a novel human WD-repeat gene. In Biochemical and biophysical research communications, 274, 117-23. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10903905/
3. Savci-Heijink, C D, Halfwerk, H, Koster, J, Horlings, H M, van de Vijver, M J. 2019. A specific gene expression signature for visceral organ metastasis in breast cancer. In BMC cancer, 19, 333. doi:10.1186/s12885-019-5554-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30961553/
4. Strom, Nora I, Gerring, Zachary F, Galimberti, Marco, Derks, Eske M, Mattheisen, Manuel. 2024. Genome-wide association study identifies 30 obsessive-compulsive disorder associated loci. In medRxiv : the preprint server for health sciences, , . doi:10.1101/2024.03.13.24304161. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38712091/
5. Lv, Minghe. . WD repeat domain 6 as a novelty prognostic biomarker correlates with immune infiltration in lung cancer: A preliminary study. In Immunity, inflammation and disease, 10, e681. doi:10.1002/iid3.681. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36039642/
6. Li, Jing, Wang, Yan-Nan, Xu, Bei-Si, Wang, En-Duo, Liu, Ru-Juan. 2020. Intellectual disability-associated gene ftsj1 is responsible for 2'-O-methylation of specific tRNAs. In EMBO reports, 21, e50095. doi:10.15252/embr.202050095. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32558197/
7. Adams, Danielle M, Reay, William R, Cairns, Murray J. 2023. Multiomic prioritisation of risk genes for anorexia nervosa. In Psychological medicine, 53, 6754-6762. doi:10.1017/S0033291723000235. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36803885/
8. Yafune, Atsunori, Kawai, Masaomi, Itahashi, Megu, Mitsumori, Kunitoshi, Shibutani, Makoto. 2013. Global DNA methylation screening of liver in piperonyl butoxide-treated mice in a two-stage hepatocarcinogenesis model. In Toxicology letters, 222, 295-302. doi:10.1016/j.toxlet.2013.08.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23968726/
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