Snapc3-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Snapc3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15073

品系全称

C57BL/6JCya-Snapc3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-77634-Snapc3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Snapc3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15073) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
small nuclear RNA activating complex, polypeptide 3
基因别称
1810020H02Rik,4930558A07Rik,5031401C21Rik,E030018J20Rik
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_029949.4 | Ensembl: ENSMUST00000030206
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~9161 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Snapc3,也称为SNAPC3或小核RNA活化蛋白复合物SNAPc的第三个亚基,是一种重要的转录因子。它参与了RNA聚合酶II和III的转录过程,尤其是在小核RNA(snRNA)基因的转录中发挥关键作用。Snapc3与SNAPc复合物中的其他亚基(如SNAP190、SNAP50、SNAP45和SNAP19)一起,通过结合到特定的启动子序列上,招募RNA聚合酶并启动转录过程。此外,Snapc3还与其他转录因子和蛋白质相互作用,共同调控基因表达和RNA的稳定性。

研究表明,Snapc3的表达与多种疾病的发生和发展密切相关。例如,在肥胖研究中,一项整合遗传和转录组数据的研究发现,Snapc3基因的表达与体重指数(BMI)相关,并且在肝脏中观察到显著的关联[1]。这表明Snapc3可能参与了脂肪代谢和能量平衡的调控。此外,另一项研究表明,在骨肉瘤的肿瘤微环境中,Snapc3的表达水平与巨噬细胞浸润相关,并且与患者的无病生存期呈负相关[2]。这提示Snapc3可能参与了骨肉瘤的免疫反应和疾病进展。在乳腺癌研究中,Snapc3的表达与MHC I类分子HLA-A和HLA-B的表达相关,并且与T细胞活化和良好的预后相关[3]。这表明Snapc3可能参与了乳腺癌的免疫激活和抗原呈递过程。

此外,Snapc3还与其他基因和转录因子相互作用,共同调控基因表达和生物学过程。例如,在乙醇消耗和戒断的研究中,Snapc3基因的表达与乙醇消耗和戒断的遗传和转录网络效应相关[4]。这表明Snapc3可能参与了乙醇代谢和成瘾相关的生物学过程。在Down综合征的研究中,Snapc3基因的表达异常与神经元分化和神经发生缺陷相关[5]。这提示Snapc3可能参与了Down综合征的神经病理学异常和认知障碍的发生机制。

在蛋白质-蛋白质相互作用的研究中,Snapc3被发现与其他转录因子和蛋白质相互作用。例如,一项研究揭示了SNAPc复合物内部蛋白质-蛋白质接触的详细图谱,包括Snapc3与其他亚基的相互作用[6]。此外,另一项研究发现,Simian病毒40大T抗原可以与人类TFIIB相关因子和SNAPc复合物相互作用,从而激活TATA盒包含的RNA聚合酶III启动子[7]。

综上所述,Snapc3是一种重要的转录因子,参与调控RNA聚合酶II和III的转录过程,尤其是在snRNA基因的转录中发挥关键作用。Snapc3的表达与肥胖、骨肉瘤和乳腺癌等疾病的发生和发展密切相关,并且与其他基因和转录因子相互作用,共同调控基因表达和生物学过程。Snapc3的研究有助于深入理解转录调控的机制和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Xu, Hanfei, Gupta, Shreyash, Dinsmore, Ian, Justice, Anne E, Liu, Ching-Ti. 2024. Integrating Genetic and Transcriptomic Data to Identify Genes Underlying Obesity Risk Loci. In medRxiv : the preprint server for health sciences, , . doi:10.1101/2024.06.11.24308730. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38903089/
2. Liu, Ruixuan, Hu, Yuhang, Liu, Tianyi, Wang, Yansong. 2021. Profiles of immune cell infiltration and immune-related genes in the tumor microenvironment of osteosarcoma cancer. In BMC cancer, 21, 1345. doi:10.1186/s12885-021-09042-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34922489/
3. Noblejas-López, María Del Mar, Nieto-Jiménez, Cristina, Morcillo García, Sara, Győrffy, Balázs, Ocana, Alberto. 2019. Expression of MHC class I, HLA-A and HLA-B identifies immune-activated breast tumors with favorable outcome. In Oncoimmunology, 8, e1629780. doi:10.1080/2162402X.2019.1629780. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31646075/
4. Metten, Pamela, Iancu, Ovidiu D, Spence, Stephanie E, Belknap, John K, Hitzemann, Robert J. . Dual-trait selection for ethanol consumption and withdrawal: genetic and transcriptional network effects. In Alcoholism, clinical and experimental research, 38, 2915-24. doi:10.1111/acer.12574. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25581648/
5. Wang, Chi Chiu, Kadota, Mitsutaka, Nishigaki, Ryuichi, Ikeo, Kazuho, Oshimura, Mitsuo. . Molecular hierarchy in neurons differentiated from mouse ES cells containing a single human chromosome 21. In Biochemical and biophysical research communications, 314, 335-50. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14733910/
6. Ma, B, Hernandez, N. 2000. A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. In The Journal of biological chemistry, 276, 5027-35. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11056176/
7. Damania, B, Mital, R, Alwine, J C. . Simian virus 40 large T antigen interacts with human TFIIB-related factor and small nuclear RNA-activating protein complex for transcriptional activation of TATA-containing polymerase III promoters. In Molecular and cellular biology, 18, 1331-8. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9488448/