Apex2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Apex2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-15068

品系全称

C57BL/6JCya-Apex2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-77622-Apex2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Apex2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-15068) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
apurinic/apyrimidinic endonuclease 2
基因别称
C430040P13Rik,ape2
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_029943.2 | Ensembl: ENSMUST00000026303
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~2662 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1924872Hemizygous null male mice display mild growth retardation, thymic atrophy, reduced white blood cell counts, and a slight decrease in red blood cell count.
APEX2,也称为Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 2,是一种重要的DNA修复酶,参与细胞的DNA损伤修复过程,特别是参与碱基切除修复(Base Excision Repair, BER)途径。APEX2具有3'-5'外切酶和3'-磷酸二酯酶活性,但其AP内切酶活性相对较弱。它在细胞周期的S期表达水平较高,与增殖细胞核抗原(PCNA)相互作用,参与DNA复制和修复过程[2]。APEX2在多种组织和细胞中表达,包括胸腺、骨髓、脾脏和肾脏,表明其在维持DNA稳定性和细胞功能中发挥重要作用。

在BRCA2缺陷的背景下,APEX2和FEN1被确定为合成致死基因,即BRCA2缺陷的细胞对这些基因的抑制特别敏感[1]。研究发现,BRCA2缺陷的细胞需要APEX2的AP内切酶活性和PCNA结合域,以及FEN1的5' flap内切酶活性,但这些细胞不需要FEN1的5'-3'外切酶活性[1]。这表明APEX2和FEN1在BRCA2缺陷细胞中的功能是选择性的,且可能涉及特定的DNA修复途径。

此外,APEX2在核质和线粒体中均有定位,提示其在DNA修复和细胞代谢中具有多方面的功能[2]。研究发现,APEX2缺陷的胸腺细胞表现出DNA断裂频率显著增加,这表明APEX2在DNA损伤修复中发挥重要作用[4]。此外,APEX2缺陷的细胞还表现出与DNA复制、重组和修复相关的基因表达改变,以及DNA损伤反应相关基因表达的改变,进一步证明了APEX2在DNA修复和细胞功能中的重要性[4]。

在Wnt信号通路中,Lrp6-APEX2相互作用蛋白的鉴定揭示了ESCRT(Endosomal Sorting Complex Required for Transport)机器和Trk-fused基因(TFG)是Wnt信号通路的组成部分。TFG的缺失会显著降低Wnt/β-catenin信号传导,表明TFG在Wnt信号通路中发挥重要作用[5]。

APEX2介导的邻近标记技术(Proximity Labeling)已被用于研究特定基因组位点的蛋白质组。这种技术结合了CRISPR-based基因组靶向、邻近标记和定量蛋白质组学,可以发现在原代细胞环境中与特定基因组位点相关的蛋白质[3]。此外,APEX2介导的邻近标记技术还被用于研究核质和染色体生物学,以及细胞内特定蛋白质的定位和相互作用[6]。

综上所述,APEX2是一种重要的DNA修复酶,参与细胞的DNA损伤修复过程,特别是在碱基切除修复途径中发挥重要作用。此外,APEX2在细胞代谢、Wnt信号通路和基因组定位研究中也有重要作用。APEX2的研究有助于深入理解DNA修复和细胞功能的分子机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Mengwasser, Kristen E, Adeyemi, Richard O, Leng, Yumei, D'Andrea, Alan D, Elledge, Stephen J. 2019. Genetic Screens Reveal FEN1 and APEX2 as BRCA2 Synthetic Lethal Targets. In Molecular cell, 73, 885-899.e6. doi:10.1016/j.molcel.2018.12.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30686591/
2. Ide, Yasuhito, Tsuchimoto, Daisuke, Tominaga, Yohei, Iwamoto, Yukihide, Nakabeppu, Yusaku. . Characterization of the genomic structure and expression of the mouse Apex2 gene. In Genomics, 81, 47-57. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12573260/
3. Myers, Samuel A, Wright, Jason, Peckner, Ryan, Zhang, Feng, Carr, Steven A. 2018. Discovery of proteins associated with a predefined genomic locus via dCas9-APEX-mediated proximity labeling. In Nature methods, 15, 437-439. doi:10.1038/s41592-018-0007-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29735997/
4. Dan, Yukihiko, Ohta, Yutaka, Tsuchimoto, Daisuke, Sakumi, Kunihiko, Nakabeppu, Yusaku. 2008. Altered gene expression profiles and higher frequency of spontaneous DNA strand breaks in APEX2-null thymus. In DNA repair, 7, 1437-54. doi:10.1016/j.dnarep.2008.05.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18585982/
5. Colozza, Gabriele, Jami-Alahmadi, Yasaman, Dsouza, Alyssa, Wohlschlegel, James A, De Robertis, Edward M. 2020. Wnt-inducible Lrp6-APEX2 interacting proteins identify ESCRT machinery and Trk-fused gene as components of the Wnt signaling pathway. In Scientific reports, 10, 21555. doi:10.1038/s41598-020-78019-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33299006/
6. Gao, Xin D, Rodríguez, Tomás C, Sontheimer, Erik J. 2018. Adapting dCas9-APEX2 for subnuclear proteomic profiling. In Methods in enzymology, 616, 365-383. doi:10.1016/bs.mie.2018.10.030. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30691651/