Tbc1d9b-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Tbc1d9b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-14946

品系全称

C57BL/6JCya-Tbc1d9bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-76795-Tbc1d9b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tbc1d9b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-14946) were purchased from Cyagen.
交付类型
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基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TBC1 domain family, member 9B
基因别称
-
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001290760.1 | Ensembl: ENSMUST00000101270
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~9
敲除长度
~7046 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Tbc1d9b,全称为Tre2-Bub2-Cdc16(TBC)结构域家族成员9b,是一种在哺乳动物中发现的基因。TBC结构域是一个保守的结构域,存在于多种GTPase激活蛋白(GAPs)中,这些GAPs能够调节小GTP酶的活性。小GTP酶在细胞内许多重要的生物学过程中发挥关键作用,包括细胞骨架重组、信号转导和膜运输等。

Tbc1d9b编码的蛋白是一种GAP,主要功能是调节小GTP酶Rab11a的活性。Rab11a是一种在细胞内囊泡运输过程中发挥重要作用的蛋白质,它通过调节囊泡的形成、运输和融合来控制细胞内物质的运输。Tbc1d9b通过其TBC结构域与Rab11a结合,并促进Rab11a的GTP水解,从而降低Rab11a的活性。这种调节作用对于维持细胞内囊泡运输的平衡和有序进行至关重要。

此外,Tbc1d9b还与其他小GTP酶相互作用,如Rab11b和Rab4a。然而,只有Rab11a是Tbc1d9b的底物,能够被其刺激GTP水解。在低镁离子浓度(<0.5 mM)的条件下,Rab8a也成为了Tbc1d9b的底物。这表明Tbc1d9b能够调节多种小GTP酶的活性,并可能参与多种细胞内生物学过程。

在极化的马叮-达比犬肾细胞(MDCK细胞)中,内源性的Tbc1d9b与Rab11a阳性的循环内体共定位,而与早期内体、循环内体或晚期内体共定位较少。过表达Tbc1d9b能够降低由Rab11a依赖的从基底外侧到顶部的IgA穿细胞转运速率,而Tbc1d9b的RNA干扰则增加了这种转运速率。这表明Tbc1d9b能够调节Rab11a依赖的细胞内物质转运过程。此外,Tbc1d9b的表达还能够降低细胞中活性Rab11a的含量,并破坏Rab11a与其效应蛋白Sec15A之间的相互作用。这些结果表明,Tbc1d9b是一种Rab11a的GAP,能够调节极化MDCK细胞中的基底外侧到顶部的穿细胞转运过程[1]。

Tbc1d9b还与哺乳动物自噬相关基因8(ATG8)同源物相互作用,从而调节自噬通量。自噬是一种细胞内降解和回收机制,对于维持细胞内稳态和应对各种应激刺激至关重要。Tbc1d9b与LC3B相互作用,并能够与LC3B共定位在自噬体膜上。抑制Tbc1d9b能够抑制膜结合的LC3B的周转和长寿蛋白的自噬降解。这表明Tbc1d9b能够正调节自噬通量,可能通过其GTPase活性来抑制Rab11a,从而促进自噬体向降解途径的正确转运[2]。

在急性心肌梗死(AMI)后心力衰竭(HF)的发展中,Tbc1d9b也发挥着重要作用。通过对AMI患者基因表达数据的加权基因共表达网络分析(WGCNA),发现Tbc1d9b是HF发展的关键基因之一。Tbc1d9b的表达与HF的发展密切相关,并且与炎症反应、免疫系统和凋亡等功能相关。这表明Tbc1d9b可能在AMI后HF的发展中发挥重要的调节作用[3]。

在感染致病性牛分枝杆菌(M. bovis)的人巨噬细胞中,Tbc1d9b也表现出重要的功能。通过比较蛋白质组学分析,发现Tbc1d9b与病毒体蛋白VPS26A相互作用,而VPS26A是由M. bovis感染所特有的。这表明Tbc1d9b可能在M. bovis感染过程中发挥重要的调节作用,并可能参与病毒体的形成和转运[4]。

综上所述,Tbc1d9b是一种重要的GAP,能够调节多种小GTP酶的活性,包括Rab11a。Tbc1d9b在细胞内囊泡运输、自噬和炎症反应等多种生物学过程中发挥关键作用。Tbc1d9b的表达与AMI后HF的发展和M. bovis感染密切相关,表明它在疾病发生和发展中可能具有重要的调节作用。未来对Tbc1d9b的深入研究将为理解细胞内生物学过程和疾病发生机制提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Gallo, Luciana I, Liao, Yong, Ruiz, Wily G, Apodaca, Gerard, Yin, Xiao-Ming. 2014. TBC1D9B functions as a GTPase-activating protein for Rab11a in polarized MDCK cells. In Molecular biology of the cell, 25, 3779-97. doi:10.1091/mbc.E13-10-0604. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25232007/
2. Liao, Yong, Li, Min, Chen, Xiaoyun, Jiang, Yu, Yin, Xiao-Ming. 2018. Interaction of TBC1D9B with Mammalian ATG8 Homologues Regulates Autophagic Flux. In Scientific reports, 8, 13496. doi:10.1038/s41598-018-32003-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30202024/
3. Niu, Xiaowei, Zhang, Jingjing, Zhang, Lanlan, Bai, Ming, Zhang, Zheng. 2019. Weighted Gene Co-Expression Network Analysis Identifies Critical Genes in the Development of Heart Failure After Acute Myocardial Infarction. In Frontiers in genetics, 10, 1214. doi:10.3389/fgene.2019.01214. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31850068/
4. Li, Pei, Wang, Rui, Dong, Wenqi, Chen, Huanchun, Tan, Chen. 2017. Comparative Proteomics Analysis of Human Macrophages Infected with Virulent Mycobacterium bovis. In Frontiers in cellular and infection microbiology, 7, 65. doi:10.3389/fcimb.2017.00065. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28337427/