Tgds-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Tgds-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-14837

品系全称

C57BL/6JCya-Tgdsem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-76355-Tgds-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tgds-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-14837) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TDP-glucose 4,6-dehydratase
基因别称
2610017J16Rik,2610025M23Rik
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_029578.3 | Ensembl: ENSMUST00000022727
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~8955 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1923605Mice homozygous for an ENU-induced allele exhibit micrognathia and cleft palate.
基因TGDS,也称为TDP-葡萄糖4,6-脱水酶,是一种编码TDP-葡萄糖4,6-脱水酶的基因。TDP-葡萄糖4,6-脱水酶是一种酶,参与糖的生物合成途径,特别是甘露糖和N-乙酰氨基葡萄糖的生物合成。TDP-葡萄糖4,6-脱水酶在糖的生物合成途径中发挥着重要作用,特别是在甘露糖和N-乙酰氨基葡萄糖的生物合成过程中。

TGDS基因的突变与多种疾病相关。例如,Catel-Manzke综合征是一种罕见的常染色体隐性遗传病,其特征是Pierre-Robin序列和双侧超指(超指)导致桡骨弯曲和食指桡骨偏斜。目前,在八名患有典型Catel-Manzke综合征的个体和一名具有附加特征的胎儿中检测到了双等位TGDS基因的致病性突变。此外,两名具有TGDS基因致病性突变的个体表现出轻度桡骨偏斜和食指桡骨弯曲,但没有超指的放射学迹象。此外,这两名个体还具有不成比例的身材矮小,这是Catel-Manzke综合征尚未关联的特征。这些数据扩展了TGDS相关Catel-Manzke综合征的表型谱,并扩展了诊断测试的指征[1]。

此外,TGDS基因的突变还与先天性小瞳症(MCOR)相关。先天性小瞳症是一种罕见的常染色体显性遗传病,其特征是虹膜不能扩张,因为缺少瞳孔扩张肌。通过使用全基因组寡核苷酸阵列CGH,研究人员在六家来自法国、日本和墨西哥的MCOR受累家庭中发现了13q32.1上的缺失,这些缺失与MCOR相关。断点序列分析显示,在5/6个家庭中存在非复发性缺失。缺失的大小从35 kbp到80 kbp不等,但始终包含或中断了两个基因:编码TDP-葡萄糖4,6-脱水酶的TGDS基因和编码G蛋白偶联受体180的GPR180基因,也称为内膜厚度相关受体(ITR)。与TGDS不同,GPR180在肌肉细胞中没有任何已知的功能,而GPR180参与调节平滑肌细胞生长。在一个家庭中,一个GPR180的无义突变与虹膜角膜角发育不良相关,这可以被视为MCOR的表型,这与以下观点一致:缺失该基因,无论是否丢失调节邻近基因表达的元件,都是MCOR的原因[3]。

此外,TGDS基因的突变还与某些类型的癌症相关。例如,在肺腺癌(LUAD)患者中,TGDS基因的突变与不良预后相关。一项研究建立了一个新的与糖基转移酶(GTs)相关的风险模型,用于预测LUAD患者的预后。该模型包括B3GNT3、MFNG、GYLTL1B、ALG3和GALNT13等基因,这些基因在LUAD中具有预后意义。此外,TGDS基因的表达水平与浸润免疫细胞相关,表明TGDS基因在LUAD的免疫微环境中发挥重要作用[2]。

综上所述,基因TGDS编码TDP-葡萄糖4,6-脱水酶,参与糖的生物合成途径,特别是甘露糖和N-乙酰氨基葡萄糖的生物合成。TGDS基因的突变与多种疾病相关,包括Catel-Manzke综合征、先天性小瞳症和某些类型的癌症。进一步研究TGDS基因的生物学功能和突变机制将有助于深入理解这些疾病的发生机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Boschann, Felix, Stuurman, Kyra E, de Bruin, Christiaan, Kant, Sarina G, Ehmke, Nadja. 2019. TGDS pathogenic variants cause Catel-Manzke syndrome without hyperphalangy. In American journal of medical genetics. Part A, 182, 431-436. doi:10.1002/ajmg.a.61419. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31769200/
2. Liang, Jin-Xiao, Chen, Qian, Gao, Wei, Han, Bing-Bing, Liu, Jin-Shi. 2022. A novel glycosylation-related gene signature predicts survival in patients with lung adenocarcinoma. In BMC bioinformatics, 23, 562. doi:10.1186/s12859-022-05109-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36575396/
3. Fares-Taie, Lucas, Gerber, Sylvie, Tawara, Akihiko, Roche, Olivier, Rozet, Jean-Michel. 2015. Submicroscopic deletions at 13q32.1 cause congenital microcoria. In American journal of human genetics, 96, 631-9. doi:10.1016/j.ajhg.2015.01.014. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25772937/