Ep400-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Ep400-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-14666

品系全称

C57BL/6JCya-Ep400em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-75560-Ep400-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ep400-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-14666) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
E1A binding protein p400
基因别称
1700020J09Rik,mDomino,mKIAA1498,p400
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_029337 | Ensembl: ENSMUST00000041558
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~3.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1276124Mice homozygous for a knock-out allele die at E11.5 and display severe defects in yolk sac erythropoiesis, anemia, and a slight deformity of the neural tube.
EP400,也称为E1A结合蛋白P400,是一种重要的ATP依赖性染色质重塑因子。它作为人类NuA4/TIP60乙酰转移酶和染色质重塑复合物的一个亚基,参与调控基因表达和维持基因组稳定性。EP400在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。

EP400在哺乳动物SWI/SNF染色质重塑复合物中发挥着重要作用,负责在基因启动子和增强子处移动和驱逐核小体,以调节DNA的访问。当SWI/SNF活性被抑制时,EP400能够补偿性地重建启动子的可访问性,从而维持基因表达。研究发现,EP400与SWI/SNF在癌症细胞系中具有合成致死性,这表明EP400在癌症发生发展中可能发挥着重要作用[1]。

EP400还在卵母细胞质量和早期胚胎发育中发挥着关键作用。EP400作为H3.3的伴侣蛋白,在卵母细胞中积累,并通过调节H3.3在常染色质和异染色质之间的分布,促进转录延长,激活调节线粒体功能的基因表达,以及促进三羧酸循环限速酶的表达。这些过程确保了早期胚胎发育的正常进行,强调了EP400在母体到胚胎转变中的重要作用[2]。

EP400在基因激活过程中负责将H3.3沉积到启动子和增强子中。研究发现,EP400与乙酰化的H2AZ和H3.3结合,刺激转录,并在体内促进H2AZ/H3.3沉积到启动子和增强子中。这些研究揭示了EP400在基因调控中的作用机制[3]。

EP400作为NuA4/TIP60复合物的支架,维持了复合物的结构稳定性,并与其他亚基相互作用。EP400的缺失会导致NuA4/TIP60复合物的错位,进而影响H2A.Z的分布和乙酰化,强调了EP400在NuA4/TIP60复合物中的重要作用[4]。

EP400的N末端类似物EP400NL也是一种染色质重塑因子,能够形成NuA4样染色质重塑复合物,并具有H2A.Z沉积活性。EP400NL在血清和IFNγ诱导的PD-L1基因激活中发挥着重要作用,并参与cMyc响应性线粒体生物合成[5]。

EP400的突变与一些遗传疾病相关,如癫痫和神经发育障碍。研究发现,EP400在发育中的大脑和细胞分化过程中高度表达,表明其在神经发育中的重要作用。EP400的敲低导致Drosophila癫痫易感性增加和神经元放电异常,而ep400敲除的斑马鱼表现出大脑发育异常和癫痫发作[6]。

EP400的突变还与一些癌症相关,如结直肠癌。研究发现,结直肠癌细胞系中存在与原发性肿瘤相似的基因突变和DNA拷贝数谱,包括染色质重塑基因和组蛋白修饰基因的突变[7]。

综上所述,EP400是一种重要的染色质重塑因子,参与调控基因表达和维持基因组稳定性。EP400在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。EP400的研究有助于深入理解染色质重塑的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Martin, Benjamin J E, Ablondi, Eileen F, Goglia, Christine, Espinel-Cabrera, Piero R, Adelman, Karen. 2023. Global identification of SWI/SNF targets reveals compensation by EP400. In Cell, 186, 5290-5307.e26. doi:10.1016/j.cell.2023.10.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37922899/
2. Tian, Qing, Yin, Ying, Tian, Yu, Xiang, Wenpei, Zhou, Li-Quan. 2024. Chromatin Modifier EP400 Regulates Oocyte Quality and Zygotic Genome Activation in Mice. In Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany), 11, e2308018. doi:10.1002/advs.202308018. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38493496/
3. Pradhan, Suman K, Su, Trent, Yen, Linda, Kurdistani, Siavash K, Carey, Michael F. 2015. EP400 Deposits H3.3 into Promoters and Enhancers during Gene Activation. In Molecular cell, 61, 27-38. doi:10.1016/j.molcel.2015.10.039. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26669263/
4. Yang, Zhenlin, Mameri, Amel, Cattoglio, Claudia, Côté, Jacques, Nogales, Eva. 2024. Structural insights into the human NuA4/TIP60 acetyltransferase and chromatin remodeling complex. In Science (New York, N.Y.), 385, eadl5816. doi:10.1126/science.adl5816. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39088653/
5. Li, Zidong, Kim, Hyoungmin, Kim, Jaehoon, Park, Jeong Hyeon. 2022. EP400NL is involved in PD-L1 gene activation by forming a transcriptional coactivator complex. In Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms, 1866, 194889. doi:10.1016/j.bbagrm.2022.194889. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36328277/
6. Endo, Makoto, Kohashi, Kenichi, Yamamoto, Hidetaka, Iwamoto, Yukihide, Oda, Yoshinao. 2013. Ossifying fibromyxoid tumor presenting EP400-PHF1 fusion gene. In Human pathology, 44, 2603-8. doi:10.1016/j.humpath.2013.04.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23806526/
7. Monies, Dorota, Abouelhoda, Mohamed, AlSayed, Moeenaldeen, Meyer, Brian F, Alkuraya, Fowzan S. 2017. The landscape of genetic diseases in Saudi Arabia based on the first 1000 diagnostic panels and exomes. In Human genetics, 136, 921-939. doi:10.1007/s00439-017-1821-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28600779/