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Bcdin3d-KO 基因敲除小鼠
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复苏/繁育服务
基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
BCDIN3 domain containing
基因别称
4930556P03Rik
染色体号
Chr 15 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_029236 | Ensembl: ENSMUST00000040313
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~2
敲除长度
~4.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
BCDIN3D，全称为Bicoid interacting 3 domain containing RNA methyltransferase，是一种RNA甲基转移酶，能够特异性地对tRNAHis的5'-单磷酸进行单甲基化修饰。这种甲基化过程需要S-腺苷甲硫氨酸（SAM）作为甲基供体。在人类中，BCDIN3D的过表达与乳腺癌的肿瘤发生和不良预后有关。此外，BCDIN3D的基因位点还与肥胖和II型糖尿病（T2D）相关联[2]。
在结构上，BCDIN3D采用经典的Rossmann折叠结构，这种结构特征在许多甲基转移酶中普遍存在。与MePCE（一种特异性对7SK RNA的5'-γ-磷酸进行单甲基化的酶）的结构比较揭示了BCDIN3D进行单甲基转移的关键氨基酸残基，以及BCDIN3D识别tRNAHis的机制。tRNAHis结合到BCDIN3D的结构模型表明，tRNAHis的G-1:A73错配对允许BCDIN3D的N端α螺旋嵌入到tRNAHis中，从而使得tRNAHis的5'-单磷酸深入到BCDIN3D的催化口袋中，从而进行5'-磷酸甲基化[1]。
BCDIN3D在细胞代谢中也发挥重要作用。研究表明，BCDIN3D通过let-7 microRNA家族调节Aldolase C（ALDOC）的表达，进而影响糖酵解过程。在BCDIN3D缺失的乳腺癌细胞中，F1,6-BP水平升高，而ALDOC的表达下调。ALDOC的高表达与乳腺癌的不良预后相关。BCDIN3D通过非经典的机制，即通过let-7 microRNA家族及其在ALDOC 3'非编码区（3'UTR）上的靶点来调节ALDOC的表达[2]。
BCDIN3D在生殖生物学中也扮演着重要角色。在果蝇中，BCDIN3D的同源基因CG1239对于雌性生育能力至关重要。卵巢特异性敲低BCDIN3D会导致雌性不育。此外，BCDIN3D敲低卵巢的miRNA和mRNA表达谱发生了改变，许多失调的基因涉及代谢过程、核糖核蛋白复合物调控和翻译控制等途径[3]。
BCDIN3D的基因多态性与多种疾病相关。例如，BCDIN3D的基因多态性可能与冠心病的风险相关。在中国汉族人群中，BCDIN3D基因附近的单核苷酸多态性（SNP）与肥胖有关，而MC4R基因附近的SNP与肥胖和冠心病风险相关[4]。此外，BCDIN3D的基因多态性还与I型甲状旁腺功能亢进（PHPT）的风险相关[5]。在东亚人群中，BCDIN3D基因附近的SNP与肥胖和II型糖尿病的风险相关[6]。儿童肥胖的基因位点也与儿童BMI轨迹相关，包括BCDIN3D基因[7]。此外，肥胖易感位点对出生体重的影响有限，但MTCH2和FTO基因位点与出生体重相关[8]。
综上所述，BCDIN3D是一种重要的RNA甲基转移酶，参与调控tRNAHis的甲基化修饰，影响细胞代谢和生殖生物学过程。BCDIN3D的基因多态性与肥胖、II型糖尿病、冠心病和I型甲状旁腺功能亢进等多种疾病相关。BCDIN3D的研究有助于深入理解RNA修饰的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Liu, Yining, Martinez, Anna, Yamashita, Seisuke, Tomita, Kozo. . Crystal structure of human cytoplasmic tRNAHis-specific 5'-monomethylphosphate capping enzyme. In Nucleic acids research, 48, 1572-1582. doi:10.1093/nar/gkz1216. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31919512/
2. Reinsborough, Calder W, Ipas, Hélène, Abell, Nathan S, Van Den Berg, Carla, Xhemalçe, Blerta. 2021. BCDIN3D RNA methyltransferase stimulates Aldolase C expression and glycolysis through let-7 microRNA in breast cancer cells. In Oncogene, 40, 2395-2406. doi:10.1038/s41388-021-01702-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33664453/
3. Zhu, Li, Liao, Susan E, Ai, Yiwei, Fukunaga, Ryuya. 2019. RNA methyltransferase BCDIN3D is crucial for female fertility and miRNA and mRNA profiles in Drosophila ovaries. In PloS one, 14, e0217603. doi:10.1371/journal.pone.0217603. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31145769/
4. Huang, Hao, Zeng, Zhi, Zhang, Li, Qiang, Ou, Chen, Yucheng. 2011. Implication of genetic variants near TMEM18, BCDIN3D/FAIM2, and MC4R with coronary artery disease and obesity in Chinese: a angiography-based study. In Molecular biology reports, 39, 1739-44. doi:10.1007/s11033-011-0914-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21625854/
5. Soto-Pedre, Enrique, Newey, Paul J, Srinivasan, Sundararajan, Palmer, Colin N A, Leese, Graham P. . Identification of 4 New Loci Associated With Primary Hyperparathyroidism (PHPT) and a Polygenic Risk Score for PHPT. In The Journal of clinical endocrinology and metabolism, 107, 3302-3308. doi:10.1210/clinem/dgac527. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36102151/
6. Takeuchi, F, Yamamoto, K, Katsuya, T, Takayanagi, R, Kato, N. 2011. Association of genetic variants for susceptibility to obesity with type 2 diabetes in Japanese individuals. In Diabetologia, 54, 1350-9. doi:10.1007/s00125-011-2086-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21369819/
7. Warrington, Nicole M, Wu, Yan Yan, Pennell, Craig E, Lye, Stephen J, Briollais, Laurent. 2013. Modelling BMI trajectories in children for genetic association studies. In PloS one, 8, e53897. doi:10.1371/journal.pone.0053897. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23349760/
8. Kilpeläinen, Tuomas O, den Hoed, Marcel, Ong, Ken K, Wareham, Nicholas J, Loos, Ruth J F. 2011. Obesity-susceptibility loci have a limited influence on birth weight: a meta-analysis of up to 28,219 individuals. In The American journal of clinical nutrition, 93, 851-60. doi:10.3945/ajcn.110.000828. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21248185/
| 精子检测 | ① 冷冻前验证精子活力观察 ② 冷冻验证每批次进行复苏验证 | 交付状态 | 活体/精子 |
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