Parn-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Parn-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-14287

品系全称

C57BL/6JCya-Parnem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-74108-Parn-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Parn-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-14287) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease)
基因别称
1200003I18Rik,DAN
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028761.3 | Ensembl: ENSMUST00000058884
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~2956 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1921358Mice homozygous for a null allele die prior to E11.5.
PARN,即多聚腺苷酸特异性核糖核酸酶,是一种在真核细胞中发挥关键作用的酶。它主要负责RNA代谢中的一个重要过程——去腺苷酸化,即从mRNA的3'末端移除腺苷酸残基。这一过程是RNA降解的第一步,也是最为关键的一步,因为mRNA的稳定性和寿命直接受到其3'末端多聚腺苷酸尾巴长度的影响。PARN的活性因此对基因表达的调控至关重要,它不仅影响着mRNA的降解速率,还可能影响mRNA的翻译效率。

在植物线粒体中,PARN样蛋白在基因表达调控中扮演了重要角色。植物线粒体拥有其独特的双链DNA基因组,以及与宿主细胞和其它真核生物不同的转录、mRNA加工和翻译系统。研究发现,植物线粒体中mRNA的多聚腺苷酸化状态对其稳定性和翻译至关重要。PARN样蛋白通过调节mRNA的多聚腺苷酸化状态,影响了植物线粒体中基因的表达[1]。

PARN的功能远不止于“mRNA库存清理”。除了在mRNA降解中发挥作用,PARN还参与了胚胎发生、卵母细胞成熟、细胞周期进展、端粒生物学、非编码RNA成熟和核糖体生物发生等多个生物学过程。此外,PARN活性的失调被认为是某些疾病状态的标志,包括癌症和遗传性骨髓衰竭综合征。在人类疾病中,PARN基因的致病性变异已在多种癌症和遗传性骨髓衰竭综合征中被观察到[2]。

在阿尔茨海默病(AD)和相关的痴呆症(ADD)中,基因遗传学研究已经揭示了与这些疾病相关的多个风险位点,其中一些位点可能与PARN的功能相关。这些研究发现为理解AD和ADD的病理生理过程提供了新的视角[3]。

在芬兰的一个遗传研究项目FinnGen中,通过对50万芬兰人的基因组和健康登记数据的研究,发现了许多与常见疾病相关的低频变体。这些研究结果表明,瓶颈人口在发现与常见疾病相关的低频、高影响变体方面具有独特的优势[4]。

在子痫前期和妊娠期高血压疾病中,基因研究已经确定了与这些疾病相关的多个风险位点,其中包括一些可能与PARN功能相关的基因。这些发现表明,与血压特性相关的基因与子痫前期相关,但这些基因对心血管疾病、内皮功能和胎盘功能还有额外的多效性影响[5]。

NTHL1基因被确定为一种隐性癌症易感基因。在FinnGen数据中,NTHL1基因的变异与乳腺癌的风险增加相关。此外,研究结果还表明,NTHL1基因的变异与结直肠癌、尿路和基底细胞皮肤癌的高风险相关,支持NTHL1作为隐性多肿瘤易感基因[6]。

PARN、TOE1和USB1这三种RNA去腺苷酸化酶在非编码RNA的调控中发挥着重要作用。这些酶通过去除非编码RNA的寡聚(A)尾巴,从而保护这些RNA免受降解。这些基因的失功能突变会导致某些非编码RNA的过早降解,并导致如点状鱼鳞病伴中性粒细胞减少症(PN)、先天性角化不良(DC)和桥脑小脑发育不良7型(PCH7)等特定的人类疾病[7]。

在胶质母细胞瘤中,PARN通过激活EGFR-STAT3信号通路,支持胶质母细胞瘤干细胞(GSC)的自我更新和增殖。研究发现,PARN表达与患者不良预后和高恶性相关。PARN通过其3'-5'外切核酸酶活性,通过负调控EGFR靶向miRNA miR-7来正向调控EGFR,进而增加EGFR表达,形成一个正反馈循环来增加STAT3的激活。PARN在GSC中的耗竭减少了浸润并延长了正位脑肿瘤异种移植物的存活时间;类似的结果在使用siRNA纳米胶囊介导的PARN靶向中也得到了证实。PARN的药理学靶向也证实了STAT3信号对PARN的调节。这些结果表明,STAT3-PARN调节网络在肿瘤进展中发挥着关键作用,因此可能成为胶质母细胞瘤治疗的一个靶点[8]。

综上所述,PARN是一种重要的RNA代谢调控酶,它在多种生物学过程中发挥着关键作用,包括mRNA降解、非编码RNA调控、肿瘤进展等。PARN的失调与多种人类疾病相关,包括癌症、遗传性骨髓衰竭综合征、阿尔茨海默病、子痫前期和妊娠期高血压疾病等。因此,深入研究PARN的功能和调控机制,对于理解这些疾病的发病机制和开发新的治疗方法具有重要意义。

参考文献:
1. Hirayama, Takashi. 2021. PARN-like Proteins Regulate Gene Expression in Land Plant Mitochondria by Modulating mRNA Polyadenylation. In International journal of molecular sciences, 22, . doi:10.3390/ijms221910776. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34639116/
2. Nanjappa, Dechamma Pandyanda, Babu, Nishith, Khanna-Gupta, Arati, Sips, Patrick, Chakraborty, Anirban. 2021. Poly (A)-specific ribonuclease (PARN): More than just "mRNA stock clearing". In Life sciences, 285, 119953. doi:10.1016/j.lfs.2021.119953. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34520768/
3. Bellenguez, Céline, Küçükali, Fahri, Jansen, Iris E, Ramirez, Alfredo, Lambert, Jean-Charles. 2022. New insights into the genetic etiology of Alzheimer's disease and related dementias. In Nature genetics, 54, 412-436. doi:10.1038/s41588-022-01024-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35379992/
4. Kurki, Mitja I, Karjalainen, Juha, Palta, Priit, Daly, Mark J, Palotie, Aarno. 2023. FinnGen provides genetic insights from a well-phenotyped isolated population. In Nature, 613, 508-518. doi:10.1038/s41586-022-05473-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36653562/
5. Tyrmi, Jaakko S, Kaartokallio, Tea, Lokki, A Inkeri, Kere, Juha, Laivuori, Hannele. . Genetic Risk Factors Associated With Preeclampsia and Hypertensive Disorders of Pregnancy. In JAMA cardiology, 8, 674-683. doi:10.1001/jamacardio.2023.1312. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37285119/
6. Nurmi, Anna K, Pelttari, Liisa M, Kiiski, Johanna I, Blomqvist, Carl, Nevanlinna, Heli. 2023. NTHL1 is a recessive cancer susceptibility gene. In Scientific reports, 13, 21127. doi:10.1038/s41598-023-47441-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38036545/
7. Huynh, Thao Ngoc, Parker, Roy. 2023. The PARN, TOE1, and USB1 RNA deadenylases and their roles in non-coding RNA regulation. In The Journal of biological chemistry, 299, 105139. doi:10.1016/j.jbc.2023.105139. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37544646/
8. Yin, Jinlong, Seo, Yoona, Rhim, Jiho, Park, Jong Bae, Kim, Jong Heon. . Cross-talk between PARN and EGFR-STAT3 Signaling Facilitates Self-Renewal and Proliferation of Glioblastoma Stem Cells. In Cancer research, 83, 3693-3709. doi:10.1158/0008-5472.CAN-22-3965. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37747775/