Slc35a5-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Slc35a5-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-14283

品系全称

C57BL/6JCya-Slc35a5em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-74102-Slc35a5-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Slc35a5-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-14283) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
solute carrier family 35, member A5
基因别称
1010001J06Rik,D16Ertd450e,D730043G07Rik
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028756.4 | Ensembl: ENSMUST00000023344
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~6
敲除长度
~9055 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Slc35a5,也称为溶质载体家族35成员A5,是一种重要的蛋白质,属于SLC35A蛋白亚家族,这个亚家族包含有核苷酸糖转运蛋白。然而,Slc35a5的确切功能尚需通过实验进一步确定。一项研究发现,在HepG2细胞系中敲除Slc35a5基因并没有影响N-或O-糖基化,也没有影响糖脂合成。但是,Slc35a5基因的失活导致硫酸软骨素蛋白聚糖的水平略有增加。此外,Slc35a5基因的失活导致尿苷二磷酸(UDP)-葡萄糖醛酸、UDP-N-乙酰葡萄糖胺和UDP-N-乙酰半乳糖胺在Golgi的摄取减少,而对UDP-半乳糖的转运活性没有影响。进一步的研究表明,Slc35a5蛋白质仅定位于高尔基体。蛋白质序列的深入分析显示,该蛋白质的C端非常酸性,并包含独特的基序,如DXEE、DXD和DXXD。研究还表明,Slc35a5的C端朝向细胞质。Slc35a5还与其他SLC35A蛋白亚家族成员形成同源二聚体和异源二聚体。总的来说,Slc35a5蛋白质可能是Golgi驻留的多蛋白复合物成员,参与核苷酸糖转运[1]。

另一项研究发现,全基因组研究确定了细胞对紫杉醇的易感性中的溶质载体转运蛋白。紫杉醇的临床应用受到反应差异和潜在严重毒性的限制。到目前为止,候选基因中变异与紫杉醇效应之间的关联研究产生了相互矛盾的结果。研究者旨在评估全基因组基因表达与紫杉醇敏感性之间的关系。他们利用国际HapMap项目产生的基因分型良好的淋巴母细胞系来评估细胞对紫杉醇的易感性与全基因组基因表达之间的关系。细胞暴露于不同浓度的紫杉醇以评估紫杉醇诱导的细胞毒性和凋亡。在所有与紫杉醇诱导的细胞毒性相关的基因中(P值小于0.05,共1713个基因),SLC基因有显著富集(共31个基因)。SLC基因的一个子集,即SLC31A2、SLC43A1、SLC35A5和SLC41A2,与紫杉醇敏感性相关,并且具有调节SLC基因表达水平和紫杉醇敏感性的单核苷酸多态性。多变量模型表明,这四个SLC基因共同解释了紫杉醇易感性的20%。使用RNA干扰,研究者发现敲低三个SLC基因,即SLC31A2、SLC35A5和SLC41A2,会导致紫杉醇敏感性增加。这些发现是新颖的,并为转运蛋白,特别是溶质载体,在介导细胞对紫杉醇的易感性中的作用提供了进一步的支持[2]。

还有研究发现,Slc35a5基因家族成员在人类乳腺癌中的预后和免疫学价值有新的见解。根据2020年的统计数据,女性乳腺癌(BRCA)成为全球最常见的恶性肿瘤。BRCA患者的预后仍然很差,尤其是在有晚期或转移性肿瘤的人群中。尽管意识到SLC35A基因家族在肿瘤发生和发展中发挥着关键作用,但每个成员在人类BRCA中的特定功能仍然未知。利用整合的生物信息学分析,根据转录组学、蛋白质组学和高通量测序来确定特定癌症的治疗靶点,研究者获得了新的信息,并更好地理解了潜在的分子机制。利用属于癌症基因组图谱(TCGA)的BRCA数据集来阐明SLC35A基因表达水平。然后,使用生物信息学方法来研究与BRCA发展相关的SLC35A家族基因的生物学过程。此外,使用Kaplan-Meier估计量来探索SLC35A家族基因在BCRA患者中的预测价值。在这家族基因的个体中,SLC35A2的表达水平与不良预后值密切相关,这是由于风险比(HR)为1.3(95%置信区间(95% CI:1.18-1.44),趋势P值为3.1 × 10^-7)。此外,功能富集分析显示,SLC35A2与低氧诱导因子1A(HIF1A)、热休克蛋白(HSP)、E2转录因子(E2F)、DNA损伤和细胞周期相关信号相关。在特定类型的免疫细胞中观察到的浸润水平,尤其是巨噬细胞和粒细胞上的分化簇,与多个人类乳腺癌亚类(Luminal A、Luminal B、Basal和人类表皮生长因子受体2)中的SLC35A2表达呈正相关。总的来说,SLC35A2表达与较低的复发无病生存率相关,表明它可能被用作治疗BRCA的生物标志物[3]。

综上所述,Slc35a5是一种重要的Golgi驻留的多蛋白复合物成员,参与核苷酸糖转运。Slc35a5基因的失活影响Golgi的糖基化过程,导致硫酸软骨素蛋白聚糖水平增加,并影响UDP-糖的摄取。Slc35a5基因还与细胞对紫杉醇的易感性相关,可能通过影响细胞的代谢和转运过程来介导细胞对紫杉醇的敏感性。此外,Slc35a5基因家族成员在乳腺癌中发挥着重要的免疫学价值,SLC35A2表达水平与乳腺癌的预后相关,可能作为乳腺癌的生物标志物。因此,Slc35a5基因的研究对于理解其在细胞代谢、转运和免疫学中的作用具有重要意义,并为相关疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Sosicka, Paulina, Bazan, Bożena, Maszczak-Seneczko, Dorota, Olczak, Teresa, Olczak, Mariusz. 2019. SLC35A5 Protein-A Golgi Complex Member with Putative Nucleotide Sugar Transport Activity. In International journal of molecular sciences, 20, . doi:10.3390/ijms20020276. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30641943/
2. Njiaju, Uchenna O, Gamazon, Eric R, Gorsic, Lidija K, Im, Hae Kyung, Dolan, M Eileen. . Whole-genome studies identify solute carrier transporters in cellular susceptibility to paclitaxel. In Pharmacogenetics and genomics, 22, 498-507. doi:10.1097/FPC.0b013e328352f436. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22437668/
3. Ta, Hoang Dang Khoa, Minh Xuan, Do Thi, Tang, Wan-Chun, Wang, Chih-Yang, Lee, Kuen-Haur. 2021. Novel Insights into the Prognosis and Immunological Value of the SLC35A (Solute Carrier 35A) Family Genes in Human Breast Cancer. In Biomedicines, 9, . doi:10.3390/biomedicines9121804. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34944621/