Pop7-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Pop7-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-14279

品系全称

C57BL/6JCya-Pop7em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-74097-Pop7-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pop7-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-14279) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
processing of precursor 7, ribonuclease P family, (S. cerevisiae)
基因别称
0610037N12Rik,Rpp20
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028753.2 | Ensembl: ENSMUST00000031728
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~418 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因POP7,也称为Processing of precursor 7,是RNase P和RNase MRP的亚基之一。RNase P是一种核糖核酸酶,负责切割tRNA前体中的5'端,而RNase MRP则参与rRNA前体的加工和线粒体基因的表达调控。尽管POP7在这些核糖核酸酶中的功能已被确定,但其在生物医学研究中的具体作用和机制仍需进一步探索。

在乳腺癌(BC)的研究中,研究发现POP7的表达在乳腺癌细胞和原发肿瘤中常常增加。过表达的POP7能够显著促进乳腺癌细胞的增殖,并促进原发肿瘤的生长。此外,POP7还能增加乳腺癌细胞的迁移和侵袭能力,以及体内肺转移的发生。通过RNA免疫沉淀结合测序(RIP-seq)技术,研究者发现POP7倾向于结合内含子区域,并且与POP7结合峰相关的基因主要富集在癌症相关的通路中。进一步的研究表明,POP7通过影响其mRNA的稳定性来调节白介素增强子结合因子3(ILF3)的表达。敲低ILF3的表达能够显著削弱过表达POP7的细胞增加的恶性潜能,这表明POP7通过调节ILF3的表达来增强乳腺癌的进展[1]。

在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的研究中,研究者分析了POP家族在ccRCC中的表达和预后价值,并揭示了POP7与ccRCC患者免疫浸润之间的关系。研究发现,POP家族在肿瘤和正常组织中的表达存在显著差异,尤其在ccRCC中。KM生存分析、单变量和多变量分析表明,POP7的低表达与ccRCC患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)较差相关。GSEA和TiMER2分析表明,POP7与CD8+细胞、CD4+细胞、NK细胞和TH1细胞相关,并且与ccRCC中的T细胞调节(Tregs)和骨髓来源的抑制细胞(MDSC)呈正相关,表明POP7是ccRCC的免疫抑制剂[2]。

在食管鳞状细胞癌(ESCC)的研究中,研究者发现CLK1和POP7的表达与ESCC患者的预后相关。CLK1的表达水平相对较低,而POP7的表达水平较高。生存分析表明,CLK1的高表达与食管癌的较差预后相关,而POP7的低表达也与较差的预后相关。基因集富集分析表明,与核糖体相关的异常生物学过程和TGF-β等经典肿瘤信号通路的异常是ESCC发生和发展的重要驱动因素[3]。

在新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的研究中,研究者开发了一种基于CRISPR-Cas和RT-LAMP技术的CLEVER检测方法,用于无需RNA提取即可快速诊断COVID-19。该方法利用患者鼻咽和/或口腔样本进行RT-LAMP扩增,并通过侧向流动读出方法进行视觉检测。此外,该方法还利用了CRISPR-Cas12系统,使用不同的向导RNA来检测SARS-CoV-2的N基因、E基因和内部对照POP7基因。该方法的临床灵敏度和特异性分别为89.6%和100%[4]。

综上所述,基因POP7在多种癌症中发挥重要作用,包括乳腺癌、透明细胞肾细胞癌和食管鳞状细胞癌。POP7的表达与肿瘤的发生、发展和预后相关,并且可能参与调节免疫浸润和RNA代谢过程。此外,POP7还在新型冠状病毒的诊断中发挥重要作用。未来需要进一步研究POP7的生物学功能和分子机制,以期为癌症和病毒感染的治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Huang, Yanni, Zheng, Yizi, Yao, Ling, Li, Daqiang, Shao, Zhiming. 2022. RNA binding protein POP7 regulates ILF3 mRNA stability and expression to promote breast cancer progression. In Cancer science, 113, 3801-3813. doi:10.1111/cas.15430. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35579257/
2. Lou, Ning, Meng, Xiangui, Yu, Tiexi, Xiao, Wen, Shi, Ying. 2024. Prognostic Value and Immunological Role of POP7 in Clear Cell Renal Cell Carcinoma. In Pharmacogenomics and personalized medicine, 17, 521-534. doi:10.2147/PGPM.S469247. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39620194/
3. Yang, Xiuping, Han, Baoai, He, Zuhong, Yang, Minlan, Chen, Xiong. 2021. RNA-Binding Proteins CLK1 and POP7 as Biomarkers for Diagnosis and Prognosis of Esophageal Squamous Cell Carcinoma. In Frontiers in cell and developmental biology, 9, 715027. doi:10.3389/fcell.2021.715027. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34568328/
4. Bhatt, Akansha, Fatima, Zeeshan, Ruwali, Munindra, Rattan, Ashok, Hameed, Saif. 2022. CLEVER assay: A visual and rapid RNA extraction-free detection of SARS-CoV-2 based on CRISPR-Cas integrated RT-LAMP technology. In Journal of applied microbiology, 133, 410-421. doi:10.1111/jam.15571. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35396760/