Fcf1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Fcf1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-14202

品系全称

C57BL/6JCya-Fcf1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-73736-Fcf1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Fcf1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-14202) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
FCF1 rRNA processing protein
基因别称
1110008B24Rik
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028632.2 | Ensembl: ENSMUST00000021669
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~6
敲除长度
~7613 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Fcf1,即Faf1 Complex Factor 1,是一种在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中发现的新型核仁蛋白。它由基因YDR339c编码,与Fcf2p共同参与前rRNA(pre-rRNA)的加工过程。Fcf1p和Fcf2p被发现在核仁中定位,并且对18S rRNA的合成至关重要。Fcf1p和Fcf2p的缺失会导致18S rRNA合成减少,进而影响40S核糖体亚基的生成。Northern分析表明,Fcf1p和Fcf2p的缺乏会导致pre-rRNA在A(0)、A(1)和A(2)剪切位点的加工效率降低[4]。

在人类细胞中,Fcf1的直系同源物是hUTP24,它是一种假定的PIN结构域含有的内切核糖核酸酶,参与rRNA成熟过程。hUTP24在rRNA成熟中发挥着重要作用,尤其是在A1位点的加工。研究发现,hUTP24在细胞中的缺失会导致细胞生长缓慢和代谢活性降低,这是由于40S核糖体亚基的生物合成缺陷,这是由18S rRNA的减少所导致的。有趣的是,与酵母不同,在hUTP24功能丧失的情况下,位于A1上游的A0位点能够被有效地加工。此外,hUTP24的失活会导致18S rRNA在正常A1剪切位点下游2个核苷酸处出现异常的加工[5]。

除了在核糖体生物合成中的角色,Fcf1在多种生物过程中也扮演着重要角色。在乳腺癌研究中,Fcf1被发现是循环肿瘤细胞(CTCs)中上调的基因之一。CTCs具有多种适应机制,以在血液中存活并最终发生转移。Fcf1在CTCs中的上调可能与其在细胞膜流动性增加、促进血液扩散和肺转移形成中的作用有关[1]。此外,在猪的基因组关联研究中,Fcf1被发现在影响乳头数量的基因和基因组区域中具有显著作用。这一发现表明Fcf1在哺乳动物发育过程中也发挥着重要作用[2]。

在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中,Fcf1的RNA编辑位点的变化被发现与患者的预后相关。RNA编辑是一种重要的表观遗传修饰,可以影响RNA的稳定性和功能。研究发现,Fcf1的RNA编辑位点可以作为ccRCC患者的独立预后因素。在ccRCC细胞中,Fcf1的表达显著上调,这表明Fcf1可能在ccRCC的发生和发展中发挥作用[3]。

综上所述,Fcf1是一种在多种生物过程中发挥重要作用的基因。它在核糖体生物合成、细胞膜流动性、肿瘤细胞转移和哺乳动物发育中发挥着重要作用。此外,Fcf1的RNA编辑位点的变化与ccRCC患者的预后相关。这些发现为进一步研究Fcf1的生物学功能和在疾病中的作用提供了重要的理论基础。

参考文献:
1. Fina, Emanuela, Cleris, Loredana, Dugo, Matteo, Daidone, Maria Grazia, Cappelletti, Vera. 2022. Gene signatures of circulating breast cancer cell models are a source of novel molecular determinants of metastasis and improve circulating tumor cell detection in patients. In Journal of experimental & clinical cancer research : CR, 41, 78. doi:10.1186/s13046-022-02259-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35216615/
2. Tan, Cheng, Wu, Zhenfang, Ren, Jiangli, Da, Yang, Hu, Xiaoxiang. 2017. Genome-wide association study and accuracy of genomic prediction for teat number in Duroc pigs using genotyping-by-sequencing. In Genetics, selection, evolution : GSE, 49, 35. doi:10.1186/s12711-017-0311-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28356075/
3. Chen, Weihong, Li, Shaobin, Huang, Dongqin, Wang, Jing, Liang, Zhiru. 2024. Identification of prognostic RNA editing profiles for clear cell renal carcinoma. In Frontiers in medicine, 11, 1390803. doi:10.3389/fmed.2024.1390803. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39091293/
4. Rempola, Bozenna, Karkusiewicz, Iwona, Piekarska, Iga, Rytka, Joanna. 2006. Fcf1p and Fcf2p are novel nucleolar Saccharomyces cerevisiae proteins involved in pre-rRNA processing. In Biochemical and biophysical research communications, 346, 546-54. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16762320/
5. Tomecki, Rafal, Labno, Anna, Drazkowska, Karolina, Cysewski, Dominik, Dziembowski, Andrzej. . hUTP24 is essential for processing of the human rRNA precursor at site A1, but not at site A0. In RNA biology, 12, 1010-29. doi:10.1080/15476286.2015.1073437. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26237581/