Spmip6基因,也称为SplA/ryanodine receptor domain and Ig-like domain-containing protein 6,是一种在哺乳动物细胞中发现的蛋白质编码基因。SplA/ryanodine receptor domain and Ig-like domain-containing蛋白家族成员在细胞信号传导和钙离子通道调控中发挥重要作用。Spmip6基因编码的蛋白质含有SplA/ryanodine受体结构域和免疫球蛋白样结构域,这些结构域可能与其生物学功能相关。
基因复制和基因丢失是动物基因组进化过程中的常见事件,这些动态过程之间的平衡导致了不同物种之间基因数量的显著差异[1]。在基因复制后,通常两个子基因会以大约相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均衡的,一个拷贝会与其同源基因发生显著差异[1]。这种非对称进化在串联基因复制后更为常见,并且可以产生实质上新的基因[1]。在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源基因中,非对称进化的例子已经被描述,每个例子都产生了新的同源基因,并被招募到新的发育角色中[1]。
乳腺癌是一种异质性疾病,大多数病例(约70%)被认为是散发性病例。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常在乳腺癌发病率高的家族中发现,已经与一些高、中、低渗透性的易感基因相关[2]。家族连锁研究已经确定了高渗透性基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征[2]。此外,基于家族和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关[2]。全基因组关联研究(GWAS)揭示了与乳腺癌风险略微升高或降低相关的常见低渗透性等位基因[2]。
在基因敲除实验中,了解基因型-表型关系是生物学研究的一个核心目标。基因敲除产生了一种完全失去功能的基因型,并且是一种常用的研究基因功能的方法。基因敲除的最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析,基因组中高达约四分之一的基因可以是必需基因。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性也受背景效应的影响,并且可能会因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过非基因抑制因子得到挽救[3]。
综上所述,Spmip6基因是SplA/ryanodine receptor domain and Ig-like domain-containing蛋白家族成员之一,在细胞信号传导和钙离子通道调控中发挥重要作用。基因复制和基因丢失是动物基因组进化过程中的常见事件,非对称进化可以产生实质上新的基因。乳腺癌与一些高、中、低渗透性的易感基因相关,这些基因在家族性乳腺癌中发挥重要作用。基因敲除实验可以帮助我们了解基因型-表型关系,特别是基因必需性。
参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/