Zup1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Zup1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13983

品系全称

C57BL/6JCya-Zup1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-72580-Zup1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Zup1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13983) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
zinc finger containing ubiquitin peptidase 1
基因别称
2700019D07Rik,DUB,Zufsp
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001359455 | Ensembl: ENSMUST00000218055
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~5.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1919830Mice homozygous for a null allele display increased susceptibility to RNA virus infection.
Zup1,也称为Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein 1(ZUFSP),是一种重要的去泛素化酶(DUB)。去泛素化酶通过修剪泛素链或从修饰的底物上去除泛素来调节泛素信号传导。Zup1属于一个独特的DUB家族,与已知的六个DUB类不同[4]。该家族成员通过使用不同的泛素结合域(UBDs)来广泛区分连接特异性[4]。Zup1具有K63连接特异性,其定位于细胞核,并具有蛋白质互作网络,这表明Zup1在DNA损伤反应中发挥作用[4]。

研究表明,Zup1在淋巴瘤放射治疗耐药性中发挥作用。通过使用CRISPR激活(CRISPRa)技术筛选淋巴瘤放射治疗耐药基因,研究人员发现Zup1是16个潜在耐药基因之一[1]。当与控制组相比,实验组中Zup1的mRNA表达显著上调,表明Zup1的表达与淋巴瘤放射治疗耐药性相关[1]。此外,Zup1还与RNA病毒感染中的干扰素信号传导相关。Zup1作为MAVS(线粒体抗病毒信号蛋白)的相互作用蛋白,可以促进干扰素-β(IFN-β)的产生和先天抗病毒免疫[2]。在RNA病毒感染后,Zup1从细胞质转移到细胞核,并与染色质重塑复合物相互作用,以促进IFN刺激基因(ISG)位点的开放,从而促进转录[2]。

此外,研究还发现Zup1具有去泛素化酶活性。通过活性位点为中心的化学生物谱方法,研究人员确认Zup1的催化半胱氨酸残基被探针标记,并揭示了Zup1在非催化半胱氨酸残基上的意外标记[3]。Zup1与复制蛋白A(RPA)复合物相互作用,并调节其泛素化[3]。这些结果表明,Zup1不仅参与DNA损伤反应,还参与调节泛素信号传导和染色质重塑。

此外,研究还发现Zup1蛋白中存在功能性非同义单核苷酸多态性(nsSNPs),这些nsSNPs可能参与遗传不稳定性和致癌作用。通过使用预测工具,研究人员发现8个nsSNPs可能具有致病性[5]。这些nsSNPs对Zup1结构的影响表明,它们降低了Zup1蛋白的稳定性。此外,保守性分析表明,某些nsSNPs在进化上高度保守[5]。这些发现表明,Zup1的nsSNPs可能作为某些疾病的遗传生物标志物,但需要进一步实验验证[5]。

综上所述,Zup1是一种重要的去泛素化酶,参与DNA损伤反应、泛素信号传导和染色质重塑。Zup1在淋巴瘤放射治疗耐药性和RNA病毒感染中的干扰素信号传导中发挥作用。此外,Zup1蛋白中的nsSNPs可能与遗传不稳定性和致癌作用相关。Zup1的研究有助于深入理解去泛素化酶的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Luo, Bi-Hua, Huang, Jian-Qing, Huang, Chun-Yu, Yuan, Yue-Xing, Yu, Lian. 2023. Screening of Lymphoma Radiotherapy-Resistant Genes with CRISPR Activation Library. In Pharmacogenomics and personalized medicine, 16, 67-80. doi:10.2147/PGPM.S386085. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36743888/
2. Li, Tongyu, Li, Siji. 2024. MAVS promotes interferon signaling in RNA virus infection by ZUFSP-mediated chromatin regulation. In International immunopharmacology, 131, 111819. doi:10.1016/j.intimp.2024.111819. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38460305/
3. Hewings, David S, Heideker, Johanna, Ma, Taylur P, Bogyo, Matthew, Wertz, Ingrid E. 2018. Reactive-site-centric chemoproteomics identifies a distinct class of deubiquitinase enzymes. In Nature communications, 9, 1162. doi:10.1038/s41467-018-03511-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29563501/
4. Hermanns, Thomas, Pichlo, Christian, Woiwode, Ilka, Baumann, Ulrich, Hofmann, Kay. 2018. A family of unconventional deubiquitinases with modular chain specificity determinants. In Nature communications, 9, 799. doi:10.1038/s41467-018-03148-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29476094/
5. Ajadi, Mary B, Soremekun, Opeyemi S, Adewumi, Adeniyi T, Kumalo, Hezekiel M, Soliman, Mahmoud E S. 2021. Functional Analysis of Single Nucleotide Polymorphism in ZUFSP Protein and Implication in Pathogenesis. In The protein journal, 40, 28-40. doi:10.1007/s10930-021-09962-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33512633/