Aplf-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Aplf-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13832

品系全称

C57BL/6JCya-Aplfem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-72103-Aplf-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Aplf-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13832) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
aprataxin and PNKP like factor
基因别称
2010301N04Rik
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001170489.1 | Ensembl: ENSMUST00000032130
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~4803 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1919353Mice homozygous for a gene trap allele exhibit decreased repair of gamma irradiation-induced DNA damage and increased microhomology at class switch recombination junctions in B cells.
APLF(Aprataxin and PNK-like factor),也称为C2orf13,是一种重要的DNA损伤修复因子和组蛋白伴侣蛋白。APLF在细胞中对DNA损伤的反应中发挥着关键作用,参与非同源末端连接(NHEJ)和同源重组(HR)两种DNA双链断裂(DSB)修复途径。此外,APLF还参与细胞周期的调控、组蛋白修饰和细胞命运决定等过程。

APLF的生物学功能主要表现在以下几个方面:

1. DNA损伤修复:APLF通过其FHA结构域与XRCC1和XRCC4等DNA损伤修复蛋白相互作用,促进NHEJ途径的修复过程。同时,APLF还参与HR途径,通过促进FANCD2等HR相关蛋白的募集,保护复制叉的稳定性,防止DNA双链断裂的产生[1,2,3,4,6,8]。

2. 组蛋白修饰:APLF作为组蛋白伴侣蛋白,调节组蛋白H3K27me3的去甲基化,影响基因表达和细胞命运决定。研究发现,APLF的敲低可以促进小鼠成纤维细胞的重编程过程,提高诱导多能干细胞(iPSCs)的生成效率[7]。

3. 细胞周期调控:APLF在细胞周期中发挥重要作用,其表达水平与细胞增殖、迁移和侵袭能力密切相关。研究发现,APLF在乳腺癌组织中高表达,且其核定位与乳腺癌的侵袭和转移密切相关[3,5]。

4. 与其他蛋白的相互作用:APLF可以与PARP1、PARP3等蛋白相互作用,共同参与DNA损伤修复过程。此外,APLF还可以与长链非编码RNA(lncRNA)NIHCOLE相互作用,稳定DNA末端连接,促进NHEJ途径的修复过程[2,4]。

综上所述,APLF在DNA损伤修复、组蛋白修饰、细胞周期调控等方面发挥着重要作用。APLF的异常表达与多种疾病的发生和发展密切相关,如乳腺癌、膀胱癌等。因此,深入研究APLF的生物学功能和调控机制,有助于揭示疾病的发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wu, Cheng-Kuei, Shiu, Jia-Lin, Wu, Chao-Liang, Liaw, Hungjiun, Su, Wen-Pin. . APLF facilitates interstrand DNA crosslink repair and replication fork protection to confer cisplatin resistance. In Nucleic acids research, 52, 5676-5697. doi:10.1093/nar/gkae211. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38520407/
2. De Bragança, Sara, Aicart-Ramos, Clara, Arribas-Bosacoma, Raquel, Llorca, Oscar, Moreno-Herrero, Fernando. 2022. APLF and long non-coding RNA NIHCOLE promote stable DNA synapsis in non-homologous end joining. In Cell reports, 42, 111917. doi:10.1016/j.celrep.2022.111917. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36640344/
3. Majumder, Aditi, Syed, Khaja Moheiddin, Mukherjee, Ananda, Pillai, Madhavan Radhakrishna, Dutta, Debasree. 2018. Enhanced expression of histone chaperone APLF associate with breast cancer. In Molecular cancer, 17, 76. doi:10.1186/s12943-018-0826-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29580241/
4. Rulten, Stuart L, Fisher, Anna E O, Robert, Isabelle, Reina-San-Martin, Bernardo, Caldecott, Keith W. . PARP-3 and APLF function together to accelerate nonhomologous end-joining. In Molecular cell, 41, 33-45. doi:10.1016/j.molcel.2010.12.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21211721/
5. Nandy, Debparna, Shirude, Mayur Balkrishna, S, Archana, Mukherjee, Ananda, Dutta, Debasree. 2024. Nuclear localization of APLF facilitates breast cancer metastasis. In Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease, 1871, 167537. doi:10.1016/j.bbadis.2024.167537. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39384105/
6. Grundy, Gabrielle J, Rulten, Stuart L, Zeng, Zhihong, Oliver, Antony, Caldecott, Keith W. 2012. APLF promotes the assembly and activity of non-homologous end joining protein complexes. In The EMBO journal, 32, 112-25. doi:10.1038/emboj.2012.304. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23178593/
7. Syed, Khaja Mohieddin, Joseph, Sunu, Mukherjee, Ananda, Dutta, Debasree, Pillai, Madhavan Radhakrishna. 2016. Histone chaperone APLF regulates induction of pluripotency in murine fibroblasts. In Journal of cell science, 129, 4576-4591. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27875275/
8. Iles, Natasha, Rulten, Stuart, El-Khamisy, Sherif F, Caldecott, Keith W. 2007. APLF (C2orf13) is a novel human protein involved in the cellular response to chromosomal DNA strand breaks. In Molecular and cellular biology, 27, 3793-803. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17353262/