Rap2c-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Rap2c-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13815

品系全称

C57BL/6JCya-Rap2cem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-72065-Rap2c-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rap2c-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13815) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RAP2C, member of RAS oncogene family
基因别称
2010200P20Rik
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172413.2 | Ensembl: ENSMUST00000053593
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~2
敲除长度
~2889 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Rap2c,全称为RAS相关蛋白2C,是Ras家族的一个成员。Ras家族是一类小GTP酶,在细胞内信号传导中发挥着至关重要的作用。Rap2c在细胞生长、分化、凋亡等多种细胞功能中起到调节作用。Rap2c基因位于X染色体q26.2区域,其编码的蛋白质包含一个RAS结构域,是一个由552个碱基对编码的183个氨基酸残基的蛋白质。Rap2c在肝脏、骨骼肌、前列腺、子宫、直肠、胃、膀胱等组织中高表达,在脑、肾、胰腺和骨髓中表达较低。当在COS-7细胞中过表达时,Rap2c蛋白定位于细胞质中。在HEK293T细胞中,Rap2c的过表达激活了血清反应元件(SRE)的转录活性,表明Rap2c可能参与了SRE介导的基因转录[1]。

长链非编码RNA(lncRNA)LENOX与RAP2C相互作用,调节代谢并促进黑色素瘤对MAPK抑制剂的耐药性。LENOX在所有已知的黑色素瘤细胞状态中表达,对于黑色素瘤的生存至关重要。LENOX促进了RAP2C GTP酶与线粒体分裂调节因子DRP1的结合,增加了DRP1 S637磷酸化,促进了线粒体融合和氧化磷酸化。LENOX的表达在MAPK抑制剂处理后上调,促进从糖酵解到氧化磷酸化的代谢转变,并赋予对MAPK抑制的耐药性。因此,LENOX和RAP2C的联合沉默与MAPK抑制剂协同作用,可以消除黑色素瘤细胞[2]。

全基因组关联荟萃分析确定了五个与产后出血(PPH)相关的基因位点。功能注释分析表明,在三个位点上有候选基因HAND2、TBX3和RAP2C/FRMD7。在每个位点,相关变异位于孕酮受体结合位点的内。这些变异与出生体重、妊娠持续时间和子宫肌瘤有很强的遗传相关性。早期妊娠出血没有产生全基因组关联信号,但显示出与各种人类特征有很强的遗传相关性,这表明它可能是一种复杂的、多基因的病因。这些结果表明,PPH与孕酮信号传导的失调有关,而早期出血是一种复杂的特征,与潜在的健康状况以及可能的社会经济地位有关,并可能包括尚未被发现的遗传因素[3]。

尽管有证据表明遗传因素会影响妊娠持续时间和早产的风险,但尚未确定与遗传变异的强相关。研究发现,EBF1、EEFSEC、AGTR2和WNT4位点与妊娠持续时间显著相关。功能分析表明,WNT4中一个受影响的变异改变了雌激素受体的结合。在发现集中,ADCY5和RAP2C位点的变异与妊娠持续时间有提示性关联,在复制集中有显著的关联证据;这些变异在联合分析中也显示出全基因组显著性。EBF1、EEFSEC和AGTR2位点的常见变异与早产有显著关联。母亲-婴儿对的分析表明,这些变异作用于母体基因组水平。在这项全基因组关联研究中,发现EBF1、EEFSEC、AGTR2、WNT4、ADCY5和RAP2C位点的变异与妊娠持续时间相关,EBF1、EEFSEC和AGTR2位点的变异与早产相关。这些基因在子宫发育、母体营养和血管控制方面的先前已建立的 roles支持它们在机制上的参与[4]。

在母体血液中,EBF1基因mRNA水平与自发性早产(sPTB)相关。研究发现,在第二或第三孕期中,EBF1 mRNA水平最低的四分位数妇女的sPTB比值比为2.86,第三孕期中为4.43。GSEA分析显示,24个下调的基因集与第二孕期低EBF1 mRNA相关,并部分与之前sPTB相关的基因集相关。这些结果表明,母体血液中EBF1 mRNA水平可能有助于在第二孕期检测sPTB的升高风险。潜在的潜在机制可能涉及母体-胎儿免疫和细胞周期/凋亡途径[5]。

在糖尿病前期大鼠模型中,心脏miRNA表达及其mRNA靶点发生变化。研究发现,糖尿病前期组中存在两种上调和三种下调的miRNA。预测了这五个差异表达miRNA的445个mRNA靶点,并选择了11个mRNA进行验证。在这些靶点中,Jazf1、Zkscan1和Rap2c mRNA的下调得到了验证。这是首次证明糖尿病前期改变了心脏miRNA表达谱。预测的差异表达miRNA的靶点包括Jazf1、Zkscan1和Rap2c mRNA。这些转录组变化可能导致舒张功能障碍,并可能作为药物靶点[6]。

MicroRNA-188-5p通过靶向Rap2c促进乳腺癌细胞凋亡并抑制其增殖。研究发现,乳腺癌组织中miR-188的表达明显降低。miR-188在4T1和MCF-7细胞中的异常过表达显著抑制了细胞增殖和迁移,并增强了细胞凋亡。miR-188诱导细胞周期停滞在G1期。通过生物信息学数据库分析和双荧光素酶实验,Rap2c被筛选为miR-188的单个靶基因。此外,Rap2c被发现是肿瘤进展中促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的分子开关,通过降低凋亡和促进增殖和迁移。这些结果表明,miR-188是一种癌症进展抑制剂,是乳腺癌治疗的有希望的潜在靶点[7]。

MicroRNA-195通过抑制Rap2C蛋白依赖的MAPK信号转导促进小细胞肺癌细胞凋亡。研究发现,miRNA-195在肺癌组织和SCLC细胞中的表达低于正常组织和细胞。miRNA-195的低表达预示着肺癌患者的总生存期减少。进一步的功能获得和功能缺失实验表明,miRNA-195过表达可以显著抑制SCLC细胞增殖并促进细胞凋亡。双荧光素酶实验表明,miRNA-195可以与Rap2C mRNA结合并抑制其表达。Rap2C过表达与肺癌患者的预后较差相关。敲低Rap2C抑制了细胞增殖并加速了细胞凋亡。此外,Rap2C的过表达逆转了miRNA-195诱导的凋亡和增殖抑制。进一步的研究表明,miRNA195通过下调Rap2C抑制了MAPK信号通路的激活。这些结果表明,miRNA-195通过抑制Rap2C蛋白依赖的MAPK信号转导促进SCLC细胞的凋亡并抑制其增殖[8]。

Rap2C是Rap家族的一个新成员,具有独特的GTP结合特性。Rap2C与Rap2A和Rap2B高度同源,可以结合标记的GTP,并被特异性抗Rap2抗体识别,但不会被抗Rap1抗体识别。Rap2C与鸟苷酸的结合需要Mg2+,但其GTP结合效率较低,GDP释放速率较慢。当在真核细胞中表达时,Rap2C定位于质膜上。Rap2C在循环中的单核白细胞中表达量最高,但在血小板中不存在。重要的是,Rap2C在人类巨核细胞中表达,这表明该蛋白可能在血小板生成过程中下调。这项工作表明,Rap2C是Rap2蛋白亚家族的新成员,能够以独特的特性结合鸟苷酸,并在各种造血细胞亚群中不同地表达[9]。

circRNA_100290通过miR-136-5p/RAP2C轴促进喉鳞状细胞癌(LSCC)的进展。研究发现,circRNA_100290在LSCC组织和细胞系中的表达显著上调。circRNA_100290的表达与LSCC患者的TNM分期和淋巴结转移呈正相关。在细胞培养中,circRNA_100290的上调促进了LSCC细胞的增殖、迁移和侵袭,并抑制了细胞凋亡;circRNA_100290的下调产生了相反的效果。在体内,circRNA_100290的过表达显著促进了肿瘤生长。机制上,circRNA_100290可能作为miR-136-5p的海绵,抑制miR-136-5p在LSCC细胞中的作用确实逆转了circRNA_100290下调的效果。RAS癌基因RAP2C被预测为miR-136-5p的靶点,下调RAP2C在LSCC细胞中部分逆转了circRNA_100290过表达或miR-136-5p降低的致癌作用。这些结果表明,circRNA_100290通过靶向miR-136-5p/RAP2C轴促进LSCC的进展,这可能有助于确定潜在的 therapeutic targets[10]。

综上所述,Rap2c在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞生长、分化、凋亡、代谢和肿瘤进展。Rap2c与多种信号通路和基因相互作用,参与调节基因表达和细胞功能。Rap2c的表达和功能异常与多种疾病的发生和发展相关,包括产后出血、早产、糖尿病心肌病、结直肠癌、黑色素瘤、乳腺癌和小细胞肺癌。Rap2c的研究有助于深入理解Ras家族成员在细胞信号传导和疾病发生中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Guo, Zekun, Yuan, Jian, Tang, Wenwen, Wan, Bo, Yu, Long. 2007. Cloning and characterization of the human gene RAP2C, a novel member of Ras family, which activates transcriptional activities of SRE. In Molecular biology reports, 34, 137-44. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17447155/
2. Gambi, Giovanni, Mengus, Gabrielle, Davidson, Guillaume, Leucci, Eleonora, Davidson, Irwin. . The LncRNA LENOX Interacts with RAP2C to Regulate Metabolism and Promote Resistance to MAPK Inhibition in Melanoma. In Cancer research, 82, 4555-4570. doi:10.1158/0008-5472.CAN-22-0959. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36214632/
3. Westergaard, David, Steinthorsdottir, Valgerdur, Stefansdottir, Lilja, Brunak, Søren, Nielsen, Henriette Svarre. 2024. Genome-wide association meta-analysis identifies five loci associated with postpartum hemorrhage. In Nature genetics, 56, 1597-1603. doi:10.1038/s41588-024-01839-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39039282/
4. Zhang, Ge, Feenstra, Bjarke, Bacelis, Jonas, Jacobsson, Bo, Muglia, Louis J. 2017. Genetic Associations with Gestational Duration and Spontaneous Preterm Birth. In The New England journal of medicine, 377, 1156-1167. doi:10.1056/NEJMoa1612665. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28877031/
5. Zhou, Guoli, Holzman, Claudia, Heng, Yujing J, Lye, Stephen J, Vazquez, Ana. 2020. EBF1 Gene mRNA Levels in Maternal Blood and Spontaneous Preterm Birth. In Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.), 27, 316-324. doi:10.1007/s43032-019-00027-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32046385/
6. Sághy, Éva, Vörös, Imre, Ágg, Bence, Schulz, Rainer, Ferdinandy, Péter. 2020. Cardiac miRNA Expression and their mRNA Targets in a Rat Model of Prediabetes. In International journal of molecular sciences, 21, . doi:10.3390/ijms21062128. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32244869/
7. Zhu, Xinying, Qiu, Jinxia, Zhang, Tao, Deng, Ganzhen, Qiu, Changwei. 2019. MicroRNA-188-5p promotes apoptosis and inhibits cell proliferation of breast cancer cells via the MAPK signaling pathway by targeting Rap2c. In Journal of cellular physiology, 235, 2389-2402. doi:10.1002/jcp.29144. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31541458/
8. Tong, Jichun, Lu, Jiawei, Yin, Yajun, Wang, Yeming, Zhang, Ke. . microRNA-195 Promotes Small Cell Lung Cancer Cell Apoptosis via Inhibiting Rap2C Protein-Dependent MAPK Signal Transduction. In Technology in cancer research & treatment, 19, 1533033820977546. doi:10.1177/1533033820977546. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33302819/
9. Paganini, Simona, Guidetti, Gianni Francesco, Catricalà, Silvia, Balduini, Cesare, Torti, Mauro. 2005. Identification and biochemical characterization of Rap2C, a new member of the Rap family of small GTP-binding proteins. In Biochimie, 88, 285-95. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16213650/
10. Wang, Zhenxiao, Huang, Chaoping, Zhang, Aobo, Lu, Cheng, Liu, Liangfa. 2020. Overexpression of circRNA_100290 promotes the progression of laryngeal squamous cell carcinoma through the miR-136-5p/RAP2C axis. In Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie, 125, 109874. doi:10.1016/j.biopha.2020.109874. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32014687/