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Phf10-KO 基因敲除小鼠

Phf10-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Phf10-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13812

品系全称

C57BL/6JCya-Phf10em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-72057-Phf10-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Phf10-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13812) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PHD finger protein 10
基因别称
1810055P05Rik
染色体号
Chr 17 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_024250.4 | Ensembl: ENSMUST00000024657
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~7
敲除长度
~5511 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1919307Mice homozygous for a floxed allele are viable and fertile.
更多信息
PHF10，全称为植物同源结构域10，是SWI/SNF染色质重塑复合物PBAF的特定亚基。PBAF属于染色质重塑复合物家族SWI/SNF，在转录调控中发挥着重要作用。PHF10的表达形式存在四种不同的异构体，这些异构体在结构（DPF结构域的存在与否）和转录调控功能上有所不同。DPF结构域是PHF10亚基中的一个独特结构，与组蛋白修饰的识别有关，它在SWI/SNF依赖的染色质重塑过程中起着重要作用[3]。

在黑色素瘤中，PHF10亚基的水平与疾病进展相关，其表达升高。PHF10与MYC相互作用，促进PBAF复合物向目标基因启动子的招募，从而增强MYC对参与细胞周期进程的基因的转录激活。PHF10或MYC的耗竭导致G1积累和衰老样表型，这表明PHF10在MYC依赖的基因转录和染色质重塑之间起着关键的连接作用[1]。

在胰腺腺癌中，增强子RNA LINC00242诱导PHF10的表达，这与更好的预后相关。LINC00242是一种非编码RNA，来自基因增强子区域，在基因转录调控中起着重要作用。研究发现，LINC00242与PHF10的表达呈显著正相关，且LINC00242的下调与不良的病理特征相关。此外，PHF10的表达在免疫细胞浸润程度高的胰腺腺癌患者中显著上调，表明PHF10可能与免疫反应有关[2]。

PHF10的四种异构体在哺乳动物细胞中均有表达，并且都被广泛磷酸化，其磷酸化水平取决于细胞类型。磷酸化发生在PHF10异构体被整合到PBAF复合物中时，这表明磷酸化可能在调节PBAF复合物的功能和作用机制中起着重要作用[4]。此外，PHF10异构体的磷酸化还决定着它们在细胞中的水平，进而影响PBAF调节的基因模式[7]。

在人类中性粒细胞中，缺乏PHD结构域的PHF10-Ss异构体在PBAF复合物中发挥着重要作用。在骨髓前体细胞中，含有PHD结构域的PHF10异构体与PBAF和聚合酶II一起，与不活跃的中性粒细胞特异性基因的启动子相关。然而，在分化的后期阶段，当这些基因被活跃转录时，PHF10-P异构体被PHF10-S异构体取代。这表明PHD结构域对于PHF10在转录激活过程中的染色质重塑功能至关重要，但对于持续转录的基因则不是必需的[5]。

PHF10在神经系统中也发挥着重要作用。研究发现，PHF10异构体在黑质纹状体系统中的表达及其在周围血淋巴细胞中的比例在早期帕金森病模型小鼠中发生变化。此外，在早期临床阶段的帕金森病患者的外周血淋巴细胞中也观察到了PHF10-S水平的改变。这表明PHF10异构体在帕金森病的发生发展中起着重要作用，并可能作为早期诊断的分子标志物[6]。PHF10还与c-FOS相互作用，在长期增强（LTP）的诱导过程中参与二级响应基因的激活，这表明PHF10可能在神经元突触的可塑性和稳态维持中发挥着重要作用[8]。

PHF10在胃癌中表现出致癌特性，其表达上调与细胞分化水平的降低相关。PHF10通过形成PHF10和E2F1之间的正反馈回路，抑制胃癌细胞的分化并促进其干性。此外，PHF10还通过SWI/SNF复合物的组装介导目标基因DUSP5的转录抑制，导致pERK1/2水平的升高。这些发现揭示了PHF10在胃癌发生发展中通过E2F1-PHF10-DUSP5-pERK1/2信号通路调节分化和干性的重要作用[9]。

PHF10的稳定性受到磷酸化的调节。PHF10异构体包含两个非典型的β-TrCP降解结构域，并通过β-TrCP依赖的方式降解。然而，CK-1对PHF10-S降解结构域的磷酸化阻止了它们的降解。这表明CK-1对PHF10降解结构域的磷酸化可能不仅会降解一组蛋白质，还会稳定另一组不同的目标蛋白质[10]。

综上所述，PHF10是SWI/SNF染色质重塑复合物PBAF的特定亚基，在转录调控中发挥着重要作用。PHF10的表达形式存在四种不同的异构体，这些异构体在结构、功能和磷酸化模式上有所不同。PHF10在多种疾病中发挥重要作用，包括黑色素瘤、胰腺腺癌、帕金森病和胃癌。PHF10的研究有助于深入理解染色质重塑和基因转录调控的机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Soshnikova, N V, Tatarskiy, E V, Tatarskiy, V V, Nikiforov, M A, Georgieva, S G. 2021. PHF10 subunit of PBAF complex mediates transcriptional activation by MYC. In Oncogene, 40, 6071-6080. doi:10.1038/s41388-021-01994-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34465901/
2. Tong, Wen, Zhu, Liuyang, Bai, Yi, Liu, Zirong, Zhang, Yamin. 2022. Enhancer RNA LINC00242-Induced Expression of PHF10 Drives a Better Prognosis in Pancreatic Adenocarcinoma. In Frontiers in oncology, 11, 795090. doi:10.3389/fonc.2021.795090. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35127503/
3. Chugunov, Anton O, Potapova, Nadezhda A, Klimenko, Natalia S, Georgieva, Sofia G, Soshnikova, Nataliya V. 2021. Conserved Structure and Evolution of DPF Domain of PHF10-The Specific Subunit of PBAF Chromatin Remodeling Complex. In International journal of molecular sciences, 22, . doi:10.3390/ijms222011134. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34681795/
4. Brechalov, A V, Valieva, M E, Georgieva, S G, Soshnikova, N V. . [PHF10 isoforms are phosphorylated in the PBAF mammalian chromatin remodeling complex]. In Molekuliarnaia biologiia, 50, 320-6. doi:10.7868/S0026898416010031. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27239853/
5. Viryasova, Galina M, Tatarskiy, Victor V, Sheynov, Andrey A, Georgieva, Sofia G, Soshnikova, Nataliya V. 2019. PBAF lacking PHD domains maintains transcription in human neutrophils. In Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research, 1866, 118525. doi:10.1016/j.bbamcr.2019.118525. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31398409/
6. Soshnikova, N V, Vorob'eva, N E, Kolacheva, A A, Georgieva, S G, Ugrumov, M V. . [Ratio of transcription factor PHF10 splice variants in lymphocytes as a molecular marker of Parkinson's disease]. In Molekuliarnaia biologiia, 50, 695-702. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27668607/
7. Sheynov, Andrey A, Tatarskiy, Victor V, Tatarskiy, Eugene V, Georgieva, Sofia G, Soshnikova, Nataliya V. 2020. The sequential phosphorylation of PHF10 subunit of the PBAF chromatin-remodeling complex determines different properties of the PHF10 isoforms. In Biology open, 9, . doi:10.1242/bio.043943. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31911482/
8. Azieva, A M, Sheynov, A A, Kirillova, D A, Georgieva, S G, Soshnikova, N V. . [PHF10, a Subunit of the PBAF Chromatin Remodeling Complex, Changes Its Localization and Interacts with c-FOS during the Initiation of Long-Term Potentiation in Neuronal Culture]. In Molekuliarnaia biologiia, 55, 1021-1029. doi:10.31857/S0026898421060033. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34837706/
9. Fan, Zhiyuan, Yan, Wenjing, Li, Jianfang, Yang, Zhongyin, Yu, Beiqin. 2024. PHF10 inhibits gastric epithelium differentiation and induces gastric cancer carcinogenesis. In Cancer gene therapy, 31, 1511-1524. doi:10.1038/s41417-024-00820-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39127832/
10. Tatarskiy, Victor V, Simonov, Yuriy P, Shcherbinin, Dmitrii S, Georgieva, Sofia G, Soshnikova, Nataliya V. 2017. Stability of the PHF10 subunit of PBAF signature module is regulated by phosphorylation: role of β-TrCP. In Scientific reports, 7, 5645. doi:10.1038/s41598-017-05944-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28717195/

资料下载

S-KO-13812_6J_72057_Phf10_Exon 2~7_A_strategy.pdf
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