Ddi1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ddi1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13697

品系全称

C57BL/6JCya-Ddi1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-71829-Ddi1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddi1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13697) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DNA-damage inducible 1
基因别称
1700011N24Rik
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_027942.1 | Ensembl: ENSMUST00000051706
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1222 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Ddi1,也称为DNA损伤可诱导1,是一种在真核生物中保守的蛋白质,属于天冬氨酸蛋白酶家族。Ddi1含有多个功能结构域,包括氨基端类似泛素的UBL结构域、羧基端泛素结合的UBA结构域以及一个具有天冬氨酸蛋白酶活性的RVP结构域。Ddi1的UBL结构域能够与泛素链相互作用,而UBA结构域则负责与蛋白酶体结合,使得Ddi1能够将泛素化的底物运输至蛋白酶体进行降解。此外,Ddi1还包含一个保守的螺旋结构域(HDD),其功能尚不明确。

Ddi1在多种生物学过程中发挥重要作用,包括DNA损伤修复、细胞周期调控、蛋白质降解以及应激反应等。Ddi1能够被招募到DNA损伤位点,参与DNA损伤修复过程。研究发现,Ddi1在酵母中能够与Wss1/SPRTN相互作用,共同降解DNA-蛋白质交联(DPC)中的蛋白质部分,从而促进DNA损伤修复[3]。此外,Ddi1还参与了细胞周期调控和蛋白质降解过程。Ddi1能够降解转录因子Nrf1的前体,从而调节蛋白酶体亚基基因的表达[1]。此外,Ddi1还能够降解泛素化的底物蛋白,但在无泛素化的情况下,Ddi1的蛋白酶活性较低。

Ddi1在动物育种和肥胖相关疾病中也具有潜在的应用价值。研究发现,在绵羊前脂肪细胞中,oar-miR-432能够直接靶向Ddi1基因,抑制其表达。Ddi1的敲低能够促进前脂肪细胞分化成脂肪细胞,并抑制oar-miR-432的表达。相反,Ddi1的过表达则抑制了前脂肪细胞的分化,并促进了oar-miR-432的表达[2]。

此外,Ddi1还与HIV蛋白酶抑制剂的作用机制相关。研究发现,HIV蛋白酶抑制剂能够抑制Leishmania寄生虫中的Ddi1样蛋白质,从而降低寄生虫的数量[4]。这表明Ddi1样蛋白质可能是HIV蛋白酶抑制剂的潜在靶点,为抗寄生虫治疗提供新的思路。

综上所述,Ddi1是一种重要的天冬氨酸蛋白酶,参与多种生物学过程,包括DNA损伤修复、细胞周期调控、蛋白质降解以及应激反应等。Ddi1在动物育种和肥胖相关疾病中也具有潜在的应用价值。深入研究Ddi1的功能和作用机制,有助于我们更好地理解细胞的生物学过程,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Yip, Matthew C J, Bodnar, Nicholas O, Rapoport, Tom A. 2020. Ddi1 is a ubiquitin-dependent protease. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117, 7776-7781. doi:10.1073/pnas.1902298117. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32193351/
2. Jin, Meilin, Yuan, Zehu, Li, Taotao, Wang, Huihua, Wei, Caihong. 2023. The Effects of DDI1 on Inducing Differentiation in Ovine Preadipocytes via Oar-miR-432. In International journal of molecular sciences, 24, . doi:10.3390/ijms241411567. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37511326/
3. Serbyn, Nataliia, Noireterre, Audrey, Bagdiul, Ivona, Kornmann, Benoît, Stutz, Françoise. 2020. The Aspartic Protease Ddi1 Contributes to DNA-Protein Crosslink Repair in Yeast. In Molecular cell, 77, 1066-1079.e9. doi:10.1016/j.molcel.2019.12.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31902667/
4. White, Rhian E, Powell, David J, Berry, Colin. 2011. HIV proteinase inhibitors target the Ddi1-like protein of Leishmania parasites. In FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology, 25, 1729-36. doi:10.1096/fj.10-178947. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21266539/