Dhrs13-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Dhrs13-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13347

品系全称

C57BL/6JCya-Dhrs13em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-70451-Dhrs13-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Dhrs13-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13347) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
dehydrogenase/reductase 13
基因别称
2610209N15Rik
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_183286.2 | Ensembl: ENSMUST00000021187
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~574 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Dhrs13(Dehydrogenase/reductase 13)是短链脱氢酶/还原酶(SDR)超家族的一员,SDR超家族是一类广泛存在于生物体内的酶类,参与多种生理过程。Dhrs13在生物体中发挥着重要的生物学功能,包括但不限于参与代谢过程、调节细胞生长和分化、影响免疫反应等。

在肝细胞癌(HCC)的研究中,Dhrs13被发现是一个核心靶标。研究显示,Dhrs13在HCC患者中的表达与预后和凋亡途径相关。一项研究使用UPLC-Q-TOF-MS分析并量化了Sorbaria sorbifolia(SS)样本中的生物活性成分,并通过网络药理学方法确定了SS成分的HCC相关靶标。生物信息学分析表明,Dhrs13在HCC患者中的表达与预后和凋亡途径相关。分子对接揭示了20种有效的SS成分可以与Dhrs13稳定结合,MD模拟和CESTA确定了Quercetin 7-rhamnoside(Q7R)是与Dhrs13结合最稳定的成分。体外和体内实验证实了Q7R的抗HCC特性。慢病毒转染结果显示,敲低Dhrs13导致细胞生长减少和凋亡增加,而Dhrs13过表达则导致细胞生长增加和凋亡减少。实验发现,Q7R作为Dhrs13的抑制剂,可以逆转Dhrs13过表达导致的抑制凋亡和HCC过度增殖。因此,Q7R可能是一种治疗HCC的药物,通过调节Dhrs13来靶向凋亡途径[1]。

在HER2+乳腺癌患者的研究中,Dhrs13也是一个重要的基因。一项研究使用RNA-seq分析确定了HER2+乳腺癌患者中与治疗反应、总体生存期和无病生存期相关的差异表达基因(DEGs)。生存分析显示,12个基因(ATF6B、DHRS13、DIRAS1、ERAL1、GRIN2B、L1CAM、IRX3、PRTFDC1、PBX2、S100B、SLC9A3R2和TNXB)是预测无病生存期的良好指标,8个基因(GNG4、IL22RA2、MICA、S100B、SERPINF2、HLA-A、DIRAS1和TNXB)是预测总体生存期(OS)的良好指标[2]。

在急性心肌梗死(AMI)的研究中,Dhrs13也是一个相关的基因。一项研究确定了与AMI诊断相关的免疫相关基因签名。共获得了304个差异免疫基因,这些基因与免疫反应相关途径密切相关。筛选出的11个基因签名(ADAMTS1、CNN2、DHRS13、DUSP1、FASLG、GNPTAB、NARF、PHC2、RAB7A、VNN3和YIPF3)被确定为AMI的诊断生物标志物。基于诊断模型,高风险和低风险组表现出10种不同的免疫细胞(如T细胞伽马德尔塔、巨噬细胞M0和中性粒细胞)和不同的免疫途径(如抗原处理和呈递和细胞因子受体)。PHC2与中性粒细胞和细胞因子受体呈正相关[3]。

在尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的研究中,Dhrs13的鉴定、表达和进化也得到了研究。全基因组鉴定和综合分析表明,SDR基因在动物中的数量随着全基因组复制(WGD)而增加,这表明SDR在进化过程中有所扩张,尤其是在3R-WGD和硬骨鱼的倍性化中。系统发育分析表明,脊椎动物SDR被分为五个类别:经典、扩展、未定义、非典型和复杂。此外,在分析硬骨鱼时,观察到hpgd-a、rdh8b和dhrs13的串联重复。此外,在所有分析过的丽鱼中,观察到dhrs11-a、dhrs7a、hsd11b1b和cbr1-a的串联重复,以及在tilapiines中观察到rdh10-b的串联重复。成鱼转录组分析显示,93个SDR在多个组织中表达,5个SDR只在1个组织中表达。不同发育阶段的性腺转录组分析显示,17个SDR的表达呈性别二态性,其中11个在卵巢中表达较高,6个在睾丸中表达较高。这些SDR的性别二态性表达通过原位杂交(ISH)和qPCR得到证实,表明它们可能在类固醇生成和性腺分化中发挥作用[4]。

在特发性震颤(ET)的研究中,Dhrs13也是一个相关的基因。一项全基因组关联研究和荟萃分析确定了与ET风险相关的常见遗传因素。共确定了5个独立的基因组显著位点,这些位点与约18%的ET遗传力相关。功能分析发现,在脑半球、小脑和轴突发生途径中存在显著的富集。遗传相关性(r)测量遗传重叠的程度,显示出与帕金森病(r,0.28;P = 2.38 × 10-8)和抑郁症(r,0.12;P = 9.78 × 10-4)的显著常见变异重叠。转录组全基因组关联位点精细映射鉴定了疾病相关脑区域(如小脑)中的基因,如BACE2、LRRN2、DHRS13和LINC00323[5]。

在HCC患者的研究中,Dhrs13也是一个重要的基因。一项研究使用ADME相关基因构建了HCC预后的预测模型。共使用了6个ADME相关基因(CYP2C9、ABCB6、ABCC5、ADH4、DHRS13和SLCO2A1)构建了预测模型,该模型具有良好的预测能力。单样本基因集富集分析(ssGSEA)策略表明,风险签名与免疫状态之间存在显著关系。基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析表明,高风险组和低风险组中差异表达的基因(DEGs)在代谢和细胞周期途径的生物过程(BP)中富集。使用6个ADME相关基因构建了HCC预后的预测模型,该签名可用于提高HCC的诊断、治疗和预后[6]。

综上所述,Dhrs13是一个重要的基因,在多种疾病中发挥着重要作用。Dhrs13与肝细胞癌、乳腺癌、急性心肌梗死和特发性震颤等疾病的发生和发展密切相关。Dhrs13的研究有助于深入理解其在疾病发生机制中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Xu, Zhaohua, Dang, Ying, Chen, Xu, Dong, Yu, Li, Jing. 2024. Quercetin 7-rhamnoside from Sorbaria sorbifolia exerts anti-hepatocellular carcinoma effect via DHRS13/apoptotic pathway. In Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology, 135, 156031. doi:10.1016/j.phymed.2024.156031. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39305745/
2. Barrón-Gallardo, Carlos A, Garcia-Chagollán, Mariel, Morán-Mendoza, Andres J, Aguilar-Lemarroy, Adriana, Jave-Suárez, Luis F. 2022. A gene expression signature in HER2+ breast cancer patients related to neoadjuvant chemotherapy resistance, overall survival, and disease-free survival. In Frontiers in genetics, 13, 991706. doi:10.3389/fgene.2022.991706. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36338974/
3. Zhang, Nan, Zhou, Bingquan, Tu, Su. 2022. Identification of an 11 immune-related gene signature as the novel biomarker for acute myocardial infarction diagnosis. In Genes and immunity, 23, 209-217. doi:10.1038/s41435-022-00183-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36182975/
4. Zhang, Shuai, Xie, Lang, Zheng, Shuqing, Zhou, Linyan, Wang, Deshou. 2021. Identification, Expression and Evolution of Short-Chain Dehydrogenases/Reductases in Nile Tilapia (Oreochromis niloticus). In International journal of molecular sciences, 22, . doi:10.3390/ijms22084201. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33919636/
5. Liao, Calwing, Castonguay, Charles-Etienne, Heilbron, Karl, Dion, Patrick A, Rouleau, Guy A. . Association of Essential Tremor With Novel Risk Loci: A Genome-Wide Association Study and Meta-analysis. In JAMA neurology, 79, 185-193. doi:10.1001/jamaneurol.2021.4781. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34982113/
6. Wang, Jukun, Han, Ke, Zhang, Chao, Zhu, Linzhong, Luo, Tao. . Identification and validation of ADME genes as prognosis and therapy markers for hepatocellular carcinoma patients. In Bioscience reports, 41, . doi:10.1042/BSR20210583. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33988674/