ABHD17C基因编码一种蛋白质去棕榈酰酶,它属于ABHD17家族,这个家族的成员在细胞内蛋白质的去棕榈酰化过程中发挥重要作用。蛋白质的去棕榈酰化是蛋白质翻译后修饰的一种形式,影响蛋白质的定位和功能,进而影响细胞内的信号传导和代谢过程。ABHD17C蛋白能够去除蛋白质上的棕榈酰基团,从而调节蛋白质的稳定性、定位和功能,这在多种生物学过程中起着关键作用。
在胰腺导管腺癌(PDAC)的研究中,ABHD17C基因被发现具有代谢和免疫相关的特性,可以作为预测PDAC患者预后和抗PD1治疗反应的潜在生物标志物。研究通过多中心RNA测序和非负矩阵分解聚类(NMF)方法,识别了一组与代谢相关的基因,这些基因能够有效预测PDAC患者的免疫状态和生存情况。进一步的研究发现,ABHD17C基因在调节PDAC的免疫微环境中发挥着重要作用,它通过体外糖酵解功能实验和体内动物实验,参与了肿瘤细胞的代谢过程,并重塑了免疫抑制微环境,降低了pH值[1]。
除了在PDAC中的研究,ABHD17C基因在其他癌症类型中也有相关的研究。在肺癌腺癌(LUAD)的研究中,ABHD17C基因的表达水平被发现与患者的预后相关。研究显示,ABHD17C基因的高表达与LUAD患者的总生存期较短有关。此外,ABHD17C基因的表达与肿瘤微环境中浸润的免疫细胞相关,包括B细胞、CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞。这表明ABHD17C基因可能参与了LUAD的肿瘤微环境形成和免疫调节[2]。
在口腔癌的研究中,ABHD17C基因也被发现与化疗耐药性相关。研究发现,在化疗耐药性有限的口腔癌细胞系中,ABHD17C基因的表达发生了下调。这表明ABHD17C基因可能参与了口腔癌细胞的化疗耐药性机制[3]。
此外,ABHD17C基因在其他生物学过程中也有研究。研究发现,ABHD17蛋白家族是一类新的蛋白质去棕榈酰酶,它们能够调节N-Ras蛋白的棕榈酰化循环和亚细胞定位。ABHD17蛋白的催化活性对于N-Ras蛋白的去棕榈酰化和再定位到细胞内部膜上至关重要[4]。
综上所述,ABHD17C基因编码的蛋白质去棕榈酰酶在多种生物学过程中发挥重要作用。它参与调节肿瘤细胞的代谢和免疫微环境,与多种癌症类型的预后和治疗反应相关。此外,ABHD17C基因还与口腔癌的化疗耐药性相关,并且对N-Ras蛋白的棕榈酰化循环和亚细胞定位有重要影响。深入研究ABHD17C基因的功能和机制,有助于我们更好地理解肿瘤发生和发展的生物学过程,为癌症的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Zhang, Weihao, Xie, Yongjie, Yu, Xin, Xing, Wenge, Si, Tongguo. 2023. ABHD17C, a metabolic and immune-related gene signature, predicts prognosis and anti-PD1 therapy response in pancreatic cancer. In Discover oncology, 14, 87. doi:10.1007/s12672-023-00690-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37273016/
2. Bian, Jing, Xiong, Wenji, Yang, Zhiguang, Zhang, Yanli, Liu, Chaoying. 2024. Identification and prognostic biomarkers among ZDHHC4/12/18/24, and APT2 in lung adenocarcinoma. In Scientific reports, 14, 522. doi:10.1038/s41598-024-51182-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38177255/
3. Belnap, Conner, Divis, Tyler, Kingsley, Karl, Howard, Katherine M. 2024. Differential Expression of MicroRNA MiR-145 and MiR-155 Downstream Targets in Oral Cancers Exhibiting Limited Chemotherapy Resistance. In International journal of molecular sciences, 25, . doi:10.3390/ijms25042167. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38396844/
4. Lin, David Tse Shen, Conibear, Elizabeth. 2015. ABHD17 proteins are novel protein depalmitoylases that regulate N-Ras palmitate turnover and subcellular localization. In eLife, 4, e11306. doi:10.7554/eLife.11306. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26701913/