Vps36-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Vps36-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13272

品系全称

C57BL/6JCya-Vps36em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-70160-Vps36-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Vps36-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13272) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
vacuolar protein sorting 36
基因别称
1700010A24Rik,2210415M20Rik,2810408E15Rik,Eap45
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_027338.2 | Ensembl: ENSMUST00000033866
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~3447 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Vps36,也称为Vacuolar Protein Sorting 36,是一种重要的蛋白质,属于ESCRT-II复合物的一个组成部分。ESCRT-II复合物是一类在真核细胞中负责细胞内蛋白质分选和运输的复合物,主要参与将泛素化的细胞膜蛋白转运至多泡体(multivesicular bodies, MVBs)和溶酶体进行降解。Vps36具有泛素结合活性,在ESCRT-II复合物中与VPS22和VPS25相互作用,形成功能性的ESCRT-II复合物。在植物中,Vps36对于细胞膜蛋白的降解和液泡的发生起着关键作用[3]。

Vps36在人类和其他灵长类动物中存在结构差异,这些差异可能是由于进化过程中结构变异的结果。例如,在灵长类基因组中,Vps36所在的区域存在大量的结构变异,这些变异可能导致了基因的丢失和新的基因的产生,如CKAP2、VPS36、ACBD7和NEK5的旁系同源基因[1]。这些基因在进化过程中可能受到了正向选择,对灵长类的适应性和生存能力产生了重要的影响。

在人类疾病中,Vps36的突变与多种疾病的发生有关。例如,在沙特阿拉伯的一项研究中,Vps36基因的突变与遗传性疾病的发生有关,包括智力障碍和早期痴呆[2]。此外,在前列腺癌中,Vps36的表达水平与疾病的进展和预后相关。在前列腺癌组织中,Vps36的表达水平显著降低,尤其是在去势抵抗性肿瘤中。Vps36的敲低会导致RAB27A和RAB27B的表达增加,并减少肿瘤细胞的集落形成和增加细胞外颗粒的释放[7]。

在植物中,Vps36对于细胞膜蛋白的降解和液泡的发生也起着关键作用。在拟南芥中,Vps36的突变会导致胚胎发育延迟、根伸长缺陷和子叶扩张受限。Vps36突变体的细胞内存在异常的细胞器,其中包括多种膜转运蛋白。Vps36对于形成多泡体和液泡的发生对于蛋白质的降解至关重要[3]。

此外,Vps36还与植物的根向重力反应有关。在拟南芥中,Vps36的RNAi敲低会导致PIN FORMED1(PIN1)在细胞内的积累,并减少根的长度和植株的高度。在根向重力刺激后,Vps36敲低植物的根不会像野生型植物那样弯曲。这表明Vps36可能参与了植物对重力的响应,可能与生长素的运输有关[4]。

Vps36还与病毒复制有关。在猪流行性腹泻病毒(PEDV)中,ORF3蛋白与细胞内的Vps36蛋白相互作用,抑制了病毒的复制。Vps36与ORF3的相互作用导致PEDV复制受到抑制,并且ORF3蛋白的表达水平也降低了。此外,通过siRNA干扰Vps36的表达可以部分增强PEDV的复制[5]。

在酵母中,Vps36与PAF1复合物的基因之间存在复杂的相互作用。Vps36的RNA水平受到PAF1复合物所有成分的正向调节。此外,Vps36与CDC73基因之间存在相邻基因效应,并且Vps36的缺失与cdc73Δ、paf1Δ或ctr9Δ之间存在合成病态。这些结果表明,Vps36与PAF1复合物之间存在复杂的相互作用,影响细胞存活和端粒功能[6]。

Vps36还参与了Hedgehog信号通路中的Smoothened(Smo)蛋白的转运。在果蝇中,Vps36通过识别Smo蛋白上的泛素信号,在Hedgehog信号通路缺失的情况下,调节Smo蛋白在细胞质和细胞膜之间的转运。这表明Vps36在Hedgehog信号通路中发挥着重要的作用[8]。

最后,Vps36还与淀粉样蛋白的形成有关。在酵母模型系统中,姜黄素可以抑制Vps36的表达,从而防止多谷氨酰胺聚合物的形成。此外,姜黄素还可以破坏已经形成的多谷氨酰胺聚合物,并治愈酵母中的prion [PSI(+)]。这表明Vps36在淀粉样蛋白的形成和清除中发挥着重要的作用[9]。

综上所述,Vps36是一种重要的蛋白质,在真核细胞中参与细胞内蛋白质分选、运输和降解。Vps36在人类和其他灵长类动物中存在结构差异,这些差异可能是由于进化过程中结构变异的结果。Vps36的突变与多种疾病的发生有关,包括智力障碍、早期痴呆和前列腺癌。在植物中,Vps36对于细胞膜蛋白的降解和液泡的发生起着关键作用,并参与了植物对重力的响应。此外,Vps36还与病毒复制、Hedgehog信号通路和淀粉样蛋白的形成有关。Vps36的研究有助于深入理解细胞内蛋白质分选、运输和降解的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Mao, Yafei, Harvey, William T, Porubsky, David, Carbone, Lucia, Eichler, Evan E. 2024. Structurally divergent and recurrently mutated regions of primate genomes. In Cell, 187, 1547-1562.e13. doi:10.1016/j.cell.2024.01.052. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38428424/
2. Monies, Dorota, Abouelhoda, Mohamed, AlSayed, Moeenaldeen, Meyer, Brian F, Alkuraya, Fowzan S. 2017. The landscape of genetic diseases in Saudi Arabia based on the first 1000 diagnostic panels and exomes. In Human genetics, 136, 921-939. doi:10.1007/s00439-017-1821-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28600779/
3. Wang, Huei-Jing, Hsu, Ya-Wen, Guo, Cian-Ling, Jiang, Liwen, Jauh, Guang-Yuh. 2016. VPS36-Dependent Multivesicular Bodies Are Critical for Plasmamembrane Protein Turnover and Vacuolar Biogenesis. In Plant physiology, 173, 566-581. doi:10.1104/pp.16.01356. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27879389/
4. Hsu, Ya-Wen, Jauh, Guang-Yuh. . VPS36-Mediated plasma membrane protein turnover is critical for Arabidopsis root gravitropism. In Plant signaling & behavior, 12, e1307495. doi:10.1080/15592324.2017.1307495. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28340324/
5. Kaewborisuth, Challika, Yingchutrakul, Yodying, Roytrakul, Sittiruk, Jongkaewwattana, Anan. 2019. Porcine Epidemic Diarrhea Virus (PEDV) ORF3 Interactome Reveals Inhibition of Virus Replication by Cellular VPS36 Protein. In Viruses, 11, . doi:10.3390/v11040382. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31022991/
6. Rodrigues, Joana, Lydall, David. 2018. Cis and trans interactions between genes encoding PAF1 complex and ESCRT machinery components in yeast. In Current genetics, 64, 1105-1116. doi:10.1007/s00294-018-0828-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29564528/
7. Worst, Thomas Stefan, Meyer, Yannic, Gottschalt, Maria, Michel, Maurice Stephan, Erben, Philipp. 2017. RAB27A, RAB27B and VPS36 are downregulated in advanced prostate cancer and show functional relevance in prostate cancer cells. In International journal of oncology, 50, 920-932. doi:10.3892/ijo.2017.3872. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28197629/
8. Yang, Xiaofeng, Mao, Feifei, Lv, Xiangdong, Zhang, Lei, Zhao, Yun. 2013. Drosophila Vps36 regulates Smo trafficking in Hedgehog signaling. In Journal of cell science, 126, 4230-8. doi:10.1242/jcs.128603. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23843610/
9. Verma, Meenakshi, Sharma, Abhishek, Naidu, Swarna, Kukreti, Ritushree, Taneja, Vibha. 2012. Curcumin prevents formation of polyglutamine aggregates by inhibiting Vps36, a component of the ESCRT-II complex. In PloS one, 7, e42923. doi:10.1371/journal.pone.0042923. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22880132/