Trnp1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Trnp1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13095

品系全称

C57BL/6JCya-Trnp1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-69539-Trnp1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Trnp1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13095) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TMF1-regulated nuclear protein 1
基因别称
2300002D11Rik,Trnp
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081156 | Ensembl: ENSMUST00000125541
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Trnp1,也称为TMF-1(TATA元件调控因子)调控蛋白1,是一种在哺乳动物脑中表达的DNA相关蛋白,对大脑皮层的扩张和折叠起着关键作用。Trnp1基因位于狗的第2号染色体上,其编码的蛋白质在神经干细胞的自我更新和脑皮层扩张过程中发挥重要作用。Trnp1的表达水平与大脑皮层的折叠程度有关,高水平表达促进神经干细胞的自我更新和脑皮层的切向扩张,而低水平表达则促进脑皮层的径向扩张,导致脑皮层的折叠[5]。

在哺乳动物大脑的进化过程中,大脑皮层体积的显著增加是大脑复杂性的一个关键特征。Trnp1作为大脑皮层扩张和折叠的调控因子,其表达水平在人类胎儿大脑皮层中存在区域差异,这表明Trnp1的表达水平对于预测大脑皮层是进行径向扩张还是切向扩张具有重要意义[5]。此外,Trnp1的表达还受到组蛋白乙酰化水平的调控,组蛋白H3K9乙酰化水平的升高可以促进Trnp1的表达,进而促进脑皮层的扩张[7]。

在狗的驯化过程中,大脑皮层的折叠程度增加,这与Trnp1基因的遗传变异有关。研究表明,狗的Trnp1基因中存在多个遗传多态性,其中一些多态性可能影响Trnp1的功能,例如,Trnp1启动子和3'非翻译区中的多态性可能影响转录抑制因子和miRNA的结合,从而影响Trnp1的表达水平[1]。此外,狗的Trnp1基因中还存在一个编码多聚丙氨酸扩张的缺失变异,这一变异在其他物种中并不存在,表明狗的Trnp1基因在进化过程中发生了独特的变异[1]。

除了在大脑皮层扩张和折叠中的作用外,Trnp1还在视网膜中表达,并标记了双极神经元亚群。双极神经元是视网膜中的一种 interneurons,它们在视觉信号传递中发挥着重要作用。研究表明,Trnp1在所有ON型双极神经元中表达,而在ON型双极神经元中,Trnp1的表达与视网膜发育的早期阶段有关[2]。此外,Trnp1的表达还与视网膜中双极神经元的亚型命运选择、分化和生理功能有关[2]。

Trnp1在乳腺癌中也发挥重要作用。研究表明,哺乳期猕猴(Macaca mulatta)的婴儿中,Trnp1基因在雌性婴儿中高表达,而在雄性婴儿中低表达。这表明Trnp1基因的表达可能受到性别的调控,并在哺乳期婴儿的生长和发育中发挥重要作用[3]。

Trnp1在肝癌中也具有潜在的临床应用价值。研究表明,肝癌患者中Trnp1基因的表达水平与临床预后、免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性相关。此外,基于Trnp1和其他几个基因构建的四基因签名模型可以预测肝癌患者的临床预后,并可能有助于个体化治疗的监测[4]。此外,肝癌患者中Trnp1的表达水平与脂肪酸代谢相关,表明Trnp1可能参与了肝癌的发生和发展[6]。

综上所述,Trnp1是一种重要的DNA相关蛋白,对大脑皮层的扩张和折叠、视网膜中双极神经元的发育和肝癌的发生和发展都具有重要意义。Trnp1的研究有助于深入理解大脑发育和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Sacco, James C, Starr, Emma, Weaver, Alyssa, Dietz, Rachel, Spocter, Muhammad A. 2023. Resequencing of the TMF-1 (TATA Element Modulatory Factor) regulated protein (TRNP1) gene in domestic and wild canids. In Canine medicine and genetics, 10, 10. doi:10.1186/s40575-023-00133-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37968761/
2. Park, Ko Uoon, Randazzo, Grace, Jones, Kenneth L, Brzezinski, Joseph A. . Gsg1, Trnp1, and Tmem215 Mark Subpopulations of Bipolar Interneurons in the Mouse Retina. In Investigative ophthalmology & visual science, 58, 1137-1150. doi:10.1167/iovs.16-19767. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28199486/
3. Lan, Yue, Wang, Jiao, Yang, Qiao, Yue, Bi-Song, Fan, Zhen-Xin. . Blood transcriptome analysis reveals gene expression features of breast-feeding rhesus macaque ( Macaca mulatta) infants. In Zoological research, 41, 431-436. doi:10.24272/j.issn.2095-8137.2020.044. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32400975/
4. Liu, Jun, Zhang, Shan-Qiang, Chen, Jing, Xie, Chongwei, Li, Ji-Cheng. 2021. Identifying Prognostic Significance of RCL1 and Four-Gene Signature as Novel Potential Biomarkers in HCC Patients. In Journal of oncology, 2021, 5574150. doi:10.1155/2021/5574150. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34257652/
5. Stahl, Ronny, Walcher, Tessa, De Juan Romero, Camino, Borrell, Víctor, Götz, Magdalena. . Trnp1 regulates expansion and folding of the mammalian cerebral cortex by control of radial glial fate. In Cell, 153, 535-49. doi:10.1016/j.cell.2013.03.027. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23622239/
6. Ren, Zhixuan, Gao, Duan, Luo, Yue, Li, Aimin, Liu, Xinhui. 2023. Identification of fatty acid metabolism-related clusters and immune infiltration features in hepatocellular carcinoma. In Aging, 15, 1496-1523. doi:10.18632/aging.204557. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36881382/
7. Kerimoglu, Cemil, Pham, Linh, Tonchev, Anton B, Fischer, Andre, Tuoc, Tran. 2021. H3 acetylation selectively promotes basal progenitor proliferation and neocortex expansion. In Science advances, 7, eabc6792. doi:10.1126/sciadv.abc6792. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34524839/