Polr2d-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Polr2d-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-13003

品系全称

C57BL/6JCya-Polr2dem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-69241-Polr2d-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Polr2d-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-13003) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide D
基因别称
2310002G05Rik,2610028L19Rik,HSRBP4,RBP4
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_027002 | Ensembl: ENSMUST00000025106
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~4
敲除长度
~7.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Polr2d,也称为RNA聚合酶II亚基D,是RNA聚合酶II(pol II)的一个核心亚基,负责参与RNA的合成过程。Pol II是转录过程中的一种关键酶,它负责将DNA模板上的信息转录成RNA,进而指导蛋白质的合成。Polr2d与另一个亚基Rpb4形成一个可分离的复合物,这个复合物在RNA的合成和调节中发挥重要作用[1,4]。Polr2d的功能研究主要集中在酵母中,发现它主要参与pol II介导的RNA合成,并在mRNA的调节过程中发挥作用,包括前mRNA的剪接、mRNA的核输出以及mRNA的降解等。虽然Rpb4在从酵母到人类的进化过程中高度保守,但在芽殖酵母S. cerevisiae中并非生存所必需,而在裂殖酵母S. pombe、粘菌和果蝇中却是必不可少的。为了阐明Rpb4/Polr2d是否对脊椎动物的发育和生存至关重要,研究人员生成了polr2d基因缺失的斑马鱼。结果显示,polr2d突变胚胎在受精后11小时出现体节形成延迟,随后在15小时出现细胞死亡增加,48小时时表现出小眼睛和心脏水肿等发育不全症状,并在60小时时提前死亡。这些发育缺陷与突变体中管家基因和合子基因的表达减少一致。因此,研究结果表明Rpb4/Polr2d对于脊椎动物的发育是不可或缺的[1]。

除了在脊椎动物发育中的作用,Polr2d还在癌症中发挥重要作用。在一项泛癌症整合生物信息学分析中,研究人员对34个RNA聚合酶亚基(RNAPS)进行了研究,发现Polr2d是多个癌症中普遍过表达和预后相关的基因。Polr2d的敲低实验也表明,其表达减少会导致细胞增殖减少。Polr2d主要与RNA pol II转录基因的转录相关,这表明其在癌症中具有独特的功能[2]。

此外,Polr2d还与结直肠癌的预后相关。研究人员通过分析结肠腺癌患者的基因表达谱,发现包括Polr2d在内的16个代谢基因可以作为潜在的生物标志物,用于预测患者的生存预后。基于这些代谢基因的表达建立的预后模型可以有效地预测结直肠癌患者的预后[3]。

在卵巢癌中,Polr2d也被证明与预后相关。研究人员发现,基于Polr2d等7个基因的风险评分可以有效地预测高级别浆液性卵巢癌患者的预后。根据风险评分,患者被分为高风险组和低风险组,两组的总体生存率存在显著差异。此外,基因集富集分析显示,高风险组中的基因在癌症相关通路中显著富集,如MAPK信号通路、mTOR信号通路和VEGF信号通路等。因此,基于Polr2d等基因的风险评分可以作为一种新的分子标志物,用于预测卵巢癌的预后,并指导治疗策略[5]。

除了在癌症中的作用,Polr2d还与小鼠卵母细胞的成熟相关。研究发现,Polr2d基因敲低会导致卵母细胞成熟率降低,并抑制ERK1/2的磷酸化,进而阻断MAPK信号通路。此外,Polr2d基因敲低或U0126处理还会导致卵母细胞在减数分裂I期(MI)时发生微管组装异常。因此,Polr2d在卵母细胞的成熟过程中发挥重要作用[6]。

在胶质母细胞瘤中,Polr2d也被发现与预后相关。研究人员发现,Polr2d的表达与患者的生存时间相关,且与治疗反应相关。Polr2d的表达水平在不同种族和性别的患者中存在差异。此外,Polr2d的表达还与细胞周期、衰老、形态发生和对外界刺激的反应等生物学过程相关[7]。

综上所述,Polr2d作为一种RNA聚合酶II亚基,在脊椎动物的发育、癌症的预后以及卵母细胞的成熟过程中发挥重要作用。Polr2d的表达异常可能导致多种疾病的发生和发展。Polr2d的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Maeta, Masanari, Kataoka, Miku, Nishiya, Yusuke, Kashima, Makoto, Hirata, Hiromi. 2020. RNA polymerase II subunit D is essential for zebrafish development. In Scientific reports, 10, 13213. doi:10.1038/s41598-020-70110-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32764610/
2. Bhandari, Nikita, Acharya, Disha, Chatterjee, Annesha, Malakar, Pushkar, Shukla, Sudhanshu K. 2023. Pan-cancer integrated bioinformatic analysis of RNA polymerase subunits reveal RNA Pol I member CD3EAP regulates cell growth by modulating autophagy. In Cell cycle (Georgetown, Tex.), 22, 1986-2002. doi:10.1080/15384101.2023.2265676. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37795959/
3. Zhao, Fuqiang, Liu, Yanlong, Gu, Xinyue, Song, Chengxin, Cui, Binbin. . Identification of sixteen metabolic genes as potential biomarkers for colon adenocarcinoma. In Journal of B.U.ON. : official journal of the Balkan Union of Oncology, 26, 1252-1259. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34564978/
4. Ryu, Jihye, Lee, Chaeyoung. . RNA Polymerase Subunits and Ribosomal Proteins: An Overview and Their Genetic Impact on Complex Human Traits. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 29, 185. doi:10.31083/j.fbl2905185. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38812329/
5. Dai, Danian, Li, Qiang, Zhou, Pengfei, Wu, Hongmei, Chen, Bo. 2022. Analysis of Omics Data Reveals Nucleotide Excision Repair-Related Genes Signature in Highly-Grade Serous Ovarian Cancer to Predict Prognosis. In Frontiers in cell and developmental biology, 10, 874588. doi:10.3389/fcell.2022.874588. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35769257/
6. An, Quanli, Sun, Hongzheng, Zhang, Jun, Zhang, Yong, Su, Jianmin. 2020. Methionine Adenosyltransferase 2β Participates in Mouse Oocyte Maturation by Regulating the MAPK Pathway. In Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.), 27, 163-171. doi:10.1007/s43032-019-00015-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32046373/
7. Serão, Nicola V L, Delfino, Kristin R, Southey, Bruce R, Beever, Jonathan E, Rodriguez-Zas, Sandra L. 2011. Cell cycle and aging, morphogenesis, and response to stimuli genes are individualized biomarkers of glioblastoma progression and survival. In BMC medical genomics, 4, 49. doi:10.1186/1755-8794-4-49. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21649900/